Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  126  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36741240--36741436
81
2.4
81
90
0
313
30
20
7
41
1.80
36741240--36741462
81
2.8
81
84
2
216
31
20
7
39
1.81
36741456--36741637
27
6.8
26
83
6
172
39
20
9
30
1.85
36741429--36741603
81
2.2
81
80
6
194
41
19
9
29
1.82
36741625--36741902
27
10.3
27
91
0
459
33
21
22
23
1.98
36741622--36741902
134
2.1
135
91
1
465
33
20
22
23
1.98
36742322--36742400
31
2.5
31
89
0
113
20
18
12
48
1.81
36742322--36742409
6
14.3
6
71
17
65
20
18
13
47
1.82
36744207--36744245
20
2.0
20
89
0
60
35
12
2
48
1.55
36746137--36746184
23
2.0
25
88
8
73
77
4
8
10
1.12
36751402--36751443
16
2.6
16
77
11
50
73
4
7
14
1.21
36755077--36755369
47
6.2
47
91
0
451
27
28
8
35
1.86
36761874--36762043
43
4.0
42
80
7
175
31
27
18
23
1.97
36770015--36770168
84
1.8
84
87
2
229
31
26
17
24
1.97
36770015--36770168
43
3.6
43
80
6
188
31
26
17
24
1.97
36775585--36775620
16
2.2
16
95
0
63
50
11
22
16
1.77
36775849--36775924
29
2.7
29
84
8
95
25
15
31
27
1.96
36777793--36777900
37
2.9
37
94
0
180
25
32
19
22
1.97
36778063--36778389
47
7.0
47
88
0
465
25
29
12
32
1.93
36778080--36778390
141
2.2
141
92
0
514
27
28
11
32
1.92
36781491--36781548
26
2.2
26
96
0
107
17
13
29
39
1.88
36781643--36781717
26
3.0
26
80
3
82
21
20
17
41
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36785237--36785263
13
2.1
13
100
0
54
44
14
0
40
1.46
36785276--36785350
36
2.1
36
100
0
150
38
24
5
32
1.78
36786897--36786925
10
2.7
11
94
5
51
17
0
0
82
0.66
36791123--36791202
39
2.1
39
92
0
133
47
13
6
32
1.68
36796682--36796711
12
2.5
12
94
0
51
26
0
0
73
0.84
36797456--36797534
28
2.9
28
92
1
124
25
27
24
22
2.00
36805461--36805572
40
2.7
42
87
2
156
21
27
23
27
1.99
36805463--36805572
42
2.7
39
87
5
139
21
28
23
26
1.99
36807594--36807653
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
36814566--36814736
46
3.7
46
79
14
199
28
28
21
21
1.98
36814571--36814740
93
1.8
92
92
1
286
28
29
21
21
1.98
36815160--36815217
29
2.0
29
89
0
89
31
22
8
37
1.84
36819664--36819702
2
20.0
2
94
5
71
48
0
0
51
1.00
36821845--36821969
46
2.7
46
92
0
205
20
21
27
30
1.98
36823393--36823527
43
3.1
43
93
0
234
11
25
33
30
1.90
36831255--36831305
14
3.4
14
71
23
50
31
3
27
37
1.75
36831247--36831310
31
2.1
31
100
0
128
31
3
25
40
1.71
36835587--36835687
30
3.2
30
67
26
82
42
16
16
23
1.88
36835574--36835704
65
2.0
65
96
0
244
41
18
15
24
1.88
36839811--36839941
65
2.0
65
95
0
235
41
16
14
26
1.87
36839944--36839999
26
2.2
26
83
0
67
26
19
19
33
1.96
36841246--36841295
21
2.3
21
79
6
55
66
0
32
2
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36847031--36847181
40
3.8
40
77
11
141
26
24
27
21
2.00
36847068--36847197
40
3.2
40
79
2
154
23
23
28
23
2.00
36847030--36847197
80
2.1
80
82
6
207
26
23
27
22
2.00
36861117--36861233
41
3.1
41
73
23
146
48
27
0
23
1.56
36862879--36862932
27
2.0
27
85
0
72
38
7
14
38
1.75
36873517--36873647
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
36873516--36873647
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
36881475--36881605
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
36881474--36881605
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
36897260--36897350
40
2.3
40
84
0
110
31
23
23
21
1.98
36897225--36897412
80
2.3
80
76
12
188
26
22
27
23
2.00
36902840--36902895
17
3.2
17
66
14
51
26
3
33
35
1.74
36902848--36902906
18
3.3
18
68
13
59
28
3
30
37
1.74
36902875--36903050
47
3.7
47
86
3
237
30
7
32
29
1.85
36902875--36903050
93
1.9
95
84
5
241
30
7
32
29
1.85
36910739--36910790
26
2.0
26
88
7
79
36
0
15
48
1.45
36916944--36917115
93
1.8
93
94
0
308
27
30
21
20
1.98
36916936--36917111
46
3.8
46
82
7
221
28
30
21
20
1.98
36927066--36927238
48
3.7
48
77
9
153
27
27
18
26
1.98
36927151--36927292
48
3.0
48
93
0
230
28
25
20
26
1.99
36936045--36936100
19
3.2
19
61
23
50
28
10
7
53
1.62
36936033--36936100
33
2.1
33
100
0
136
26
11
8
52
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36939284--36939436
40
3.8
40
77
5
139
25
27
23
23
2.00
36942941--36943026
37
2.3
37
93
0
154
22
33
19
24
1.97
36943127--36943439
49
6.5
47
94
3
468
30
31
8
30
1.87
36946192--36946359
56
3.0
55
85
5
212
27
14
24
33
1.94
36948641--36948874
48
5.0
48
75
9
221
29
24
18
27
1.98
36958376--36958407
12
2.7
12
95
0
55
9
12
12
65
1.47
36960634--36960682
22
2.3
22
79
10
57
53
2
0
44
1.12
36960787--36960812
1
26.0
1
100
0
52
0
0
0
100
0.00
36960863--36960895
17
1.9
17
93
0
57
42
0
12
45
1.41
36966022--36966064
4
11.8
4
85
14
58
18
0
0
81
0.69
36967748--36967809
26
2.4
26
89
5
99
35
29
8
27
1.85
36968660--36968694
15
2.3
15
85
0
52
65
8
14
11
1.46
36971030--36971072
21
2.1
21
86
4
61
25
2
23
48
1.62
36973394--36973564
40
4.2
40
75
5
157
23
25
22
28
1.99
36977352--36977400
23
2.1
23
100
0
98
42
12
12
32
1.79
36977762--36977805
21
2.1
21
91
4
72
25
0
25
50
1.50
36979948--36980157
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
36982514--36982545
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
36984623--36984727
39
2.7
39
92
0
174
31
20
23
23
1.98
36992561--36992783
40
5.6
40
85
7
292
25
26
23
24
2.00
37000686--37000907
40
5.6
40
81
8
247
25
25
22
25
2.00
37009193--37009368
46
3.8
46
72
14
155
29
27
19
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37009200--37009371
93
1.8
93
88
2
265
28
27
20
23
1.99
37009294--37009379
46
1.9
45
88
4
129
30
29
19
20
1.97
37011766--37011843
30
2.6
30
74
8
77
55
15
16
12
1.70
37011790--37011835
15
3.1
14
82
11
56
54
13
15
17
1.71
37014658--37014744
24
3.6
24
93
0
156
35
25
16
22
1.94
37017818--37017987
93
1.8
93
94
0
304
27
29
21
21
1.99
37017809--37017984
46
3.8
46
78
12
198
28
29
21
20
1.98
37017860--37017996
47
3.0
46
75
16
140
29
29
19
21
1.98
37021500--37021539
6
6.5
6
82
5
53
17
5
0
77
0.94
37024723--37024840
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
37024691--37024854
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
37030551--37030668
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
37030519--37030682
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
37032742--37032809
28
2.4
28
88
9
95
32
26
13
27
1.93
37040533--37040602
28
2.5
28
88
9
99
31
27
14
27
1.95
37044773--37044936
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
37044773--37044970
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
37052348--37052511
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
37052348--37052545
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
37056341--37056550
40
5.2
40
92
2
307
23
22
26
27
2.00
37064229--37064384
40
3.9
40
93
1
260
30
25
19
23
1.98
37070228--37070326
28
3.5
29
86
4
105
31
27
13
28
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37075507--37075673
40
4.2
40
93
0
282
28
26
21
22
1.99
37079958--37079991
3
11.3
3
100
0
68
35
0
0
64
0.94
37080996--37081054
29
2.0
29
100
0
118
47
20
8
23
1.77
37085616--37085640
13
1.9
13
100
0
50
32
16
16
36
1.90
37087149--37087562
48
8.6
48
96
0
765
33
7
27
31
1.86
37087607--37087692
37
2.3
37
97
0
163
25
19
31
23
1.98
37090163--37090362
52
3.8
52
75
7
154
20
24
17
38
1.93
37093717--37093799
43
1.9
43
80
9
98
25
16
24
33
1.96
37096690--37096769
29
2.7
29
86
5
108
27
32
15
25
1.95
37110269--37110439
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770