Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  91  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26580811--26580846
11
3.2
11
92
4
54
86
0
13
0
0.58
26580809--26580840
16
2.0
16
93
0
55
90
0
9
0
0.45
26585454--26585698
41
6.0
41
92
0
366
31
21
25
22
1.98
26586001--26586036
15
2.5
15
90
4
56
22
0
33
44
1.53
26586253--26586303
22
2.4
22
80
9
61
27
3
21
47
1.68
26586310--26586341
7
4.6
7
100
0
64
12
0
43
43
1.42
26586296--26586349
21
2.5
21
80
19
67
18
0
40
40
1.51
26590979--26591160
40
4.6
40
79
8
176
24
24
28
23
2.00
26590979--26591160
78
2.3
80
82
6
210
24
24
28
23
2.00
26599019--26599200
40
4.6
40
79
8
176
24
24
28
23
2.00
26599019--26599200
78
2.3
80
82
6
210
24
24
28
23
2.00
26602583--26602630
25
1.9
25
83
8
62
50
4
6
39
1.47
26602713--26602808
43
2.2
43
88
3
149
21
17
31
29
1.96
26612827--26612870
22
2.0
22
100
0
88
31
31
9
27
1.88
26617393--26617644
63
3.9
64
77
11
201
24
29
17
29
1.97
26618109--26618169
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
26619431--26619495
7
9.0
7
77
22
64
43
0
0
56
0.99
26619438--26619495
2
33.0
2
75
25
60
44
0
0
55
0.99
26619440--26619494
5
11.0
5
88
7
85
43
0
0
56
0.99
26620762--26620803
15
2.9
15
92
3
68
38
0
11
50
1.40
26621174--26621260
21
4.0
23
74
15
94
16
20
25
37
1.93
26621452--26621498
18
2.6
18
79
0
58
31
12
14
40
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26625878--26625931
5
10.6
5
92
4
90
42
0
0
57
0.98
26627174--26627230
15
3.9
15
90
2
89
36
0
12
50
1.40
26627601--26627687
21
4.0
23
80
10
92
14
21
25
37
1.92
26627879--26627925
18
2.6
18
79
0
58
31
12
14
40
1.84
26628935--26628987
26
2.0
26
92
0
88
30
16
20
32
1.95
26631191--26631308
31
3.5
35
89
9
135
22
23
16
37
1.94
26631214--26631308
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
26633444--26633573
40
3.3
39
83
4
163
23
28
25
23
1.99
26641463--26641592
40
3.3
39
83
4
163
23
28
25
23
1.99
26644216--26644297
23
3.5
22
68
22
67
25
9
3
60
1.44
26644223--26644321
49
2.0
49
100
0
198
26
10
4
59
1.47
26644574--26644617
20
2.2
20
84
8
54
20
2
9
68
1.28
26648824--26648996
46
3.8
44
77
12
179
28
29
19
21
1.98
26648832--26649001
92
1.8
92
92
2
288
28
30
20
21
1.98
26648874--26649016
46
3.1
46
73
16
143
29
28
19
22
1.98
26651381--26651469
30
3.0
30
80
11
103
56
15
16
11
1.67
26651381--26651462
15
5.5
15
80
7
87
56
17
17
9
1.67
26654415--26654586
93
1.8
93
87
0
254
28
27
20
23
1.99
26654409--26654582
46
3.8
46
76
10
165
29
26
20
23
1.98
26675144--26675244
43
2.3
45
81
6
109
30
15
24
28
1.96
26675050--26676045
178
5.6
177
86
1
1271
30
18
23
28
1.97
26678447--26678480
16
2.1
17
88
5
52
44
5
2
47
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26687865--26687898
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
26696486--26696573
25
3.5
26
82
1
81
34
21
19
25
1.96
26702356--26702390
18
1.9
18
88
11
54
31
5
0
62
1.18
26702352--26702403
8
6.4
8
78
12
61
34
3
0
61
1.14
26705986--26706021
16
2.3
16
90
4
56
88
2
8
0
0.59
26706017--26706051
15
2.3
15
90
0
52
62
28
0
8
1.24
26708618--26708653
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
26713845--26714108
71
3.7
69
83
6
323
25
14
22
37
1.92
26713987--26714233
122
2.0
124
89
3
383
24
13
22
39
1.90
26713678--26714270
263
2.3
257
94
2
1033
25
14
22
36
1.93
26714108--26714548
72
6.1
71
68
10
288
25
16
21
36
1.94
26714319--26714559
74
3.3
72
76
9
245
26
17
20
35
1.95
26714554--26714713
74
2.1
76
88
4
236
28
19
21
31
1.97
26714553--26715271
79
9.1
75
68
17
244
29
18
19
32
1.96
26714392--26715189
165
4.9
164
85
7
915
28
18
20
32
1.96
26714734--26714878
74
1.9
76
88
5
224
30
18
22
28
1.97
26714907--26715413
72
6.5
73
74
13
397
29
16
18
34
1.94
26714906--26715623
88
9.0
76
73
14
418
28
16
18
35
1.94
26715395--26715456
30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83
26715046--26715624
254
2.3
248
85
6
753
27
16
18
36
1.93
26716270--26716306
17
2.2
17
90
4
58
89
2
8
0
0.58
26716273--26716306
12
2.9
11
91
8
50
88
2
8
0
0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26722922--26723043
62
2.0
62
98
0
235
40
3
23
32
1.71
26723172--26723202
6
5.2
6
100
0
62
16
16
35
32
1.91
26731100--26731135
3
12.0
3
100
0
72
33
0
0
66
0.92
26735288--26735409
54
2.3
54
92
0
199
38
23
8
29
1.84
26736523--26736567
11
3.9
11
80
11
54
35
0
2
62
1.08
26738406--26738710
46
6.6
46
85
0
378
41
12
24
21
1.87
26738416--26738717
138
2.2
138
88
0
433
41
13
23
21
1.88
26745204--26745229
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
26748789--26748822
17
1.9
18
88
5
52
29
32
0
38
1.58
26755734--26755801
31
2.2
31
91
0
109
33
11
7
47
1.68
26759416--26759479
26
2.5
26
87
5
87
37
26
0
35
1.57
26773657--26773685
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
26778509--26778608
51
1.9
52
84
9
134
29
18
6
47
1.72
26780378--26780466
25
3.6
24
80
6
97
33
22
23
20
1.97
26789593--26789926
121
2.8
121
87
3
467
43
19
15
21
1.88
26795164--26795290
47
2.7
47
84
6
168
25
27
20
26
1.99
26795168--26795441
48
5.7
48
82
0
298
28
28
17
25
1.98
26800495--26800533
19
2.1
19
95
0
69
46
12
0
41
1.42
26802543--26802572
15
1.9
16
93
6
53
43
3
0
53
1.17
26804869--26804966
50
2.0
50
100
0
196
35
16
21
26
1.94
26804966--26805061
31
3.1
31
89
0
138
26
19
26
28
1.99
26805083--26805298
47
4.7
47
82
9
221
28
14
26
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26805173--26805336
42
3.7
43
83
9
172
28
14
28
29
1.95
26814207--26814282
39
1.9
39
86
0
107
36
25
23
14
1.93
26817417--26817471
18
3.1
18
81
0
65
36
14
5
43
1.69
26818801--26818842
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
26819132--26819156
9
2.8
9
100
0
50
68
8
0
24
1.16
26822275--26822330
10
5.6
10
89
4
69
30
0
1
67
1.01
26822275--26822330
20
2.8
20
83
0
76
30
0
1
67
1.01
26826048--26826139
5
19.0
5
78
16
97
20
2
0
77
0.88
26826966--26826998
13
2.6
13
90
4
50
78
0
12
9
0.95
26826963--26827023
23
2.7
22
78
9
59
78
1
14
4
0.99
26826983--26827024
8
5.2
8
80
8
50
80
2
16
0
0.81
26826983--26827030
23
2.0
24
92
4
80
77
2
20
0
0.88
26827646--26827705
10
6.0
10
81
11
70
21
10
1
66
1.30
26828612--26828666
26
2.1
26
89
0
83
27
3
20
49
1.65
26832142--26832181
3
13.7
3
94
5
73
30
0
0
70
0.88
26834030--26834137
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
26835480--26835538
18
3.0
21
72
23
63
44
23
22
10
1.83
26835496--26835562
18
3.6
18
70
18
55
41
25
23
8
1.83
26835479--26835562
39
2.2
39
91
0
132
40
23
23
11
1.88
26839021--26839055
17
2.1
17
94
0
61
25
17
8
48
1.75
26839579--26839642
3
22.0
3
76
6
60
64
1
3
31
1.19
26839742--26839782
21
2.0
21
90
0
64
70
0
4
24
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26839773--26839834
18
3.4
18
78
10
56
70
1
3
24
1.10
26839754--26839832
24
3.7
19
69
24
52
70
1
3
24
1.11
26840119--26840161
4
10.5
4
85
5
59
74
2
2
20
1.04
26840632--26840675
18
2.4
18
100
0
88
29
18
0
52
1.46
26842072--26842242
44
3.9
44
76
3
146
27
25
18
28
1.98
26845232--26845302
6
12.2
6
76
18
53
0
12
5
81
0.85
26845232--26845272
17
2.4
17
84
11
57
0
19
2
78
0.87
26845232--26845302
11
6.1
11
75
15
54
0
12
5
81
0.85
26845258--26845301
18
2.5
18
92
3
72
0
6
6
86
0.71
26845235--26845302
23
3.0
22
82
8
73
0
11
5
82
0.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770