Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  24  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6580453--6580477
13
1.9
13
100
0
50
12
0
0
88
0.53
6586258--6586290
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
6586571--6587119
46
12.0
46
88
1
744
22
22
13
41
1.89
6591428--6591920
250
2.0
250
93
0
851
24
27
19
27
1.99
6591981--6592075
30
3.2
30
80
4
102
24
33
14
27
1.94
6595066--6595234
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
6603101--6603269
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
6605728--6605832
37
2.8
38
81
9
110
42
3
2
50
1.35
6611416--6611440
13
1.9
13
100
0
50
36
0
16
48
1.46
6613327--6613465
24
5.9
23
71
17
81
35
20
21
22
1.96
6615990--6616142
67
2.3
67
96
0
279
20
31
17
30
1.96
6616651--6616711
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
6619758--6619937
40
4.6
40
77
8
165
22
27
25
24
2.00
6619756--6619938
78
2.3
80
80
8
205
22
27
25
24
2.00
6624051--6624172
43
2.9
42
78
7
147
28
25
15
30
1.96
6628032--6628199
6
27.8
6
76
14
159
48
13
17
20
1.80
6628032--6628193
85
1.9
85
94
0
288
48
13
17
20
1.80
6628032--6628193
30
5.6
30
83
12
221
48
13
17
20
1.80
6628342--6628415
27
2.8
26
83
6
85
36
20
24
18
1.95
6628581--6628639
22
2.7
22
97
0
109
37
23
25
13
1.92
6628748--6628810
27
2.4
26
84
5
81
39
17
20
22
1.92
6628748--6628827
27
3.0
26
83
5
79
36
21
22
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6629029--6629224
27
7.3
27
84
2
241
26
19
17
36
1.94
6629018--6629126
54
2.0
54
82
7
132
27
22
19
30
1.98
6629229--6629530
27
11.2
27
85
4
403
40
10
22
26
1.87
6634469--6634517
22
2.2
22
100
0
98
34
4
14
46
1.63
6636598--6636704
51
2.1
51
89
3
162
31
17
7
42
1.77
6646856--6646964
53
2.1
53
89
0
164
22
10
11
55
1.65
6647221--6647283
31
2.0
31
82
11
76
38
14
9
38
1.78
6647976--6648017
17
2.4
18
80
7
52
35
4
2
57
1.33
6650222--6650268
23
2.0
23
100
0
94
44
8
17
29
1.78
6654660--6655032
186
2.0
186
98
0
719
31
15
21
32
1.94
6656714--6656750
19
1.9
19
100
0
74
27
10
35
27
1.90
6661852--6661976
62
2.0
62
87
0
178
38
13
15
32
1.86
6665347--6665474
29
4.4
28
77
3
103
25
17
32
25
1.96
6667050--6667149
35
2.9
35
73
0
101
32
19
21
28
1.97
6668580--6668635
28
2.0
28
82
6
69
35
25
12
26
1.91
6668596--6668659
28
2.3
28
83
5
76
28
25
14
32
1.94
6670626--6670858
39
5.9
39
91
0
340
24
31
20
23
1.98
6677760--6677992
39
5.9
39
90
0
331
24
31
19
23
1.98
6680480--6680563
28
3.0
28
80
0
96
30
16
21
30
1.95
6680676--6680710
16
2.1
17
89
5
54
20
8
25
45
1.79
6681450--6681623
87
2.0
87
98
0
339
26
14
20
38
1.91
6687143--6687197
28
2.0
28
85
0
74
23
14
34
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6687518--6687776
27
9.6
27
78
5
195
38
19
9
31
1.84
6687518--6687777
54
4.8
54
81
3
267
38
19
9
31
1.84
6687565--6687777
81
2.6
81
83
5
254
39
17
8
33
1.81
6687756--6687819
27
2.4
27
91
0
101
37
14
18
29
1.90
6690672--6690844
46
3.8
45
77
13
190
21
21
27
28
1.99
6690669--6690839
93
1.8
93
92
0
288
21
21
28
28
1.99
6696125--6696393
94
2.8
92
81
6
279
28
21
27
22
1.99
6696132--6696387
142
1.8
137
81
9
320
29
21
27
22
1.99
6696128--6696394
47
5.7
49
72
11
175
29
20
27
22
1.99
6703941--6704294
49
7.3
49
93
1
558
29
30
8
31
1.87
6714654--6714863
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
6722791--6723000
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
6734038--6734167
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
6745103--6745240
50
2.7
50
79
1
159
26
17
27
28
1.98
6750422--6750558
51
2.7
50
80
2
159
26
17
27
28
1.98
6754499--6754659
79
2.0
79
87
0
232
38
16
21
24
1.92
6754521--6754768
75
3.2
76
79
5
214
36
16
21
25
1.94
6757474--6757679
42
4.9
41
69
6
117
33
14
23
29
1.94
6757471--6757706
84
2.8
84
83
1
267
31
15
24
28
1.96
6757586--6757708
42
2.9
42
75
7
124
29
16
29
25
1.96
6760257--6760360
40
2.6
40
87
3
138
27
22
27
22
1.99
6760289--6760390
40
2.5
40
87
0
132
25
23
29
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6770235--6770407
39
4.5
38
80
10
129
26
23
26
24
2.00
6770273--6770381
36
2.9
36
88
9
148
24
22
27
24
2.00
6779451--6779478
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
6780185--6780368
40
4.7
40
83
9
193
26
21
27
25
2.00
6780238--6780391
79
1.9
79
81
12
183
27
20
26
25
1.99
6785229--6785326
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
6791689--6791890
42
4.8
42
68
4
122
30
18
25
25
1.98
6791658--6791894
84
2.8
84
80
3
262
29
17
26
26
1.98
6793140--6793178
20
2.0
20
100
0
78
28
41
20
10
1.85
6795748--6795986
68
3.6
65
79
8
193
24
28
17
29
1.97
6796448--6796508
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
6799123--6799244
44
2.7
46
86
7
151
28
29
19
22
1.98
6799263--6799389
46
2.8
46
82
8
161
22
29
18
29
1.98
6801562--6801641
23
3.5
22
77
8
79
36
17
22
23
1.95
6815507--6815621
24
4.8
24
95
0
203
35
26
17
20
1.95
6815604--6815677
29
2.6
29
97
0
139
28
32
14
24
1.95
6821226--6821600
40
9.5
40
90
3
523
24
22
27
25
2.00
6821222--6821567
119
2.9
119
91
3
563
23
22
27
26
2.00
6821222--6821567
158
2.2
159
93
3
624
23
22
27
26
2.00
6825495--6825752
40
6.4
40
87
1
313
41
3
19
35
1.67
6825503--6825752
13
18.8
13
68
18
95
41
3
19
36
1.67
6825494--6825752
120
2.2
120
87
1
358
41
3
19
35
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6827436--6827537
43
2.4
43
85
3
125
33
23
17
25
1.96
6830629--6830696
4
17.0
4
80
17
79
1
26
0
72
0.94
6830651--6830712
21
3.0
21
86
9
67
1
24
0
74
0.91
6836142--6836173
3
10.7
3
100
0
64
34
0
0
65
0.93
6839311--6839360
25
2.1
25
85
7
68
46
0
6
48
1.27
6841578--6841604
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
6848175--6848214
18
2.2
19
86
4
55
60
0
7
32
1.25
6848649--6848700
22
2.4
21
81
9
61
25
15
9
50
1.74
6854748--6854883
31
4.4
31
98
0
245
13
31
37
17
1.88
6854767--6854823
18
3.4
18
68
22
61
12
33
36
17
1.87
6856929--6856960
16
2.0
16
100
0
64
62
12
0
25
1.30
6861457--6861737
42
6.9
42
83
9
343
25
16
27
30
1.97
6861554--6861618
32
2.0
32
100
0
130
24
20
27
27
1.99
6861518--6861737
74
2.8
74
83
9
246
25
16
28
29
1.97
6861471--6861702
116
2.0
116
90
0
365
25
16
28
30
1.96
6861591--6861773
42
4.4
42
83
2
154
27
16
26
28
1.97
6861591--6861773
84
2.2
84
83
7
221
27
16
26
28
1.97
6862635--6862744
51
2.2
51
96
0
202
25
3
22
48
1.67
6868372--6868510
22
6.3
22
99
0
269
14
31
31
22
1.94
6873592--6873617
11
2.4
11
100
0
52
26
0
11
61
1.30
6875529--6875649
46
2.6
46
94
0
206
23
20
27
28
1.99
6877568--6877653
45
1.9
44
90
2
136
24
12
25
37
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6879126--6879198
31
2.4
31
85
0
101
23
34
28
13
1.93
6895926--6896048
43
2.9
43
93
0
210
26
21
29
22
1.99
6896024--6896129
40
2.6
40
77
3
104
27
19
26
26
1.99
6898989--6899173
67
2.9
64
76
8
187
30
17
29
22
1.97
6902227--6902425
24
8.6
24
91
8
308
36
26
16
21
1.94
6910194--6910331
24
5.8
24
97
0
251
35
26
17
20
1.95
6910314--6910387
29
2.6
29
97
0
139
28
32
14
24
1.95
6917495--6917672
40
4.5
40
87
3
236
24
26
24
24
2.00
6921777--6921836
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
6928591--6928650
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770