Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  476  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147072320--147072531
40
5.3
40
82
2
212
24
26
22
26
2.00
147072320--147072531
80
2.7
80
82
2
248
24
26
22
26
2.00
147082781--147082948
40
4.2
40
79
4
151
24
27
23
25
2.00
147084188--147084222
15
2.3
15
90
0
52
0
8
5
85
0.73
147090823--147090908
40
2.2
40
91
0
136
23
30
25
20
1.99
147090839--147090948
40
2.7
41
86
8
138
20
29
26
23
1.99
147092227--147092264
18
2.1
18
90
0
58
0
13
5
81
0.85
147097558--147097813
49
5.3
49
94
2
448
30
30
7
31
1.86
147110304--147110475
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
147110296--147110471
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
147117617--147117732
46
2.5
46
83
5
153
29
20
26
23
1.99
147117749--147117925
47
3.7
47
78
9
160
28
19
27
24
1.98
147119083--147119122
21
2.0
20
85
5
53
20
40
17
22
1.92
147123986--147124176
40
4.8
39
78
7
172
23
28
24
24
1.99
147124026--147124176
78
1.9
80
85
5
209
23
28
23
25
1.99
147127495--147127543
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
147128362--147128528
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
147137824--147137990
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
147143247--147143306
15
4.0
15
77
0
57
43
30
5
21
1.74
147144362--147144592
43
5.4
43
81
0
228
29
25
16
28
1.96
147144362--147144619
43
6.0
43
79
0
122
29
25
16
28
1.97
147148327--147148367
9
4.6
9
90
0
64
31
0
19
48
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147152949--147152974
13
2.0
13
100
0
52
23
23
30
23
1.99
147156000--147156061
18
3.4
18
71
8
63
33
0
22
43
1.54
147157399--147157465
32
2.1
31
86
8
91
40
1
1
56
1.17
147161636--147161803
40
4.2
40
79
3
178
25
22
26
25
2.00
147161636--147161803
80
2.1
80
82
3
196
25
22
26
25
2.00
147168192--147168241
18
2.7
18
85
14
75
34
0
36
30
1.58
147169011--147169092
7
11.7
7
72
0
65
42
35
2
19
1.65
147169013--147169092
21
3.8
21
78
3
81
43
33
2
20
1.65
147169222--147169403
7
25.4
7
72
6
60
52
27
1
19
1.53
147169229--147169304
22
3.5
22
76
7
66
53
27
2
15
1.55
147169328--147169404
15
5.4
14
75
9
66
51
25
0
22
1.48
147176911--147177052
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
21
1.99
147176949--147177078
40
3.2
40
82
2
163
23
23
27
25
2.00
147186407--147186536
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
147186407--147186573
40
4.2
40
79
5
153
22
27
23
25
2.00
147194453--147194582
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
147194453--147194615
40
4.1
40
78
4
143
22
28
24
25
1.99
147200389--147200655
46
5.7
44
78
12
202
25
31
17
25
1.97
147200387--147200663
94
3.0
93
79
11
309
26
31
16
25
1.97
147203647--147203809
39
4.2
39
95
0
281
22
19
33
25
1.97
147203664--147203838
78
2.2
78
88
3
253
22
21
32
24
1.98
147211605--147211758
39
3.9
40
89
0
213
22
19
32
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147211605--147211758
79
1.9
79
85
2
211
22
19
32
25
1.97
147213731--147213764
18
1.9
18
88
5
52
11
26
47
14
1.79
147213880--147214197
27
11.9
27
81
5
288
24
14
21
40
1.90
147213890--147214156
132
2.0
132
82
0
327
24
13
21
40
1.90
147214509--147214544
18
2.0
18
94
0
63
19
22
13
44
1.86
147218293--147218367
23
3.2
23
62
23
57
29
10
32
28
1.90
147218268--147218436
47
3.6
47
95
0
284
30
12
31
26
1.93
147218410--147218499
46
2.0
46
88
0
135
34
7
30
27
1.85
147218501--147218529
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
147220790--147221330
40
13.6
40
95
0
913
26
22
25
24
2.00
147224085--147224159
23
3.2
23
62
23
57
29
10
32
28
1.90
147224060--147224228
47
3.6
47
95
0
284
30
12
31
26
1.93
147224202--147224291
46
2.0
46
88
0
135
34
7
30
27
1.85
147224293--147224317
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
147226316--147226395
42
1.9
42
84
2
108
33
30
15
21
1.94
147228095--147228278
67
2.9
63
76
8
183
29
17
30
22
1.97
147232481--147232630
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
147232505--147232688
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
147242390--147242463
33
2.3
33
86
6
100
44
4
0
51
1.20
147242456--147242675
11
21.4
10
69
24
97
65
2
2
29
1.21
147242505--147242585
22
3.4
24
82
17
114
69
3
3
23
1.21
147242573--147242627
13
4.4
13
93
2
87
67
0
0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147242579--147242675
15
6.7
15
75
12
78
63
0
3
32
1.10
147242522--147242685
43
3.7
42
74
16
118
66
1
3
28
1.16
147242481--147242677
49
4.0
50
75
14
139
65
2
3
28
1.21
147242621--147242724
20
5.4
20
69
21
62
59
0
5
33
1.28
147242523--147242683
13
11.8
14
66
26
55
66
1
3
28
1.16
147242699--147242782
26
3.6
23
69
13
64
53
3
0
42
1.18
147242703--147242791
23
3.7
26
71
13
82
51
4
1
42
1.29
147248430--147248460
15
2.1
15
100
0
62
19
12
0
67
1.22
147249135--147249168
16
2.1
17
94
5
61
64
0
11
23
1.26
147250069--147250130
16
4.0
15
74
13
54
20
9
11
58
1.61
147250087--147250137
16
3.2
16
97
0
93
21
11
13
52
1.72
147251455--147251488
14
2.4
14
90
5
50
67
0
17
14
1.23
147252761--147252811
19
3.0
16
76
15
57
66
0
0
33
0.92
147252759--147252868
25
4.5
24
73
17
84
60
0
2
36
1.11
147252804--147252839
15
2.3
16
95
4
65
55
0
5
38
1.23
147252753--147252868
37
3.2
33
79
19
101
61
0
2
36
1.10
147252757--147252868
23
4.8
24
76
10
106
60
0
2
36
1.11
147252759--147252889
23
5.7
22
77
12
81
60
0
3
36
1.12
147253277--147253303
13
2.1
13
100
0
54
48
0
7
44
1.31
147253464--147253513
19
2.5
21
84
9
70
36
2
0
62
1.07
147253590--147253628
17
2.3
17
86
8
53
23
2
5
69
1.21
147253764--147253795
15
2.0
17
88
11
50
31
3
9
56
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147254418--147254460
18
2.4
18
88
0
59
69
6
13
9
1.35
147259185--147259215
15
2.1
15
100
0
62
12
19
19
48
1.81
147262630--147262713
20
4.4
19
73
23
70
33
5
1
59
1.29
147262635--147262684
16
2.8
17
85
11
57
36
8
0
56
1.29
147264417--147264453
18
2.1
18
89
0
56
54
0
24
21
1.45
147267306--147267339
17
2.0
17
94
0
59
38
2
11
47
1.55
147276309--147276361
24
2.2
25
86
10
74
41
0
0
58
0.98
147276308--147276377
24
3.0
23
73
20
65
41
0
0
58
0.98
147276342--147276377
15
2.5
14
86
8
54
41
0
0
58
0.98
147276549--147276587
21
1.9
21
94
5
71
30
25
10
33
1.89
147279114--147279138
12
2.1
12
100
0
50
44
0
8
48
1.32
147290064--147290212
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
147290105--147290212
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
147298177--147298325
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
147298218--147298325
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
147304228--147304394
43
3.9
42
77
6
158
29
16
22
31
1.96
147309246--147309317
28
2.5
29
93
2
128
27
15
30
26
1.96
147309301--147309377
29
2.7
29
77
0
82
22
18
35
24
1.96
147309246--147309377
58
2.3
58
81
6
144
25
16
33
25
1.96
147317044--147317116
29
2.5
29
93
0
128
28
15
30
26
1.96
147317100--147317176
29
2.7
29
77
0
82
22
18
35
24
1.96
147317044--147317176
58
2.3
59
81
5
146
25
16
33
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147321486--147321637
43
3.5
42
84
7
189
30
26
19
23
1.98
147327499--147327544
24
2.0
23
83
12
58
26
13
13
47
1.78
147335011--147335161
40
3.8
39
76
10
119
23
26
23
26
2.00
147335011--147335160
80
1.9
80
82
8
189
23
26
23
26
2.00
147336386--147336429
20
2.2
20
100
0
88
77
0
13
9
0.99
147345513--147345696
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
147360700--147360761
28
2.2
28
80
2
72
32
24
22
20
1.98
147365139--147365176
15
2.5
15
100
0
76
36
0
5
57
1.21
147365138--147365187
15
3.3
15
88
5
66
38
0
4
58
1.17
147365351--147365403
26
2.0
26
100
0
106
49
11
7
32
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770