Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  460  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
141869982--141870066
40
2.1
40
82
4
100
25
21
27
25
1.99
141882689--141882714
13
2.0
13
100
0
52
15
23
0
61
1.33
141882724--141882851
64
2.0
64
90
3
204
32
19
13
35
1.90
141884761--141884901
29
4.9
29
95
0
246
26
14
31
27
1.95
141884761--141884921
87
1.9
87
89
0
250
26
14
31
26
1.95
141884761--141884978
87
2.5
87
82
4
235
25
15
32
27
1.95
141886376--141886897
131
4.0
131
89
1
773
29
22
22
25
1.99
141886387--141886710
42
7.5
42
66
12
134
28
23
23
25
2.00
141886848--141887156
88
3.5
87
87
5
428
34
19
22
23
1.96
141886848--141887144
87
3.4
86
88
5
411
34
19
21
24
1.96
141886954--141887104
44
3.5
44
70
14
125
34
20
23
21
1.97
141887613--141887723
45
2.5
45
82
10
138
23
24
26
26
2.00
141888335--141888364
15
1.9
16
93
6
53
76
16
6
0
0.99
141908383--141908416
17
1.9
17
88
5
50
41
23
2
32
1.69
141912588--141912649
30
2.1
30
90
0
97
19
43
0
37
1.51
141912902--141912960
18
3.4
18
75
13
61
23
28
0
47
1.52
141914071--141914138
33
2.1
33
100
0
136
44
14
11
29
1.81
141914836--141914879
23
1.9
23
85
0
61
79
2
9
9
1.02
141919188--141919224
12
3.0
12
84
7
56
35
5
0
59
1.20
141919330--141919444
10
11.7
10
68
23
57
35
4
2
57
1.32
141919462--141919497
7
5.0
7
86
6
54
30
2
0
66
1.06
141919462--141919502
15
2.8
14
82
10
55
31
2
2
63
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
141921597--141921675
19
4.2
19
87
9
117
36
10
17
35
1.84
141922039--141922085
25
1.9
24
86
4
67
34
8
6
51
1.58
141923222--141923298
35
2.2
35
97
0
145
20
16
19
42
1.89
141924429--141924471
23
2.0
21
86
9
59
13
16
20
48
1.80
141928403--141928452
21
2.4
20
77
9
55
84
0
12
4
0.76
141928414--141928452
13
2.9
14
84
3
53
84
0
10
5
0.76
141928415--141928452
16
2.4
15
87
12
58
84
0
10
5
0.77
141929362--141929544
44
4.1
44
73
11
149
33
18
21
26
1.96
141929494--141929942
87
5.1
93
65
17
252
33
19
19
27
1.96
141929643--141930117
87
5.4
87
64
16
239
32
18
20
28
1.96
141929496--141930077
175
3.3
174
92
0
914
32
19
19
27
1.96
141930544--141930611
19
3.7
19
86
7
104
35
10
16
38
1.82
141944034--141944243
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
141947179--141947281
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141947179--141947281
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53
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Indices
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Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
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1.99
141989298--141989503
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0
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
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Score
A
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1.99
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27
22
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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