Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  461  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
142165177--142165317
40
3.5
40
83
9
173
26
26
21
24
2.00
142167861--142167942
29
2.8
29
98
0
155
25
30
14
29
1.95
142175752--142175833
29
2.8
29
98
0
155
25
30
14
29
1.95
142191433--142191490
25
2.4
25
80
8
66
20
10
24
44
1.82
142196786--142197010
124
1.8
124
86
1
326
30
10
24
35
1.88
142197005--142197134
40
3.2
40
83
4
165
22
25
29
23
1.99
142205096--142205225
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
142209896--142210071
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
142209892--142210063
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
142225281--142225369
44
2.0
44
100
0
178
41
8
11
38
1.72
142226555--142226608
27
2.0
27
88
0
81
38
14
9
37
1.79
142226905--142226953
14
3.5
14
91
0
80
44
16
22
16
1.86
142235464--142235541
20
3.8
20
81
1
84
16
20
24
38
1.93
142237843--142237878
15
2.4
15
95
0
63
52
11
13
22
1.72
142237857--142237895
21
1.9
20
85
15
53
48
10
15
25
1.76
142239802--142239829
13
2.2
13
100
0
56
35
14
25
25
1.93
142241384--142241513
48
2.6
50
83
4
167
23
30
18
26
1.98
142241282--142241508
96
2.3
95
80
8
246
25
29
18
26
1.98
142241282--142241647
46
7.7
46
72
13
164
24
28
20
26
1.99
142247168--142247251
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
142250114--142250216
29
3.6
28
80
5
109
27
26
16
30
1.97
142258041--142258143
29
3.6
28
80
5
109
27
26
16
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
142263604--142263647
22
2.0
22
95
4
81
56
25
9
9
1.59
142268391--142268421
3
10.7
3
93
6
55
70
0
0
29
0.87
142272043--142272214
84
2.0
85
88
7
258
25
14
16
43
1.86
142282361--142282460
47
2.1
47
87
5
141
34
7
25
34
1.83
142283839--142283939
48
2.1
48
94
0
175
22
10
11
54
1.68
142285407--142285580
3
59.3
3
69
13
103
32
2
1
63
1.19
142285416--142285580
17
10.1
17
70
19
104
32
3
1
62
1.21
142285422--142285580
20
8.2
19
70
15
87
32
3
1
62
1.18
142285471--142285553
37
2.3
35
81
8
87
33
3
1
61
1.21
142285525--142285580
23
2.3
26
87
9
82
30
0
0
69
0.89
142294016--142294166
78
1.9
78
90
0
239
27
23
23
26
2.00
142299807--142299912
53
2.0
51
94
3
185
11
21
9
57
1.61
142312557--142312617
22
2.8
22
92
0
104
9
21
29
39
1.85
142312633--142316269
7
520.3
7
97
2
6890
14
0
42
42
1.45
142319140--142319240
28
3.5
28
83
6
105
30
13
25
29
1.94
142326831--142326857
13
2.1
13
100
0
54
22
37
25
14
1.93
142330904--142331263
180
2.0
180
94
0
630
19
26
23
30
1.98
142337679--142337790
43
2.6
42
83
5
145
30
16
24
29
1.96
142357599--142357736
40
3.5
40
91
3
208
23
27
23
25
2.00
142357632--142357740
40
2.7
40
97
0
209
24
27
22
24
2.00
142365582--142365722
40
3.5
40
85
8
187
24
26
22
26
2.00
142372774--142372940
40
4.2
40
79
2
158
22
27
23
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
142372790--142372938
80
1.9
79
84
6
203
21
27
24
26
1.99
142381752--142381949
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
142381818--142381935
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
142381786--142381949
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
142383503--142383632
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
142383519--142383670
40
3.8
40
78
6
148
22
26
23
27
1.99
142383519--142383668
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
142391180--142391215
18
1.9
19
88
5
56
66
5
5
22
1.34
142393502--142393562
29
2.1
29
84
6
79
40
1
24
32
1.65
142398275--142398408
40
3.3
42
83
10
140
21
25
25
27
1.99
142398308--142398413
40
2.7
40
89
5
153
23
27
22
26
2.00
142412832--142412915
37
2.2
38
85
2
116
36
22
16
23
1.94
142413365--142413434
28
2.5
28
80
13
81
32
18
20
28
1.96
142417172--142417350
40
4.4
40
83
3
207
25
24
26
24
2.00
142417172--142417350
80
2.2
81
86
3
245
25
24
26
24
2.00
142417293--142417376
40
2.1
40
82
4
98
26
27
26
20
1.99
142417206--142417376
80
2.1
80
82
2
200
27
24
25
22
2.00
142419908--142420015
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
142422434--142422521
26
3.1
30
82
14
114
23
22
15
37
1.93
142422434--142422521
30
3.1
31
81
17
118
23
22
15
37
1.93
142422813--142422866
11
5.4
11
70
20
55
31
20
11
37
1.88
142422813--142422871
19
3.0
20
95
5
111
33
20
10
35
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
142422914--142422961
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
142424118--142424182
27
2.4
27
84
5
87
20
24
20
35
1.96
142424228--142424283
27
2.1
26
83
9
69
39
12
10
37
1.78
142424291--142424372
26
3.2
24
74
20
76
28
6
24
41
1.78
142424351--142424585
27
8.9
26
83
6
260
41
8
22
27
1.82
142432165--142432317
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
142434223--142434267
23
2.0
23
100
0
90
33
17
17
31
1.94
142440666--142440809
39
3.7
39
87
1
200
22
21
29
27
1.99
142440775--142440849
39
1.9
39
81
5
89
22
22
26
28
1.99
142440666--142440827
78
2.1
78
82
4
193
22
20
27
28
1.99
142445293--142445447
65
2.3
68
76
14
151
36
16
26
21
1.94
142445350--142445479
66
1.9
67
84
10
174
33
16
30
20
1.94
142449622--142449683
32
1.9
32
93
0
106
33
19
22
24
1.97
142456681--142456885
54
3.8
53
71
10
157
20
23
17
38
1.93
142459333--142459450
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
142459301--142459464
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
142466903--142467020
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
142466871--142467034
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
142469782--142469882
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
142477690--142477789
29
3.5
28
87
5
121
29
14
27
30
1.95
142482881--142483048
40
4.2
40
82
3
178
25
26
22
26
2.00
142492023--142492070
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
142492114--142492172
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
142492223--142492341
47
2.5
48
89
8
172
27
21
24
26
1.99
142492223--142492341
24
5.0
24
84
9
154
27
21
24
26
1.99
142492533--142492596
31
2.1
31
96
0
119
39
15
21
23
1.92
142493539--142493577
21
2.0
20
90
10
62
17
53
20
7
1.68
142495088--142495125
14
2.7
14
87
0
58
15
2
0
81
0.80
142495077--142495118
20
2.1
20
86
0
57
16
4
0
78
0.91
142496988--142497013
11
2.4
11
100
0
52
61
15
15
7
1.55
142506982--142507203
46
4.8
46
81
7
270
29
28
19
22
1.98
142514062--142514171
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
142521632--142521766
29
4.7
29
86
3
155
23
31
15
29
1.95
142521578--142521767
58
3.3
58
77
4
179
24
33
16
26
1.96
142527989--142528097
38
2.8
40
84
8
143
22
23
29
23
1.99
142527989--142528097
40
2.8
37
86
8
137
22
23
29
23
1.99
142540925--142541025
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
142547783--142547917
30
4.5
30
85
1
148
25
48
3
22
1.67
142547783--142547917
60
2.2
60
84
5
166
25
48
3
22
1.67
142548485--142548632
25
5.8
25
70
16
79
33
6
4
56
1.43
142548458--142548591
54
2.5
54
80
11
143
34
5
3
55
1.42
142548789--142548822
8
4.6
7
92
3
50
32
0
2
64
1.08
142548782--142548829
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
142548743--142548822
7
11.0
7
72
19
51
30
2
2
65
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
142549465--142549498
17
1.9
17
88
5
50
58
5
0
35
1.22
142549612--142549694
27
3.1
26
76
11
62
56
1
3
38
1.24
142549668--142549712
18
2.4
19
85
3
56
55
0
0
44
0.99
142550072--142550115
21
2.1
21
87
8
63
31
4
0
63
1.14
142551808--142551852
22
2.0
22
100
0
90
26
22
17
33
1.96
142555804--142555837
15
2.3
15
90
10
52
64
0
0
35
0.94
142556051--142556087
14
2.6
15
83
12
51
16
2
0
81
0.81
142561453--142561486
6
5.5
6
96
3
59
14
0
0
85
0.60
142561447--142561493
18
2.5
19
74
19
53
14
8
0
76
1.01
142567279--142567564
48
6.0
48
78
6
258
27
16
29
26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770