Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  425  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131080779--131080812
10
3.3
10
84
8
50
20
8
14
55
1.65
131083022--131083197
46
3.8
46
80
14
218
20
21
29
28
1.98
131083019--131083190
93
1.8
93
95
2
310
20
21
29
27
1.98
131085586--131085617
15
2.0
17
88
11
50
43
31
0
25
1.55
131087665--131087800
40
3.4
39
77
10
132
35
27
14
22
1.93
131089634--131089668
17
2.0
17
88
5
52
22
20
0
57
1.41
131098767--131098804
16
2.3
17
86
4
51
47
7
2
42
1.46
131107079--131107179
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
131109298--131109505
40
5.2
39
81
3
202
25
25
22
25
2.00
131109301--131109504
80
2.5
80
80
3
223
26
25
22
25
2.00
131117325--131117530
40
5.2
39
83
3
209
25
26
22
25
2.00
131117325--131117529
78
2.6
80
82
5
229
25
26
22
25
2.00
131122895--131122978
20
4.4
19
73
23
70
33
5
1
59
1.29
131122900--131122949
16
2.8
17
85
11
57
36
8
0
56
1.29
131124682--131124718
18
2.1
18
89
0
56
54
0
24
21
1.45
131127571--131127604
17
2.0
17
94
0
59
38
2
11
47
1.55
131136575--131136627
24
2.2
25
86
10
74
41
0
0
58
0.98
131136574--131136643
24
3.0
23
73
20
65
41
0
0
58
0.98
131136608--131136643
15
2.5
14
86
8
54
41
0
0
58
0.98
131136815--131136853
21
1.9
21
94
5
71
30
25
10
33
1.89
131139380--131139404
12
2.1
12
100
0
50
44
0
8
48
1.32
131151138--131151177
13
2.8
15
85
14
66
35
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131153945--131153973
14
2.1
14
100
0
58
27
13
6
51
1.66
131158139--131158207
21
3.3
21
87
2
95
11
24
8
55
1.64
131160573--131160666
18
5.4
18
92
3
131
28
9
25
36
1.87
131168914--131168941
14
2.0
14
100
0
56
14
14
0
71
1.15
131168938--131169016
5
14.2
6
80
17
66
32
2
16
48
1.60
131168939--131169020
11
7.5
11
69
23
50
32
2
17
47
1.60
131168975--131169020
20
2.2
21
92
7
85
32
0
19
47
1.50
131177188--131177249
32
1.9
32
96
0
115
38
22
9
29
1.86
131185969--131186022
24
2.2
24
86
0
72
12
40
31
14
1.84
131186056--131186176
58
2.1
59
90
1
190
30
24
21
23
1.99
131186571--131186624
24
2.2
24
100
0
108
7
42
37
12
1.72
131186815--131187450
122
5.2
124
87
8
861
14
34
33
16
1.90
131186809--131187547
42
18.0
41
85
10
810
15
33
33
17
1.91
131201145--131201198
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2.2
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Copy
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