Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  113  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32318179--32318217
6
6.3
6
82
5
51
15
5
0
79
0.90
32344147--32344216
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
32349908--32350043
29
4.7
29
86
3
157
24
30
15
29
1.95
32349883--32350042
58
2.8
58
81
0
176
23
33
15
27
1.95
32355884--32356019
29
4.7
29
86
3
157
24
30
15
29
1.95
32355859--32356018
58
2.8
58
81
0
176
23
33
15
27
1.95
32361035--32361104
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
32369856--32370156
56
5.4
56
82
7
337
34
23
14
27
1.94
32369856--32370139
108
2.6
108
86
3
372
34
23
14
27
1.94
32370101--32370371
43
6.3
43
86
0
335
30
25
15
27
1.96
32375597--32375751
42
3.7
42
74
10
138
24
16
25
32
1.96
32377284--32377323
9
4.4
9
81
12
55
77
0
10
12
0.99
32377284--32377323
17
2.2
18
86
8
55
77
0
10
12
0.99
32381125--32381343
46
4.8
44
74
14
158
26
20
28
24
1.99
32381130--32381435
47
6.6
45
75
11
208
29
19
27
22
1.98
32381169--32381439
47
5.8
48
76
12
215
29
19
27
22
1.98
32387501--32387548
23
2.1
23
96
0
87
43
16
4
35
1.67
32387616--32387646
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
32387613--32387652
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
32387838--32388030
49
3.7
54
83
6
195
22
23
17
36
1.95
32387885--32388043
55
3.0
53
79
5
167
23
24
15
36
1.94
32393198--32393256
30
2.0
30
86
0
82
38
8
27
25
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32393693--32393988
50
5.9
50
73
6
231
27
19
22
30
1.98
32393692--32393993
151
2.0
151
91
1
489
27
18
22
30
1.98
32395270--32395441
46
3.7
46
72
16
156
22
16
29
31
1.96
32395264--32395433
93
1.8
93
87
2
252
22
18
28
30
1.97
32396737--32396832
50
1.9
50
91
0
156
28
18
26
27
1.98
32402766--32402812
19
2.3
20
82
10
60
36
0
14
48
1.44
32403167--32403393
50
4.5
50
72
7
217
27
17
23
31
1.97
32405642--32405900
27
9.6
27
85
0
329
39
18
8
32
1.82
32405642--32405949
81
3.8
81
84
3
361
39
19
9
32
1.83
32405885--32405945
27
2.3
27
88
0
95
39
19
9
31
1.84
32405994--32407183
27
44.3
27
87
2
1626
35
20
20
24
1.96
32407531--32407589
22
2.7
22
81
5
66
20
25
22
32
1.98
32407748--32407813
27
2.4
27
80
5
80
19
22
22
34
1.96
32407956--32408055
6
16.3
6
77
15
98
18
18
15
49
1.81
32407956--32408035
31
2.6
31
93
0
133
17
18
16
47
1.83
32410000--32410193
27
7.2
27
81
2
212
39
18
8
34
1.81
32410000--32410193
81
2.4
81
84
2
248
39
18
8
34
1.81
32410157--32410220
26
2.4
27
84
7
87
37
17
10
34
1.85
32410134--32410229
26
3.6
25
72
17
70
40
18
9
31
1.83
32410213--32410284
27
2.7
27
76
4
83
38
26
6
27
1.82
32410269--32411494
27
45.3
27
81
6
1320
35
19
20
24
1.96
32410654--32410691
18
2.2
18
95
4
69
31
15
26
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32410764--32411077
118
2.7
118
84
5
371
37
18
21
23
1.94
32410961--32411195
118
2.0
118
86
5
332
36
17
22
23
1.95
32411042--32411114
37
2.0
37
88
0
110
39
16
23
20
1.92
32410988--32411168
91
2.0
91
87
2
265
37
17
22
23
1.94
32411785--32411825
20
2.0
20
90
0
64
12
12
31
43
1.79
32411842--32411900
22
2.7
22
81
5
66
20
27
22
30
1.98
32412066--32412123
27
2.1
27
81
6
64
18
22
24
34
1.96
32412266--32412344
31
2.5
31
85
4
106
20
17
12
49
1.79
32412295--32412353
6
9.7
6
75
17
59
18
18
15
47
1.83
32417194--32417387
40
4.9
40
86
8
240
26
20
26
26
1.99
32417194--32417415
40
5.7
40
85
8
237
26
20
26
26
1.99
32417194--32417394
77
2.6
78
80
13
252
26
20
26
25
1.99
32417201--32417438
79
3.0
79
79
11
217
28
19
25
26
1.99
32421441--32421601
29
5.6
29
88
1
216
26
32
16
24
1.96
32422806--32422863
19
3.0
19
75
12
55
12
17
1
68
1.28
32422795--32422847
20
2.8
20
81
13
58
5
15
1
77
1.04
32429439--32429540
29
3.6
28
77
5
89
25
32
17
24
1.97
32430733--32430801
19
3.8
18
75
17
54
10
15
1
72
1.18
32435353--32435617
23
11.5
23
82
4
293
22
20
25
31
1.98
32442422--32442448
13
2.1
13
100
0
54
14
22
40
22
1.90
32444852--32445014
46
3.5
46
77
14
199
30
28
19
22
1.98
32444857--32445026
93
1.8
92
93
3
297
28
28
20
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32451752--32451837
37
2.3
35
92
7
136
26
33
18
20
1.96
32458081--32458241
29
5.6
29
82
2
182
25
32
16
24
1.96
32463786--32463946
29
5.6
29
79
2
155
24
32
17
25
1.97
32468199--32468369
46
3.7
46
75
13
179
22
19
28
30
1.98
32469753--32469900
48
3.1
47
79
5
163
27
22
22
27
2.00
32474050--32474107
25
2.3
25
85
11
75
65
1
12
20
1.34
32483734--32484099
47
7.8
46
72
14
223
22
27
21
28
1.99
32483734--32484092
94
3.8
94
78
7
347
22
27
20
28
1.99
32492232--32492319
28
3.1
29
85
8
119
23
13
30
31
1.93
32499748--32499783
16
2.2
16
90
0
54
58
16
11
13
1.63
32500019--32500086
28
2.4
29
80
7
77
26
16
30
26
1.96
32502837--32503016
48
3.9
48
75
12
178
25
21
25
27
1.99
32505045--32505223
40
4.5
40
88
5
222
25
22
26
25
2.00
32506953--32507115
81
2.0
81
98
0
317
38
6
26
28
1.80
32511904--32512169
46
5.7
49
79
9
229
28
19
29
22
1.98
32527470--32527642
46
3.8
46
79
15
198
21
20
29
28
1.98
32530570--32530639
15
4.7
15
78
8
81
11
17
12
58
1.63
32530561--32530638
29
2.7
29
80
9
86
11
15
15
57
1.65
32533033--32533208
46
3.8
45
81
10
221
21
21
28
28
1.98
32533029--32533200
93
1.8
93
96
0
317
21
21
29
27
1.99
32539812--32539983
93
1.8
93
92
2
292
27
28
22
21
1.99
32539813--32539980
46
3.6
46
78
12
191
28
27
22
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32542369--32542423
15
3.7
15
90
4
94
60
10
16
12
1.60
32545346--32545515
93
1.8
91
91
2
277
27
28
21
22
1.99
32545339--32545512
47
3.8
46
78
12
187
28
28
20
21
1.98
32545387--32545531
46
3.1
45
73
19
138
28
27
20
23
1.99
32547388--32547421
17
2.0
17
88
11
52
14
26
41
17
1.88
32547669--32547720
27
1.9
27
84
7
70
28
21
21
28
1.98
32552761--32552983
47
4.8
47
78
11
205
26
29
17
25
1.98
32552760--32552974
94
2.3
91
81
10
233
26
29
17
26
1.97
32556134--32556250
31
3.8
31
85
5
166
25
26
16
31
1.96
32556469--32556538
25
2.8
25
93
0
113
24
22
25
27
2.00
32556753--32556788
18
2.0
18
94
0
63
25
27
25
22
2.00
32556788--32556861
27
2.7
27
97
0
139
28
21
16
33
1.95
32560294--32560322
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
32560415--32560487
29
2.5
29
90
0
92
24
32
16
26
1.96
32561972--32562046
31
2.4
31
86
6
107
30
18
28
22
1.97
32562123--32562284
42
3.5
47
77
12
151
29
12
28
29
1.94
32562154--32562259
49
2.2
48
89
3
158
29
11
28
31
1.91
32562215--32562331
42
2.8
42
81
5
155
29
13
29
27
1.94
32563133--32563201
27
2.6
27
100
0
138
21
20
24
33
1.97
32563189--32563290
27
3.8
27
83
6
100
29
9
21
39
1.85
32563220--32563348
27
4.8
27
83
0
105
32
7
20
38
1.82
32563309--32563573
27
9.8
27
88
1
352
39
7
23
29
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
32563309--32563573
81
3.3
81
90
1
415
39
7
23
29
1.83
32565826--32565942
31
3.8
31
82
1
137
27
25
15
31
1.96
32566154--32566205
25
2.1
25
85
3
70
28
19
17
34
1.94
32566161--32566230
25
2.8
25
82
0
77
25
22
22
28
1.99
32566435--32566562
27
4.7
27
87
3
168
25
22
18
32
1.97
32566435--32566562
54
2.4
54
89
2
186
25
22
18
32
1.97
32568579--32568690
31
3.5
31
77
11
111
33
16
26
23
1.96
32568721--32568929
47
4.5
46
81
7
185
28
13
27
30
1.94
32568767--32568929
49
3.5
48
86
8
198
28
13
28
30
1.94
32568810--32568973
42
3.7
43
82
9
163
28
13
27
30
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770