Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  746  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236394824--236394910
24
3.6
24
96
0
165
21
17
25
35
1.95
236394824--236394932
48
2.3
48
91
3
175
24
17
23
33
1.96
236394824--236394932
24
4.5
24
90
2
157
24
17
23
33
1.96
236397499--236397696
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
236397565--236397682
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
236397533--236397696
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
236405069--236405266
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
236405135--236405252
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
236405103--236405266
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
236407741--236407814
29
2.6
27
82
14
87
14
12
1
71
1.21
236407771--236407813
22
2.0
22
86
9
61
13
9
0
76
1.01
236410135--236410192
22
2.7
21
76
10
53
41
15
5
37
1.70
236410173--236410278
19
5.8
19
85
10
159
35
14
10
39
1.80
236410185--236410276
17
5.5
15
85
8
69
34
15
9
40
1.80
236410173--236410278
54
1.9
55
94
1
187
35
14
10
39
1.80
236411930--236412022
24
3.9
24
92
0
141
37
4
36
21
1.73
236413327--236413366
22
1.9
22
85
10
57
17
15
20
47
1.83
236413629--236413715
32
2.6
34
78
10
92
27
19
26
26
1.99
236413629--236413703
33
2.2
35
81
9
93
30
17
24
28
1.97
236415250--236415291
21
2.0
21
95
0
75
23
16
28
30
1.96
236419891--236420022
29
4.6
29
82
1
140
25
32
17
25
1.97
236427791--236427863
29
2.6
29
84
4
96
23
34
16
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236432171--236432338
40
4.2
40
80
4
178
24
26
24
25
2.00
236432187--236432336
80
1.9
80
84
2
203
22
26
26
25
2.00
236435336--236435502
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
236443327--236443456
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
236443343--236443494
40
3.8
40
78
6
148
22
26
23
27
1.99
236443343--236443492
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
236446663--236446769
42
2.5
42
96
0
196
28
14
33
22
1.94
236446777--236446846
27
2.5
28
86
2
97
27
14
25
32
1.94
236450529--236450646
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
236450497--236450660
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
236458022--236458219
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
236458088--236458205
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
236458056--236458219
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
236465640--236465757
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
236465607--236465771
71
2.3
71
98
1
321
35
17
27
18
1.94
236468164--236468392
26
8.6
27
83
7
254
24
21
19
34
1.97
236468154--236468392
53
4.5
54
83
5
290
24
21
20
33
1.97
236468164--236468392
79
2.9
79
86
4
309
24
21
19
34
1.97
236470154--236470363
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
236475992--236476134
39
3.7
38
80
5
142
22
28
23
25
1.99
236475983--236476129
79
1.9
79
82
2
188
22
30
24
22
1.99
236481426--236481599
86
2.0
86
94
4
307
22
31
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236484019--236484167
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
236484060--236484167
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
236487961--236488025
22
2.9
23
79
6
80
66
6
4
23
1.33
236487993--236488236
3
82.3
3
69
14
105
57
2
7
31
1.41
236488236--236488267
16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
236488296--236488347
22
2.3
23
80
3
61
55
0
11
32
1.36
236488370--236488407
16
2.4
16
86
8
51
63
0
7
28
1.23
236488507--236488549
3
14.3
3
100
0
86
67
0
0
32
0.91
236488643--236488687
3
14.7
3
95
4
81
64
0
0
35
0.94
236489604--236489689
44
2.0
43
86
6
120
25
27
16
30
1.97
236489743--236490527
203
3.9
205
92
2
1307
29
23
18
28
1.98
236498465--236498514
15
3.5
14
79
15
50
42
8
24
26
1.82
236511662--236511829
40
4.2
40
80
3
196
25
22
27
25
2.00
236519465--236519648
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
236519505--236519693
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
236525155--236525200
8
5.5
8
82
7
56
80
2
2
15
0.91
236525155--236525201
17
2.8
16
81
9
58
78
2
2
17
0.94
236525892--236525922
13
2.3
14
94
5
55
41
0
6
51
1.27
236526005--236526036
12
2.7
12
95
0
55
37
0
0
62
0.95
236526182--236526224
21
2.1
20
83
12
52
34
13
4
46
1.65
236538570--236538708
71
2.0
71
95
0
251
31
13
23
31
1.93
236538655--236538754
52
1.9
52
87
0
146
27
14
29
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236538707--236538946
123
1.9
123
84
8
317
26
15
20
37
1.92
236538962--236539137
67
2.6
66
82
6
203
28
16
17
37
1.92
236541155--236541185
13
2.3
14
94
5
55
41
0
6
51
1.27
236541268--236541299
12
2.7
12
95
0
55
37
0
0
62
0.95
236541360--236541424
25
2.6
24
83
16
71
30
1
4
63
1.24
236541445--236541487
21
2.1
20
83
12
52
34
13
4
46
1.65
236551592--236551693
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
236559443--236559544
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
236564911--236565073
39
4.2
39
91
0
263
23
33
20
22
1.97
236566967--236567183
40
5.5
40
90
3
298
25
28
23
22
2.00
236575172--236575425
40
6.5
40
88
5
333
25
28
23
22
1.99
236575172--236575425
78
3.2
79
88
4
331
25
28
23
22
1.99
236577361--236577417
26
2.2
26
83
3
69
31
19
14
35
1.91
236580813--236580851
20
2.0
20
90
10
62
35
20
7
35
1.81
236588665--236588795
40
3.3
40
85
0
172
24
27
21
26
1.99
236588682--236588833
40
3.8
40
85
3
171
23
26
22
28
1.99
236596699--236596829
40
3.3
40
85
0
172
24
27
21
26
1.99
236596716--236596866
40
3.8
40
85
4
180
23
25
22
28
1.99
236599744--236599790
3
16.0
3
95
4
87
65
0
0
34
0.93
236599897--236599938
3
14.0
3
85
9
59
64
2
0
33
1.07
236604133--236604168
11
3.2
12
88
11
58
47
0
52
0
1.00
236604265--236604308
13
3.5
13
87
12
74
13
0
6
79
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236604267--236604307
11
3.5
11
93
6
64
14
0
7
78
0.96
236604689--236604759
35
2.0
35
94
0
124
25
9
46
18
1.79
236605562--236605833
72
3.8
72
92
1
438
33
19
16
30
1.94
236605820--236605848
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
236616967--236617003
18
2.1
18
100
0
74
56
21
5
16
1.59
236619345--236619397
21
2.4
21
84
15
63
60
0
11
28
1.31
236619471--236619500
12
2.5
12
88
0
51
56
3
6
33
1.42
236619436--236619579
18
7.4
18
67
20
69
58
3
4
34
1.34
236619480--236619580
37
2.6
37
81
6
103
62
3
1
31
1.25
236619519--236619580
26
2.4
27
81
13
76
62
3
0
33
1.11
236621231--236621631
138
2.9
137
92
2
637
36
20
17
25
1.94
236621565--236621767
73
2.8
71
82
4
246
33
24
15
26
1.95
236621821--236621977
58
2.8
56
89
6
246
37
17
15
29
1.90
236622118--236622252
68
2.0
69
89
1
209
32
25
14
27
1.95
236622279--236622412
71
1.9
71
89
3
207
29
22
16
31
1.96
236622129--236622503
160
2.4
158
95
1
673
32
22
17
28
1.96
236634947--236634985
19
2.0
20
90
10
62
61
0
12
25
1.31
236635062--236635127
19
3.6
19
72
22
52
60
3
6
30
1.36
236638388--236638517
29
4.5
30
86
9
171
32
13
25
28
1.94
236644473--236644656
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
236652587--236652770
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
236656850--236657184
121
2.8
122
91
3
534
31
10
24
33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236657153--236657395
40
6.1
40
83
7
269
25
21
25
27
1.99
236657153--236657395
81
3.0
79
83
4
265
25
21
25
27
1.99
236660052--236660178
40
3.2
40
81
5
134
26
22
27
22
1.99
236668005--236668129
39
3.2
40
78
7
116
26
23
27
23
2.00
236675479--236675665
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
236675502--236675665
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
236675502--236675699
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
236689217--236689384
47
3.6
49
76
13
165
28
18
32
20
1.96
236689173--236689530
94
3.8
92
77
8
357
29
18
29
22
1.98
236691189--236691230
19
2.2
19
100
0
84
59
19
4
16
1.54

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770