Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  326  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99872126--99872290
40
4.2
40
78
5
149
23
27
23
26
2.00
99872142--99872289
78
1.9
77
83
6
192
22
27
23
25
2.00
99879927--99880029
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
99887840--99887942
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
99903066--99903120
27
2.0
27
85
0
74
40
7
3
49
1.48
99903130--99903163
17
2.0
17
88
11
52
82
0
0
17
0.67
99904689--99904767
36
2.1
38
90
9
126
37
8
16
36
1.80
99904689--99904767
19
4.2
19
90
9
126
37
8
16
36
1.80
99906477--99906777
41
7.4
41
90
2
448
34
23
23
18
1.96
99906935--99906974
14
2.9
14
88
0
53
30
0
22
47
1.52
99907850--99907881
15
2.1
15
94
0
55
59
0
9
31
1.29
99909438--99909497
9
6.7
9
73
7
50
25
3
26
45
1.69
99909463--99909502
6
6.7
6
85
0
53
22
2
30
45
1.66
99911307--99911555
131
1.9
131
97
0
471
20
10
18
50
1.76
99913619--99913658
21
1.9
21
94
0
71
30
10
12
47
1.74
99919800--99919847
21
2.3
21
92
0
78
25
16
56
2
1.51
99920145--99920231
43
2.0
43
93
0
147
32
18
21
27
1.97
99920241--99920364
43
2.9
43
86
2
160
30
16
21
31
1.95
99920233--99920426
43
4.5
43
80
6
153
24
17
24
32
1.97
99922344--99922945
44
13.7
44
85
0
729
25
24
16
32
1.96
99922344--99922943
88
6.8
88
89
1
808
25
24
16
32
1.96
99923790--99923893
55
1.9
53
82
3
127
13
28
17
40
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99930940--99931147
40
5.2
39
82
3
202
25
25
23
25
2.00
99930940--99931146
80
2.6
80
82
3
238
25
26
23
25
2.00
99935778--99935821
19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
99936417--99936472
24
2.5
22
76
20
62
1
28
0
69
0.98
99941720--99941809
17
5.8
16
75
14
66
63
1
4
31
1.21
99956471--99956508
18
2.1
18
85
9
51
42
0
2
55
1.14
99961831--99961903
35
2.1
35
94
0
128
32
13
35
17
1.89
99961964--99962160
59
3.3
59
84
2
243
25
16
20
37
1.93
99961987--99962162
30
5.9
30
83
1
194
25
14
22
37
1.92
99964118--99964220
29
3.6
27
78
5
89
28
32
16
23
1.96
99965527--99965564
20
2.1
19
85
14
53
7
15
0
76
1.01
99971845--99971910
29
2.3
29
86
0
87
28
31
15
24
1.95
99974464--99974647
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
99982554--99982737
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
99993254--99993350
41
2.4
41
89
3
151
20
30
16
31
1.95
99996582--99996645
33
2.0
32
84
3
83
20
25
20
34
1.96
99996607--99996666
27
2.3
26
85
2
75
21
23
20
35
1.96
100003645--100003695
27
1.9
26
84
4
66
19
27
17
35
1.94
100003735--100003794
27
2.3
27
85
2
77
21
23
20
35
1.96
100008445--100008560
12
9.7
12
82
0
115
72
4
6
16
1.23
100008445--100008560
6
19.3
6
84
0
97
72
4
6
16
1.23
100009764--100009788
13
1.9
13
100
0
50
64
0
32
4
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100013605--100013828
40
5.6
40
83
6
274
26
26
22
24
2.00
100013605--100013828
83
2.8
80
85
6
267
26
26
22
24
2.00
100014419--100014446
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
100024177--100024205
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
100029342--100029441
27
3.5
28
84
5
121
34
28
13
25
1.93
100030281--100030305
7
3.6
7
100
0
50
60
28
0
12
1.32
100037208--100037307
27
3.5
28
84
5
121
34
28
13
25
1.93
100038149--100038173
7
3.6
7
100
0
50
60
28
0
12
1.32
100042058--100042087
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
100042591--100042623
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
100044300--100044328
2
15.0
2
92
7
51
51
0
0
48
1.00
100046095--100046251
68
2.3
68
84
3
201
41
18
14
25
1.89
100048647--100048744
29
3.4
29
72
10
92
31
26
19
22
1.98
100048590--100048744
58
2.7
57
88
3
220
30
29
18
21
1.97
100048916--100049032
43
2.7
43
94
0
198
33
34
22
10
1.88
100054102--100054279
43
4.0
43
80
5
176
24
17
28
29
1.98
100059273--100059393
47
2.6
47
84
11
144
31
15
27
25
1.96
100061279--100061445
40
4.2
40
79
2
149
22
27
23
26
2.00
100069281--100069446
40
4.2
40
79
3
158
23
27
22
26
1.99
100072353--100072562
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
100080487--100080696
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
100082421--100082604
48
3.8
48
84
1
235
25
28
20
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100082421--100082604
96
1.9
96
86
0
260
25
28
20
26
1.99
100086608--100086649
20
2.1
20
100
0
84
45
9
9
35
1.69
100087415--100087446
15
2.1
15
100
0
64
40
12
6
40
1.68
100090699--100090840
43
3.3
42
77
7
128
25
20
27
26
1.99
100090722--100090805
42
2.0
44
85
4
118
28
19
23
28
1.98
100093906--100094077
46
3.7
46
77
10
188
27
25
22
23
2.00
100093911--100094081
93
1.8
93
91
0
279
27
26
22
23
2.00
100094504--100094563
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
100098943--100099002
29
2.1
29
96
0
111
33
6
21
38
1.80
100104138--100104358
40
5.6
41
80
9
246
25
23
26
23
2.00
100111566--100111663
37
2.7
36
82
7
101
24
28
16
30
1.96
100111863--100112048
52
3.7
52
77
5
161
31
24
16
27
1.96
100119059--100119173
56
2.1
56
94
0
203
32
27
10
29
1.90
100119659--100119702
22
2.0
22
86
0
61
43
0
2
54
1.12
100127651--100127872
49
4.6
49
75
11
199
27
19
29
22
1.98
100127701--100127874
93
1.9
93
83
7
228
25
20
31
22
1.98
100127649--100127917
49
5.6
48
72
12
187
28
19
28
23
1.98
100127645--100127917
142
1.9
141
85
4
379
27
19
29
23
1.98
100140438--100140578
53
2.6
53
79
2
138
38
18
22
20
1.93
100146600--100146735
56
2.4
56
93
4
247
27
16
25
30
1.97
100148848--100149097
63
3.8
63
76
12
211
29
16
29
24
1.97
100156881--100156921
19
2.2
19
90
0
64
24
34
12
29
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100157747--100157771
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
100159481--100159572
27
3.4
27
89
0
130
28
19
8
43
1.80
100159535--100159741
27
7.7
27
73
8
127
39
20
8
31
1.83
100159604--100159784
54
3.3
55
77
9
147
41
19
7
30
1.80
100159683--100159790
27
3.9
27
77
13
103
41
18
8
31
1.80
100159831--100159908
27
2.9
27
75
11
79
37
21
19
21
1.95
100160718--100160794
25
3.1
25
81
1
84
31
20
19
28
1.97
100160743--100160814
24
3.0
24
78
13
67
29
18
22
30
1.97
100162614--100162682
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
100172333--100172432
50
2.0
50
100
0
200
16
26
16
42
1.88
100173774--100173949
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
100173771--100173941
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
100176865--100176942
15
5.4
15
77
13
83
10
17
12
58
1.61
100176856--100176938
28
2.9
28
82
10
96
10
16
15
56
1.66
100179264--100179436
46
3.8
46
80
9
219
21
21
28
28
1.98
100188978--100189036
6
10.2
6
79
17
54
49
15
3
32
1.61
100189033--100189060
14
2.0
14
100
0
56
71
0
14
14
1.15
100189562--100189586
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
100189607--100189641
9
3.7
9
88
11
52
77
0
2
20
0.90
100192578--100192616
16
2.4
16
95
0
69
53
5
25
15
1.62
100202685--100202724
13
2.8
15
85
14
66
35
0
0
65
0.93
100205492--100205520
14
2.1
14
100
0
58
27
13
6
51
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100209687--100209755
21
3.3
21
87
2
95
11
24
8
55
1.64
100212121--100212214
18
5.4
18
92
3
131
28
9
25
36
1.87
100220461--100220488
14
2.0
14
100
0
56
14
14
0
71
1.15
100220485--100220563
5
14.2
6
80
17
66
32
2
16
48
1.60
100220486--100220567
11
7.5
11
69
23
50
32
2
17
47
1.60
100220522--100220567
20
2.2
21
92
7
85
32
0
19
47
1.50
100228740--100228801
32
1.9
32
96
0
115
38
22
9
29
1.86
100232919--100232962
22
2.0
22
100
0
88
54
4
22
18
1.61
100235194--100235237
21
2.1
21
83
8
54
63
2
9
25
1.35
100245142--100245169
13
2.2
13
100
0
56
50
14
7
28
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770