Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  294  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89750105--89750246
40
3.5
40
82
1
124
27
24
26
21
1.99
89750143--89750272
40
3.3
39
78
11
147
23
24
26
24
2.00
89751338--89751513
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
89751335--89751506
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
89758448--89758623
46
3.8
46
79
12
207
21
21
28
28
1.98
89758445--89758616
93
1.8
93
94
0
308
21
21
29
27
1.99
89762397--89762466
27
2.5
28
86
2
97
32
25
14
27
1.94
89767853--89767977
46
2.8
43
82
7
133
30
17
26
25
1.97
89768044--89768176
49
2.7
49
80
6
162
27
20
28
24
1.99
89767908--89768166
142
1.8
138
84
8
353
25
17
29
26
1.98
89771958--89772017
30
2.0
30
90
0
93
43
1
23
31
1.64
89772353--89772459
42
2.5
42
75
8
110
27
17
26
28
1.98
89782256--89782510
55
4.8
53
79
9
263
36
18
24
20
1.94
89782264--89782462
108
1.8
109
90
4
321
35
18
24
21
1.96
89782702--89782732
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
89785369--89785648
50
5.6
50
78
4
242
26
16
25
32
1.96
89785418--89785599
101
1.8
101
87
0
274
27
18
24
30
1.98
89795662--89795834
48
3.6
47
85
3
220
29
18
28
23
1.98
89797091--89797132
18
2.3
18
100
0
84
26
35
28
9
1.88
89800053--89800101
26
1.9
25
87
4
71
30
14
10
44
1.78
89808304--89808482
96
1.9
96
86
2
261
26
12
17
43
1.84
89815997--89816022
13
2.0
13
100
0
52
30
0
7
61
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89818344--89818515
22
7.4
22
64
26
79
33
12
28
25
1.92
89818318--89818563
47
5.2
47
96
0
447
34
11
27
25
1.91
89820147--89820313
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
89832394--89832442
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
89833264--89833430
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
89837588--89837698
24
4.6
24
97
0
213
21
17
25
36
1.95
89837588--89837720
24
5.5
24
92
1
196
24
17
24
34
1.96
89843416--89843562
40
3.7
40
95
0
258
25
21
25
27
2.00
89843424--89843600
80
2.2
80
83
4
214
28
22
22
26
1.99
89851157--89851226
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
89859186--89859255
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
89865712--89865849
67
2.1
67
88
0
204
56
16
8
18
1.65
89871376--89871594
24
9.1
24
95
0
366
19
17
26
36
1.94
89874369--89874528
29
5.5
28
78
10
103
40
13
23
22
1.89
89874394--89874557
87
1.9
87
94
0
292
39
13
25
21
1.90
89874423--89874598
29
6.1
29
75
6
160
39
14
24
21
1.91
89878965--89879075
46
2.4
46
86
3
152
34
27
18
20
1.96
89884056--89884316
46
5.7
46
90
0
380
39
14
22
22
1.91
89884056--89884316
91
2.8
92
89
1
373
39
14
22
22
1.91
89884007--89884316
137
2.3
130
85
5
406
39
14
23
22
1.91
89886207--89886247
21
2.0
21
100
0
82
34
9
29
26
1.88
89886232--89886356
46
2.7
46
86
2
153
41
15
23
20
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89887082--89887161
30
2.7
30
83
11
101
57
15
16
11
1.65
89887082--89887152
15
4.7
15
72
19
67
59
12
16
11
1.61
89887084--89887161
15
5.2
15
73
14
63
57
15
15
11
1.65
89889205--89889307
29
3.6
29
92
2
154
26
15
32
26
1.96
89893374--89893502
46
2.8
46
92
2
197
31
27
20
20
1.98
89897047--89897235
105
1.8
103
82
6
247
19
18
27
34
1.95
89897466--89897519
24
2.2
24
86
0
81
25
1
22
50
1.59
89900927--89900994
27
2.5
27
87
0
91
39
14
20
25
1.91
89905539--89905606
27
2.5
27
87
0
91
39
14
20
25
1.91
89907300--89907325
12
2.2
12
100
0
52
38
23
11
26
1.89
89912798--89912823
12
2.2
12
100
0
52
38
23
11
26
1.89
89919106--89919221
51
2.3
51
80
0
133
39
6
12
41
1.68
89920885--89920919
17
2.0
17
88
5
52
28
40
17
14
1.88
89928145--89928215
26
2.7
26
75
0
79
33
26
21
18
1.96
89930773--89930858
43
2.0
43
82
8
104
26
29
18
25
1.98
89933272--89933490
40
5.6
40
79
6
232
26
25
22
26
2.00
89939702--89939868
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
89947973--89948124
39
3.9
39
92
1
243
23
20
32
23
1.98
89947974--89948124
77
1.9
79
93
2
261
23
20
31
23
1.98
89947974--89948153
39
4.6
39
87
2
236
23
21
31
23
1.98
89947980--89948153
79
2.2
77
87
2
240
23
21
32
22
1.98
89949715--89949881
40
4.2
40
83
5
223
26
28
21
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89949711--89949881
79
2.2
79
86
5
240
26
27
22
23
1.99
89953117--89953155
19
2.1
19
100
0
78
38
10
10
41
1.73
89956277--89956311
12
2.9
12
86
0
52
31
8
11
48
1.69
89966798--89966849
27
1.9
27
84
0
68
36
25
5
32
1.80
89966833--89966956
27
4.6
27
85
2
169
41
20
7
30
1.79
89966817--89966956
54
2.6
53
85
6
138
40
21
7
30
1.80
89966833--89966985
81
1.9
81
86
5
220
40
19
9
30
1.83
89966939--89967000
27
2.3
27
91
0
97
40
16
16
27
1.89
89966833--89966983
54
2.8
54
85
4
162
41
19
9
29
1.83
89966981--89967044
27
2.4
27
76
10
76
18
20
23
37
1.94
89967621--89967679
28
2.1
28
100
0
118
45
25
11
16
1.82
89968304--89968328
9
2.8
9
100
0
50
12
0
0
88
0.53
89982929--89982983
27
2.0
27
100
0
110
10
29
21
38
1.88
89983762--89983838
30
2.6
30
97
0
145
23
27
6
42
1.78
89983780--89983833
16
3.5
16
70
10
58
22
24
7
46
1.77
89989473--89989571
27
3.7
27
81
4
94
41
25
16
17
1.89
89990139--89990182
16
2.8
15
79
6
52
6
20
15
56
1.62
89992588--89992654
10
6.6
10
81
11
75
35
10
17
35
1.85
89992594--89992670
21
3.7
20
84
5
91
35
12
16
35
1.88
89992583--89992654
5
14.0
5
72
10
56
36
9
18
36
1.83
89995439--89995541
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
89998653--89998753
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89998682--89998757
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
90007149--90007277
40
3.3
39
76
10
136
24
27
23
24
2.00
90007165--90007273
39
2.8
38
84
9
123
21
29
24
24
1.99
90007165--90007313
79
1.9
79
83
8
196
22
26
23
27
1.99
90011019--90011119
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
90011048--90011123
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
90017533--90017782
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
90026526--90027205
340
2.0
340
98
0
1306
21
16
18
44
1.87
90028094--90028248
43
3.7
43
76
8
156
26
17
27
29
1.98
90032746--90032889
39
3.7
39
92
0
243
26
20
29
22
1.99
90032747--90032929
78
2.3
79
90
1
278
24
22
29
23
1.99
90040743--90040886
39
3.7
39
92
0
243
26
20
29
22
1.99
90040744--90040926
78
2.3
79
90
1
278
24
22
29
23
1.99
90050212--90050264
27
2.0
27
100
0
106
45
0
28
26
1.54
90051413--90051468
18
3.1
17
84
5
67
42
14
3
39
1.63
90051664--90051783
53
2.3
53
85
8
172
43
18
18
20
1.88
90053329--90053372
22
2.1
21
83
8
54
31
15
4
47
1.66
90061567--90061731
39
4.3
39
81
6
192
26
22
29
22
1.99
90063735--90063825
31
3.1
31
92
6
145
24
21
13
40
1.89
90064017--90064135
24
5.0
24
89
5
170
26
22
21
28
1.99
90064017--90064135
47
2.5
48
89
5
170
26
22
21
28
1.99
90064186--90064223
19
2.0
19
100
0
76
31
21
10
36
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90064267--90064314
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
90071805--90071922
31
3.5
35
89
9
135
22
23
16
37
1.94
90071828--90071922
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
90072113--90072208
24
4.0
24
87
4
131
27
22
21
28
1.99
90072259--90072297
20
2.0
20
100
0
78
30
20
10
38
1.86
90074226--90074305
33
2.5
31
85
4
97
7
36
11
45
1.68
90076465--90076614
39
3.9
39
87
2
187
30
18
4
46
1.69
90078127--90078168
22
1.9
22
85
9
59
23
52
9
14
1.71
90078262--90078310
21
2.4
19
78
21
55
8
0
26
65
1.20
90078266--90078341
22
3.3
21
76
21
73
13
1
27
57
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770