genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.642.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  642  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
201744577--201744611	13	2.7	13	95	0	61	22	0	5	71	1.07
201745971--201746030	29	2.1	29	100	0	120	23	10	21	45	1.82
201749302--201749519	40	5.5	40	85	4	266	22	23	28	25	1.99
201751146--201751334	23	8.1	23	94	2	308	28	21	22	28	1.99
201751146--201751336	70	2.7	71	92	3	325	28	20	22	28	1.99
201751125--201751336	93	2.3	94	91	4	347	27	21	22	27	1.99
201751393--201751449	9	5.9	9	73	15	51	35	21	8	35	1.84
201751381--201751451	20	3.5	20	94	0	124	32	21	11	35	1.89
201751386--201751440	11	5.4	11	70	16	55	30	20	12	36	1.90
201752748--201753008	27	9.7	27	85	5	323	40	8	23	28	1.83
201752749--201753008	81	3.2	80	86	5	364	40	8	23	28	1.83
201756107--201756292	24	8.0	24	88	8	262	28	21	21	28	1.99
201756127--201756292	46	3.6	46	89	6	266	28	21	21	28	1.98
201756121--201756289	91	1.9	91	92	2	286	27	21	21	28	1.99
201756353--201756409	9	5.9	9	73	15	51	35	21	8	35	1.84
201756341--201756411	20	3.5	20	94	0	124	32	21	11	35	1.89
201756346--201756400	11	5.4	11	70	16	55	30	20	12	36	1.90
201757697--201757958	27	9.7	27	85	4	316	40	8	22	28	1.83
201757698--201757958	81	3.2	80	84	7	348	40	8	22	28	1.83
201761093--201761382	41	7.1	39	86	7	332	34	24	23	17	1.95
201761094--201761382	82	3.5	81	85	6	370	34	24	23	16	1.95
201761743--201761786	14	3.2	13	81	12	52	18	0	43	38	1.50
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
201762337--201762399	19	3.3	19	95	2	108	66	6	4	22	1.33
201762424--201762475	15	3.5	15	78	5	61	21	0	32	46	1.52
201764768--201764874	25	4.2	26	96	2	184	33	3	25	37	1.74
201766356--201766407	25	2.0	26	85	3	70	36	23	13	26	1.92
201770569--201770652	26	3.2	26	96	0	150	33	4	25	36	1.77
201772132--201772183	25	2.0	26	85	3	70	36	23	13	26	1.92
201776346--201776454	51	2.1	52	93	1	184	33	5	24	36	1.79
201776346--201776454	26	4.2	26	96	2	184	33	5	24	36	1.79
201782154--201782263	26	4.2	26	97	0	184	33	5	24	36	1.79
201787935--201788044	26	4.2	26	97	0	184	33	5	24	36	1.79
201791930--201792004	37	2.1	36	97	2	141	54	16	8	21	1.67
201794557--201794739	40	4.6	40	82	9	207	25	28	22	24	1.99
201794559--201794740	79	2.3	80	83	6	219	25	28	22	24	2.00
201797837--201797946	40	2.8	39	85	10	143	21	29	25	23	1.99
201805831--201805996	40	4.2	39	81	5	174	24	27	23	24	2.00
201805831--201805954	39	3.2	38	82	12	153	23	29	24	22	1.99
201807422--201807553	29	4.6	29	88	0	165	29	15	31	24	1.95
201815232--201815363	29	4.6	29	90	0	174	28	15	31	25	1.95
201823048--201823179	29	4.6	29	88	0	165	29	15	31	24	1.95
201832148--201832279	29	4.6	29	84	1	140	25	17	32	25	1.97
201834651--201834696	23	2.0	23	87	8	67	21	2	47	28	1.62
201836745--201836774	12	2.5	12	100	0	60	36	0	23	40	1.55
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
201837095--201837123	12	2.4	12	100	0	58	24	41	27	6	1.80
201841328--201841396	34	2.0	34	83	5	86	28	26	18	26	1.98
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201843577--201843614	19	2.0	20	85	15	53	36	0	23	39	1.55
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