Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  417  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128411684--128412064
49
7.9
49
90
3
603
28
28
8
33
1.87
128411684--128412065
96
4.0
96
94
2
633
28
29
8
33
1.87
128411685--128412066
145
2.6
143
95
2
674
29
29
8
32
1.87
128417598--128417780
39
4.6
39
87
0
240
24
22
30
22
1.99
128425032--128425212
39
4.6
39
84
3
222
24
22
30
22
1.99
128428695--128428863
46
3.7
46
70
16
150
22
21
27
27
1.99
128428691--128428861
93
1.8
93
88
0
261
22
21
28
28
1.99
128437420--128437525
54
2.0
53
90
1
167
17
24
19
37
1.94
128437417--128437527
27
4.2
26
87
5
150
17
24
21
36
1.94
128440205--128440334
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
128448217--128448345
40
3.2
40
81
5
156
23
24
28
24
1.99
128450697--128450923
46
5.0
46
90
4
318
33
10
29
26
1.90
128450697--128450923
91
2.5
94
86
6
322
33
10
29
26
1.90
128451091--128451219
37
3.6
37
90
5
194
24
17
31
26
1.97
128452487--128452829
39
8.8
40
93
5
587
24
22
28
24
1.99
128452487--128452829
118
2.9
118
93
3
581
24
22
28
24
1.99
128457075--128457150
23
3.2
25
62
24
63
28
13
34
23
1.92
128457048--128457279
93
2.5
94
90
0
358
31
11
30
27
1.92
128457048--128457279
47
5.0
47
90
1
367
31
11
30
27
1.92
128457442--128457585
37
3.9
37
91
0
227
22
18
33
25
1.97
128458851--128459315
119
3.9
120
91
3
746
26
21
26
25
2.00
128458851--128459315
40
11.8
40
91
3
746
26
21
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128459491--128459541
25
2.0
25
85
7
68
29
7
33
29
1.85
128463558--128463633
23
3.2
25
62
24
63
28
13
34
23
1.92
128463531--128463763
47
5.0
47
89
0
349
30
11
30
27
1.92
128463926--128464070
37
3.9
37
87
0
209
24
15
33
26
1.95
128467695--128467795
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
128475658--128475758
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
128479781--128479917
46
3.0
46
89
0
202
25
31
8
34
1.86
128479891--128480226
47
7.1
47
90
2
501
26
30
11
31
1.92
128479891--128480226
145
2.4
141
92
2
537
26
30
11
31
1.92
128480152--128480227
23
3.3
23
63
23
59
28
31
10
28
1.90
128484468--128484901
40
10.9
39
87
3
501
27
27
21
23
1.99
128484459--128484901
80
5.6
80
89
0
600
27
27
20
23
1.99
128484461--128484901
120
3.7
120
85
2
564
27
27
21
24
1.99
128486421--128486557
46
3.0
46
87
0
193
26
30
8
34
1.87
128486531--128486866
47
7.1
47
89
2
492
26
30
11
31
1.92
128486531--128486866
145
2.4
141
91
2
528
26
30
11
31
1.92
128486792--128486867
23
3.3
23
63
23
59
28
31
10
28
1.90
128491435--128491591
24
6.6
23
86
7
206
35
23
17
24
1.95
128491435--128491591
48
3.3
48
95
1
271
35
23
17
24
1.95
128491457--128491591
72
1.9
72
96
0
252
36
24
17
22
1.94
128501262--128501489
40
5.8
40
92
4
340
22
22
28
26
1.99
128501262--128501498
78
3.0
79
89
6
338
22
22
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128501262--128501489
118
1.9
118
88
7
327
22
22
28
26
1.99
128504871--128504957
24
3.6
24
96
0
165
21
17
25
35
1.95
128504871--128504979
48
2.3
48
91
3
175
24
17
23
33
1.96
128504871--128504979
24
4.5
24
90
2
157
24
17
23
33
1.96
128520227--128520401
71
2.5
69
86
3
226
28
14
23
34
1.94
128520401--128520565
71
2.3
71
87
5
235
22
15
20
41
1.89
128520498--128521124
140
4.5
140
97
1
1159
24
17
20
37
1.93
128520498--128521124
279
2.2
280
96
2
1159
24
17
20
37
1.93
128520962--128520995
13
2.5
13
90
4
50
20
11
8
58
1.59
128521044--128521269
72
3.0
72
83
11
276
30
16
19
34
1.93
128521223--128521318
49
2.0
49
100
0
192
30
15
20
33
1.94
128521151--128521390
121
2.0
121
95
0
435
30
15
18
34
1.93
128521272--128521624
77
4.7
75
88
4
455
30
16
19
32
1.94
128521618--128522208
88
7.2
77
71
17
349
28
17
18
36
1.93
128521453--128521775
168
1.9
165
85
6
438
28
18
19
33
1.96
128521639--128521853
79
2.8
77
81
7
233
30
17
19
32
1.95
128521984--128522039
29
1.9
29
89
7
87
21
8
25
44
1.81
128521444--128522208
253
3.1
247
83
7
879
27
17
19
35
1.94
128522855--128522914
22
2.8
22
76
2
77
66
30
0
3
1.07
128526489--128526531
17
2.3
19
88
11
63
74
9
2
13
1.16
128526489--128526530
19
2.1
20
86
8
59
73
9
2
14
1.18
128526571--128526605
18
1.9
18
88
0
52
62
17
0
20
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128530593--128530640
25
2.0
24
83
4
60
4
20
0
75
0.97
128530593--128530647
19
2.8
20
82
17
62
3
23
0
72
1.00
128531507--128531595
44
2.0
44
97
0
169
67
2
23
6
1.26
128534629--128534653
7
3.6
7
100
0
50
88
0
0
12
0.53
128539754--128539779
5
5.2
5
100
0
52
0
19
0
80
0.71
128540092--128540151
30
2.0
31
86
3
86
41
5
3
50
1.41
128540288--128540375
43
2.0
43
97
0
167
53
12
2
31
1.51
128540693--128540722
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
128541853--128541912
31
1.9
32
82
3
77
21
26
8
43
1.81
128542437--128542493
3
19.0
3
100
0
114
66
0
0
33
0.92
128545169--128545228
27
2.3
26
85
2
75
21
23
20
35
1.96
128552595--128552628
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
128552630--128552688
27
2.2
26
84
3
73
20
23
20
35
1.96
128558001--128558130
40
3.2
40
80
2
154
25
27
23
23
2.00
128558017--128558168
40
3.8
40
80
5
146
23
26
23
26
2.00
128560507--128560547
2
20.5
2
100
0
82
51
0
0
48
1.00
128560640--128560770
29
4.5
29
96
0
235
26
29
14
29
1.95
128560582--128560770
58
3.3
58
87
3
238
26
31
15
26
1.96
128560611--128560770
87
1.8
87
89
2
250
26
31
15
26
1.95
128563188--128563248
13
4.6
13
72
11
52
32
18
3
45
1.65
128563528--128563587
26
2.3
26
79
0
66
46
18
13
21
1.83
128565367--128565467
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128565396--128565471
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
128573258--128573358
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
128573287--128573362
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
128577304--128577364
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
128581743--128581803
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
128586191--128586251
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
128590642--128590702
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
128599321--128599509
29
6.5
29
85
3
238
26
16
30
25
1.97
128601942--128602120
39
4.6
39
90
0
286
28
26
22
22
1.99
128609957--128610174
39
5.6
39
91
0
328
28
25
22
23
1.99
128615078--128615187
40
2.8
40
85
0
148
26
23
26
23
2.00
128615078--128615227
40
3.8
39
80
7
133
26
22
26
24
2.00
128623108--128623217
40
2.8
40
85
0
148
26
23
26
23
2.00
128623108--128623257
40
3.8
39
80
7
133
26
22
26
24
2.00
128632690--128632880
40
4.8
39
80
8
165
24
29
21
24
1.99
128640354--128640433
27
2.9
28
83
12
121
30
15
30
25
1.95
128640354--128640429
25
2.8
26
88
9
109
31
14
28
25
1.95
128640417--128640492
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
128648248--128648362
29
4.0
29
97
0
221
29
13
28
27
1.95
128648249--128648422
29
6.0
29
85
5
183
27
16
31
25
1.96
128648260--128648422
58
2.8
58
86
1
202
26
16
31
25
1.96
128648248--128648420
87
2.0
87
84
4
224
27
16
30
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128653443--128653634
40
4.8
39
80
6
154
24
22
29
23
1.99
128653443--128653634
79
2.4
81
82
6
223
24
22
29
23
1.99
128653443--128653659
79
2.7
78
78
10
199
24
22
28
24
1.99
128660329--128660511
78
2.3
80
85
5
239
24
21
27
26
2.00
128660329--128660511
40
4.7
40
85
7
234
24
21
27
26
2.00
128665191--128665228
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
128669551--128669720
40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
128676428--128676465
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
128677070--128677253
40
4.6
39
75
10
167
29
26
19
24
1.98
128677070--128677254
79
2.3
80
80
9
191
29
26
19
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770