Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  396  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121661719--121661926
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
121661720--121661926
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
121665472--121665693
46
4.7
50
76
10
166
25
30
17
26
1.97
121665476--121665606
50
2.7
49
80
5
149
27
29
16
25
1.97
121679960--121680126
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
121684907--121685036
40
3.2
40
82
2
172
24
27
23
24
2.00
121684923--121685073
40
3.8
39
81
6
153
22
27
23
27
1.99
121684907--121685073
80
2.1
79
83
7
205
23
26
22
26
2.00
121691390--121691519
40
3.2
40
82
2
172
24
27
23
24
2.00
121691406--121691556
40
3.8
39
81
6
153
22
27
23
27
1.99
121691390--121691556
80
2.1
79
83
7
205
23
26
22
26
2.00
121702837--121703204
45
8.0
45
71
10
208
33
19
21
26
1.97
121702741--121703214
232
2.0
233
86
2
657
32
19
21
27
1.97
121703651--121703698
14
3.4
14
85
0
60
37
39
6
16
1.74
121704855--121704923
26
2.7
26
88
0
102
36
4
1
57
1.27
121705091--121705120
3
10.0
3
92
0
51
33
3
0
63
1.11
121711481--121711586
40
2.7
40
84
0
140
23
27
22
26
2.00
121722128--121722166
21
1.9
20
85
15
53
17
12
10
58
1.61
121724887--121724911
12
2.1
12
100
0
50
32
24
24
20
1.98
121727397--121727444
5
9.6
5
100
0
96
81
0
0
18
0.70
121733555--121733588
14
2.4
14
100
0
68
20
38
17
23
1.93
121738701--121738830
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
121738701--121738864
40
4.1
40
78
4
145
21
28
25
25
1.99
121742267--121742407
40
3.5
40
85
0
174
24
26
21
26
2.00
121742267--121742445
40
4.5
39
79
6
153
23
25
22
29
1.99
121752245--121752337
29
3.2
29
87
0
123
33
16
27
22
1.95
121752245--121752350
29
3.7
29
82
5
115
30
16
31
22
1.95
121760176--121760268
29
3.2
29
87
0
123
33
16
27
22
1.95
121760176--121760281
29
3.7
29
82
5
115
30
16
31
22
1.95
121766612--121766659
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
121766707--121766762
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
121766696--121766762
20
3.3
20
93
0
116
34
11
20
32
1.90
121766813--121766930
24
4.9
24
88
4
150
27
22
20
30
1.98
121767124--121767187
31
2.1
31
93
0
110
37
15
23
23
1.93
121770100--121770130
16
1.9
16
93
0
53
41
0
16
41
1.48
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28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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1.99
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
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1.99
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Period
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Copy
Number
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Percent
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130
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25
16
21
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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