Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  255  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76535674--76535845
93
1.8
93
93
0
299
27
30
20
20
1.98
76535666--76535841
46
3.8
46
79
10
205
28
29
20
21
1.98
76540358--76540426
28
2.5
28
92
2
113
20
10
26
43
1.83
76542244--76542287
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
76544665--76544733
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
76546557--76546600
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
76547406--76547593
40
4.7
40
88
1
261
25
28
21
23
1.99
76547386--76547597
80
2.7
80
86
3
311
27
27
20
24
1.99
76549509--76549555
23
2.0
23
91
0
76
17
23
19
40
1.91
76551912--76551966
27
2.0
27
92
0
92
34
20
5
40
1.75
76561208--76561240
17
1.9
17
88
11
50
48
12
18
21
1.80
76565210--76565250
20
2.0
20
86
9
57
51
14
4
29
1.63
76570691--76570766
34
2.2
34
86
4
100
26
25
21
27
1.99
76571479--76571504
11
2.4
11
100
0
52
61
23
15
0
1.33
76572538--76572570
13
2.6
13
95
4
59
30
0
15
54
1.41
76579219--76579472
39
6.5
39
92
2
404
29
28
23
18
1.98
76579219--76579505
78
3.7
78
90
4
413
27
29
23
19
1.98
76580254--76580280
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
76585628--76585881
39
6.5
39
92
2
395
29
29
22
18
1.98
76585628--76585914
77
3.7
78
89
4
404
28
29
22
19
1.98
76585628--76585881
116
2.2
116
90
3
393
29
29
22
18
1.98
76585638--76585914
116
2.4
116
87
4
373
28
29
22
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76585953--76585978
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
76587749--76587778
6
5.0
6
100
0
60
16
0
0
83
0.65
76590701--76590731
13
2.5
13
94
5
55
29
0
16
54
1.42
76594488--76594572
40
2.2
40
82
2
100
29
31
21
17
1.96
76594643--76594751
47
2.3
46
87
7
150
27
29
10
33
1.89
76597306--76597346
20
2.0
20
85
9
55
46
17
7
29
1.74
76603331--76603462
54
2.5
53
97
1
246
24
18
25
31
1.98
76610166--76610216
20
2.4
20
83
9
57
31
17
31
19
1.95
76610181--76610224
20
2.2
20
100
0
88
31
18
36
13
1.90
76612985--76613167
40
4.6
39
83
8
201
27
28
20
24
1.99
76613013--76613166
79
1.9
80
83
6
197
27
28
18
24
1.98
76614714--76614776
24
2.6
24
100
0
126
34
26
17
20
1.95
76620982--76621044
24
2.6
24
100
0
126
34
26
17
20
1.95
76626667--76626706
21
1.9
21
85
10
55
25
25
25
25
2.00
76629625--76629696
29
2.5
29
91
6
112
29
26
13
30
1.94
76629624--76629725
28
3.5
28
84
6
89
29
28
13
28
1.94
76637581--76637652
29
2.5
29
91
6
112
29
26
13
30
1.94
76637580--76637681
28
3.5
28
84
6
89
29
28
13
28
1.94
76643303--76643345
22
2.0
22
90
9
70
41
4
16
37
1.69
76644929--76644959
14
2.3
14
94
5
55
29
0
6
64
1.18
76646914--76646941
13
2.2
13
100
0
56
21
0
0
78
0.75
76648880--76648980
50
2.0
50
100
0
202
26
15
15
41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76651357--76651426
16
4.2
17
73
16
58
5
21
0
72
1.05
76651354--76651428
34
2.2
35
83
11
93
5
21
0
73
1.03
76659063--76659123
30
2.0
30
100
0
122
40
6
26
26
1.80
76659874--76659988
40
2.9
39
92
3
178
28
21
24
25
1.99
76659876--76660012
39
3.5
40
91
5
190
28
23
24
24
2.00
76660277--76660311
2
17.5
2
87
0
52
48
2
0
48
1.16
76661544--76661581
18
2.1
18
100
0
76
15
5
0
78
0.91
76662457--76662520
23
2.8
24
67
9
62
43
1
3
51
1.26
76665201--76665240
13
3.1
13
88
0
53
30
7
22
40
1.81
76666383--76666422
3
13.3
3
100
0
80
67
0
0
32
0.91
76666759--76666787
14
2.0
15
93
6
51
82
0
3
13
0.79
76668749--76669429
88
7.7
87
67
2
309
26
25
19
28
1.99
76668894--76669332
44
10.0
43
67
11
140
27
25
17
29
1.98
76668672--76669433
176
4.3
176
88
0
1076
26
25
18
28
1.98
76669374--76669470
44
2.2
44
85
3
124
27
22
20
28
1.99
76672470--76672533
31
2.1
31
90
0
101
25
25
15
34
1.95
76672748--76672867
23
5.1
23
86
4
168
26
20
23
29
1.99
76672746--76672867
47
2.6
47
92
0
199
26
21
22
29
1.99
76672746--76672868
24
5.2
24
87
3
178
26
21
22
30
1.99
76672926--76672982
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
76672914--76672984
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
76672919--76672973
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76673021--76673068
25
1.9
25
86
0
69
27
14
22
35
1.93
76675832--76675887
28
2.0
28
100
0
112
25
14
17
42
1.87
76679900--76679941
3
14.0
3
94
0
75
64
0
2
33
1.07
76680224--76680258
3
11.7
3
100
0
70
68
0
0
31
0.90
76680299--76680327
14
2.0
15
93
6
51
82
0
3
13
0.79
76680444--76680517
32
2.3
32
90
0
112
41
16
25
16
1.88
76685035--76685083
13
3.8
13
78
10
64
12
2
4
81
0.91
76688822--76688921
51
2.0
51
91
0
164
25
18
26
31
1.97
76693278--76693355
30
2.5
31
82
16
99
62
7
6
23
1.45
76693946--76694013
13
5.4
13
75
19
56
63
1
1
33
1.13
76695928--76696011
26
3.2
26
94
0
150
33
5
25
35
1.80
76702928--76703010
26
3.2
26
94
1
141
33
4
24
37
1.77
76704490--76704541
25
2.0
26
85
3
70
38
23
15
23
1.92
76705703--76706404
206
3.4
204
81
5
854
30
20
17
31
1.96
76705699--76706497
415
1.9
415
90
1
1260
29
21
17
31
1.96
76705710--76706497
416
1.9
415
89
1
1175
30
21
17
30
1.96
76714503--76714552
15
3.5
15
82
15
61
42
10
24
24
1.85
76718062--76718139
30
2.5
31
80
16
90
61
7
7
23
1.49
76718824--76718890
30
2.3
28
80
10
71
52
2
5
38
1.41
76721894--76721926
17
1.9
17
100
0
66
72
6
18
3
1.18
76726082--76726149
19
3.7
19
88
7
113
36
16
11
35
1.85
76726574--76726878
87
3.5
86
69
19
236
29
20
18
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76726614--76727021
175
2.3
175
91
0
647
28
19
19
32
1.96
76726744--76727030
87
3.2
93
68
14
267
27
19
18
33
1.96
76726973--76727061
44
2.0
45
84
4
117
26
24
15
32
1.96
76728067--76728116
13
3.8
13
84
5
57
2
14
0
84
0.72
76751888--76751930
23
2.0
21
86
9
59
48
20
16
13
1.80
76753073--76753149
35
2.2
35
95
0
136
42
19
18
19
1.89
76754691--76754731
21
1.9
21
85
5
55
39
17
9
34
1.82
76754688--76754780
19
4.8
19
83
11
118
36
17
10
35
1.84
76754704--76754790
36
2.4
35
77
22
108
35
17
10
36
1.84
76756173--76756208
7
5.0
7
86
6
54
66
0
2
30
1.06
76756173--76756208
15
2.5
14
86
8
54
66
0
2
30
1.06
76756226--76756296
10
7.2
10
73
19
51
61
0
5
32
1.19
76756447--76756483
12
3.0
12
84
7
56
59
0
5
35
1.20
76756451--76756515
13
4.7
14
74
9
62
64
0
3
32
1.09
76756447--76756497
25
2.0
26
81
11
61
62
0
3
33
1.13
76760731--76760773
23
1.9
22
85
4
59
9
9
2
79
1.03
76767910--76767943
17
1.9
18
88
5
52
32
2
23
41
1.69
76791595--76791764
93
1.8
92
92
1
286
28
28
20
21
1.98
76791590--76791761
46
3.7
46
79
11
199
29
27
20
22
1.98
76792183--76792242
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
76796997--76797162
64
2.8
58
93
5
269
30
13
28
26
1.94
76796997--76797162
29
5.5
29
88
8
260
30
13
28
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76796997--76797183
58
3.1
58
88
6
259
29
14
29
25
1.95
76800012--76800049
19
2.0
20
89
5
60
42
0
5
52
1.24
76799982--76800531
59
9.5
59
86
5
739
45
4
3
46
1.40
76800317--76800417
48
2.2
44
83
11
125
45
5
2
45
1.43
76803594--76803856
40
6.6
40
86
6
345
24
23
26
25
2.00
76803594--76803856
79
3.3
79
86
5
350
24
23
26
25
2.00
76808404--76808520
62
1.9
59
87
5
171
41
3
4
51
1.38
76811533--76811693
27
6.0
27
83
2
180
25
14
16
42
1.87
76811522--76811686
54
3.1
54
85
3
224
26
15
15
41
1.87
76812017--76812062
18
2.6
18
82
6
58
21
17
13
47
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770