Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  480  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148318738--148318785
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
148326257--148326319
31
2.1
31
90
3
101
23
23
15
36
1.94
148326532--148326649
23
5.1
23
95
2
211
28
21
22
27
1.99
148326708--148326764
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
148326696--148326766
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
148326701--148326755
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
148326803--148326850
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
148330580--148330680
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
148335943--148336114
46
3.7
46
78
10
188
29
27
20
22
1.98
148335948--148336118
93
1.8
93
89
0
270
29
28
20
21
1.98
148343531--148343701
93
1.8
93
91
2
281
26
28
22
22
1.99
148343528--148343698
46
3.7
45
76
16
172
27
27
22
22
1.99
148349393--148349503
27
4.1
27
86
7
147
34
21
24
19
1.97
148349393--148349503
54
2.1
53
88
8
163
34
21
24
19
1.97
148350936--148351036
24
4.2
24
92
0
157
19
40
4
34
1.74
148357302--148357412
27
4.1
27
77
5
100
36
20
21
20
1.95
148357306--148357408
54
1.9
53
84
2
134
37
18
21
22
1.94
148367134--148367284
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
148367170--148367300
40
3.3
40
79
2
156
25
23
27
23
2.00
148375565--148375663
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
148382550--148382642
29
3.2
29
95
1
161
25
29
16
29
1.96
148382512--148382642
58
2.3
57
81
4
147
25
33
16
25
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148393303--148393396
29
3.2
29
96
0
170
26
28
15
28
1.96
148393266--148393396
58
2.3
58
85
2
165
25
32
16
25
1.96
148407753--148407793
21
1.9
22
85
5
57
31
24
4
39
1.76
148408203--148408281
28
2.8
28
80
0
86
29
22
11
36
1.89
148411781--148411852
3
24.0
3
97
0
135
66
1
0
31
1.00
148413146--148413177
14
2.4
13
90
10
55
18
6
12
62
1.50
148416516--148416721
53
3.8
54
79
1
234
36
17
23
21
1.94
148418295--148418369
29
2.6
29
78
4
80
21
36
21
21
1.96
148418353--148418425
28
2.6
29
93
2
130
26
31
15
27
1.95
148423867--148424085
123
1.8
120
82
6
280
31
11
23
33
1.90
148424044--148424194
40
3.8
40
77
11
141
26
24
27
21
2.00
148424081--148424210
40
3.2
40
79
2
154
23
23
28
23
2.00
148424043--148424210
80
2.1
80
82
6
207
26
23
27
22
2.00
148429204--148429272
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
148435525--148435562
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
148437171--148437239
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
148447124--148447175
25
2.1
25
85
0
68
28
19
21
30
1.97
148456428--148456496
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
148458115--148458152
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
148462567--148462636
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
148470506--148470575
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
148473362--148473440
30
2.6
30
73
0
77
27
17
26
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148475665--148475747
30
2.7
30
81
9
89
13
21
1
63
1.35
148475698--148475753
18
3.1
18
76
5
51
7
19
3
69
1.27
148475723--148475747
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
148475750--148475780
12
2.6
12
94
0
53
29
16
9
45
1.79
148475828--148475884
5
11.0
5
75
20
55
3
17
1
77
1.00
148475828--148475884
16
3.7
14
82
15
60
3
17
1
77
1.00
148475828--148475895
21
3.2
21
76
15
61
2
17
2
76
1.04
148476803--148476836
13
2.6
13
100
0
68
11
5
5
76
1.14
148476804--148476846
13
3.7
12
90
9
63
11
4
6
76
1.13
148478499--148478582
30
2.8
30
72
1
80
27
17
27
27
1.98
148486218--148486244
12
2.2
12
100
0
54
40
14
7
37
1.74
148492744--148492880
29
4.7
29
79
8
127
27
29
14
28
1.95
148492745--148492879
60
2.3
58
82
5
155
27
30
14
27
1.95
148500801--148500937
29
4.7
29
79
8
127
27
29
14
28
1.95
148500802--148500936
60
2.3
58
82
5
155
27
30
14
27
1.95
148505986--148506019
16
2.2
16
90
10
54
5
26
0
67
1.13
148505985--148506020
14
2.3
17
81
18
51
5
25
0
69
1.10
148508202--148508250
22
2.2
22
89
7
73
32
16
20
30
1.94
148508171--148508336
73
2.3
73
94
0
287
26
19
19
34
1.96
148509861--148509951
27
3.4
27
80
8
107
26
18
12
42
1.85
148509911--148509960
26
1.9
26
100
0
100
26
16
16
42
1.88
148509915--148510054
27
5.3
26
74
10
77
35
19
12
32
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148509983--148510106
27
4.6
27
78
7
128
41
21
8
28
1.81
148509950--148510105
81
1.9
81
82
7
192
40
18
10
30
1.85
148510003--148510163
54
2.9
53
80
6
162
41
18
8
31
1.80
148510036--148510165
27
4.7
27
75
11
120
42
19
7
30
1.79
148510222--148510291
26
2.7
26
80
8
81
37
18
24
20
1.94
148511096--148511165
25
2.8
24
86
4
86
27
21
24
27
1.99
148511592--148511629
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
148513251--148513316
28
2.5
27
88
9
93
45
25
9
19
1.80
148519560--148519597
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
148521127--148521200
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
148526364--148526411
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
148526455--148526513
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
148526459--148526513
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
148526564--148526705
24
6.0
24
90
5
200
28
21
22
26
1.99
148526564--148526705
46
3.0
47
88
7
198
28
21
22
26
1.99
148526897--148526960
31
2.1
31
96
0
119
39
15
21
23
1.92
148534461--148534508
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
148534552--148534590
20
2.0
20
100
0
78
38
10
20
30
1.86
148534641--148534760
24
5.0
24
90
3
170
28
22
22
26
1.99
148534847--148534986
24
5.8
24
91
4
203
27
22
22
27
1.99
148534561--148534947
203
1.9
201
96
1
711
30
16
25
28
1.96
148534847--148534986
47
2.9
47
90
5
201
27
22
22
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148534847--148534987
71
2.0
72
88
4
214
27
22
22
26
1.99
148535178--148535241
31
2.1
31
96
0
119
39
15
21
23
1.92
148535957--148536125
46
3.7
46
77
13
193
22
21
27
28
1.99
148543134--148543300
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
148551120--148551286
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
148553888--148554050
39
4.2
39
93
0
272
25
33
19
22
1.97
148556167--148556225
30
2.0
30
89
0
91
27
25
8
38
1.84
148557889--148557935
11
4.2
12
78
15
64
42
42
0
14
1.46
148557879--148557932
22
2.5
22
82
11
67
42
46
0
11
1.39
148557915--148558043
69
1.9
69
86
3
188
36
40
3
19
1.70
148564135--148564252
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
148564103--148564266
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
148571711--148571819
51
2.0
54
89
10
170
33
22
29
15
1.95
148574279--148574313
7
4.9
7
96
3
61
28
0
2
68
1.04
148574265--148574320
21
2.5
23
75
18
64
30
3
1
64
1.21
148575871--148575906
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
148584196--148584824
74
8.2
75
77
12
557
29
17
20
33
1.95
148584196--148584824
75
8.2
74
77
11
561
29
17
20
33
1.95
148584569--148584597
14
2.1
14
100
0
58
13
13
6
65
1.45
148584365--148584872
238
2.1
236
88
2
743
29
16
21
32
1.95
148584513--148584692
91
2.0
89
80
6
200
31
16
17
33
1.93
148584806--148584830
13
1.9
13
100
0
50
24
12
0
64
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148584753--148585390
140
4.5
140
94
1
1080
26
17
19
36
1.93
148585226--148585250
13
1.9
13
100
0
50
24
12
0
64
1.27
148585310--148585535
72
3.0
72
82
11
258
30
16
18
34
1.93
148585395--148585535
72
2.0
72
98
0
273
32
16
17
33
1.92
148585489--148585584
49
2.0
49
89
0
147
29
15
21
33
1.94
148585571--148585754
90
2.1
88
86
8
257
26
17
18
37
1.93
148585659--148586118
74
6.0
73
72
13
357
27
15
23
33
1.95
148585739--148585903
87
1.9
87
91
2
269
26
13
23
35
1.93
148585541--148586223
161
4.3
160
82
6
753
27
15
21
34
1.94
148585822--148586122
73
4.0
73
77
10
338
28
15
22
33
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770