Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  266  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80048789--80048828
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
80049061--80049261
108
1.8
110
85
6
284
23
26
17
32
1.96
80049061--80049269
55
3.8
53
76
6
186
22
26
17
33
1.96
80055701--80055731
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
80055698--80055737
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
80055922--80056173
53
4.8
53
79
9
243
21
25
17
36
1.95
80055969--80056166
107
1.8
108
88
5
303
21
25
18
34
1.96
80059672--80059723
26
1.9
28
84
7
72
40
9
15
34
1.80
80066143--80066272
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
80069160--80069260
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
80069248--80069377
29
4.5
29
85
2
165
25
32
16
26
1.96
80080082--80080251
40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
80088174--80088343
40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
80094832--80094894
28
2.2
29
88
8
94
31
23
22
22
1.98
80095000--80095064
28
2.3
28
91
0
103
32
7
27
32
1.85
80102589--80102748
24
6.7
24
88
2
223
20
12
27
40
1.88
80102633--80102719
12
7.2
12
65
14
54
19
11
27
41
1.86
80107319--80107343
8
3.1
8
100
0
50
28
0
24
48
1.52
80109920--80110167
42
6.0
41
90
4
365
39
25
16
18
1.91
80109920--80110167
82
3.0
82
90
2
381
39
25
16
18
1.91
80109920--80110159
123
2.0
123
92
3
403
40
24
16
18
1.91
80111625--80111672
19
2.6
19
86
3
71
35
2
14
47
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80111689--80111774
42
2.0
42
93
4
147
31
4
13
50
1.63
80119283--80119371
42
2.1
42
95
0
160
28
5
14
51
1.65
80122329--80122721
47
8.4
47
93
0
653
32
8
30
28
1.87
80122329--80122721
187
2.1
188
94
0
689
32
8
30
28
1.87
80124575--80125006
40
10.8
40
90
0
668
21
21
31
25
1.98
80126555--80126703
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
80126596--80126703
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
80132253--80132644
47
8.4
47
93
1
653
32
8
30
28
1.87
80132253--80132644
140
2.8
140
93
1
651
32
8
30
28
1.87
80132253--80132644
93
4.2
94
96
0
680
32
8
30
28
1.87
80150251--80150352
49
2.1
50
96
1
188
37
43
9
9
1.71
80150397--80150506
26
4.3
26
87
5
147
28
21
20
30
1.98
80150508--80150559
25
2.1
25
100
0
104
36
40
0
23
1.55
80150581--80150627
20
2.3
20
92
7
78
34
17
10
38
1.84
80150977--80151017
21
2.0
21
85
4
57
19
43
19
17
1.88
80158691--80158821
26
5.2
26
88
3
198
28
23
19
28
1.99
80158856--80158902
20
2.3
20
92
7
78
34
19
10
36
1.86
80158938--80158985
25
1.9
25
86
0
69
27
14
22
35
1.93
80174395--80174553
84
1.9
83
86
1
228
25
25
18
30
1.98
80174478--80174641
48
3.4
48
77
5
143
27
26
18
27
1.98
80177057--80177182
40
3.2
39
80
6
139
21
25
24
28
1.99
80176996--80177182
80
2.3
80
78
12
204
22
27
24
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80183142--80183200
28
2.1
28
90
0
91
30
11
27
30
1.92
80183146--80183207
28
2.2
28
85
0
88
29
14
20
35
1.93
80183336--80183360
8
3.1
8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
80183328--80183366
19
2.0
20
90
5
62
71
0
2
25
0.98
80187970--80188264
143
2.1
143
99
0
581
21
10
29
39
1.86
80188751--80188833
29
2.9
29
100
0
166
30
14
28
26
1.95
80188747--80188883
60
2.3
58
81
6
152
28
15
31
24
1.95
80193970--80194108
46
3.0
45
73
10
138
30
30
17
21
1.97
80196705--80196761
27
2.1
27
100
0
114
47
17
15
19
1.83
80200861--80201136
138
2.0
138
98
0
534
34
27
11
26
1.91
80205182--80205217
13
2.8
13
91
0
54
8
38
27
25
1.84
80206362--80206534
48
3.6
48
73
1
168
26
26
18
28
1.98
80210535--80210632
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
80220089--80220137
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
80220958--80221123
40
4.2
39
77
9
158
25
21
27
24
1.99
80228085--80228133
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
80228953--80229119
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
80236457--80236519
29
2.2
29
91
5
101
34
22
17
25
1.95
80240240--80240300
30
2.0
30
83
0
77
40
4
22
31
1.75
80240996--80241167
67
2.6
66
80
9
172
33
16
26
22
1.96
80245611--80246015
48
8.4
48
94
0
693
34
7
27
30
1.85
80246188--80246289
37
2.8
37
93
1
170
24
20
30
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80247588--80247876
40
7.2
40
95
0
470
20
21
30
27
1.98
80249548--80249774
47
4.7
47
88
4
294
29
31
7
31
1.85
80249545--80249774
96
2.4
96
89
4
333
29
30
8
31
1.86
80255850--80256202
48
7.4
48
95
0
598
34
8
28
29
1.86
80256382--80256481
37
2.7
37
93
0
164
25
18
32
25
1.97
80258633--80258719
45
1.9
45
85
0
120
24
13
24
37
1.91
80263116--80263260
43
3.4
42
76
5
132
31
16
22
28
1.96
80265331--80265395
34
1.9
34
84
6
87
20
26
21
32
1.97
80277072--80277174
29
3.6
29
82
0
89
24
35
16
23
1.95
80277817--80278113
143
2.1
143
99
0
585
39
29
10
21
1.86
80284828--80284930
29
3.6
29
82
0
89
24
35
16
23
1.95
80285504--80285800
143
2.1
143
99
0
585
39
29
10
21
1.86
80287600--80287738
43
3.2
43
82
5
156
27
25
18
28
1.98
80291119--80291281
43
3.8
43
73
10
147
31
24
14
29
1.94
80294539--80294608
25
2.8
25
80
8
72
24
21
24
30
1.99
80295568--80295666
48
2.1
48
98
0
189
23
9
8
59
1.54
80296926--80297086
43
3.7
43
75
8
130
28
13
23
34
1.93
80299963--80299997
16
2.2
16
89
0
52
42
20
28
8
1.81
80300211--80300310
28
3.6
27
82
5
110
24
16
34
26
1.95
80302378--80302549
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
80302370--80302545
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
80304927--80305014
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80304927--80305005
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
80304938--80305014
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
80307836--80307964
46
2.8
46
96
0
231
28
29
22
19
1.98
80309651--80309684
18
1.9
18
88
5
52
41
11
17
29
1.85
80314739--80314838
28
3.6
28
81
0
119
26
33
14
27
1.94
80317002--80317058
16
3.6
16
81
6
71
47
19
21
12
1.81
80317002--80317062
32
1.9
32
86
6
88
50
18
19
11
1.76
80317278--80317389
28
4.0
28
83
2
118
27
15
30
26
1.96
80319124--80319300
40
4.4
40
86
5
216
24
27
23
24
2.00
80329876--80330041
40
4.2
40
80
3
183
25
21
27
25
1.99
80337985--80338151
40
4.2
40
77
5
178
25
21
26
25
2.00
80337985--80338151
79
2.1
80
82
4
196
25
21
26
25
2.00
80341592--80341648
29
2.0
29
92
0
96
28
10
22
38
1.87
80341628--80341738
43
2.6
43
77
5
116
27
16
23
32
1.96
80346662--80346691
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
80347142--80347324
24
7.6
24
95
0
276
21
19
25
33
1.97
80347142--80347346
48
4.3
48
89
2
216
23
19
24
33
1.97
80347142--80347346
72
2.8
72
80
5
236
23
19
24
33
1.97
80350671--80350841
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
80359917--80360023
39
2.7
39
84
11
139
24
26
28
21
1.99
80367961--80368143
40
4.6
39
76
7
147
27
23
26
22
1.99
80371141--80371211
18
4.0
17
77
13
72
69
1
0
29
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80371137--80371212
28
2.7
27
77
20
77
65
1
0
32
1.01
80371134--80371212
27
2.9
27
77
15
83
67
1
0
31
0.99
80374086--80374405
46
6.8
47
75
12
248
23
29
18
28
1.98
80383519--80383550
16
2.1
16
94
5
57
84
0
6
9
0.78
80383513--80383554
9
4.9
9
82
11
61
78
0
9
11
0.96
80384103--80384154
25
2.1
25
100
0
104
11
17
15
55
1.68
80397293--80397323
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
80399437--80399565
42
3.1
41
93
2
213
31
24
20
23
1.98
80407216--80407372
42
3.9
41
81
9
171
31
24
21
22
1.98
80407216--80407367
39
3.8
40
82
7
157
30
25
22
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770