genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.360.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  360  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
110598135--110598235	28	3.5	28	86	6	114	29	13	26	29	1.94
110604878--110605058	46	3.9	46	81	9	233	20	21	29	27	1.98
110604880--110605050	93	1.8	93	96	0	315	20	22	29	27	1.98
110608011--110608089	15	5.4	15	77	10	83	10	17	13	58	1.63
110608002--110608088	29	3.0	29	81	8	95	10	17	16	56	1.67
110610464--110610644	46	3.9	46	81	9	233	20	21	29	27	1.98
110610466--110610636	93	1.8	93	96	0	315	20	22	29	27	1.98
110617679--110618381	229	3.1	229	98	0	1361	34	17	7	40	1.77
110622509--110622544	19	1.9	18	88	5	54	44	16	0	38	1.48
110624537--110624692	47	3.3	47	86	3	213	30	29	8	32	1.87
110624548--110624692	49	3.0	49	89	2	213	29	30	8	31	1.88
110628806--110629037	40	5.8	40	88	0	347	27	28	20	23	1.99
110630450--110630605	47	3.3	47	86	3	213	30	30	8	31	1.87
110630450--110630605	49	3.3	49	85	5	212	30	30	8	31	1.87
110637422--110637534	40	2.8	40	76	12	106	25	13	31	29	1.93
110645560--110645626	32	2.1	32	85	0	89	29	26	8	34	1.87
110645720--110645774	27	2.0	27	96	0	101	23	25	21	29	1.99
110651735--110651833	32	3.1	32	91	0	144	28	23	10	38	1.87
110651916--110652010	28	3.4	28	73	11	95	24	26	17	31	1.97
110651937--110652033	28	3.5	27	72	8	79	28	29	13	27	1.94
110651876--110652026	56	2.7	56	79	9	152	26	30	15	27	1.96
110657140--110657322	27	6.8	27	87	2	235	30	22	6	39	1.80
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
110657140--110657322	54	3.4	54	89	2	262	30	22	6	39	1.80
110657086--110657387	54	5.6	54	79	6	211	34	22	7	35	1.83
110657167--110657351	81	2.3	81	83	2	221	33	22	5	38	1.78
110657193--110657376	81	2.3	81	81	1	208	35	21	5	36	1.78
110657308--110657445	56	2.5	55	83	4	163	42	18	8	30	1.81
110657040--110657445	27	15.0	27	76	9	168	36	20	8	34	1.83
110657502--110657594	27	3.4	27	88	2	125	35	20	24	19	1.96
110658841--110658897	9	5.9	9	76	15	60	35	7	21	36	1.80
110658839--110658901	20	3.2	20	93	0	108	36	11	19	33	1.87
110658955--110659121	24	7.0	23	85	6	210	29	22	21	26	1.99
110658956--110659121	47	3.5	46	86	5	208	29	22	21	26	1.99
110658955--110659120	71	2.3	71	89	3	244	29	22	21	26	1.99
110659313--110659376	31	2.1	31	90	0	101	35	15	23	25	1.94
110663841--110663952	37	3.0	37	88	0	161	28	28	17	25	1.98
110664092--110664237	48	3.0	48	89	0	229	30	25	7	36	1.84
110664942--110664999	28	2.1	28	100	0	116	36	20	6	36	1.80
110668071--110668151	29	2.8	30	79	5	94	30	30	16	22	1.95
110670409--110670633	124	1.8	124	86	1	326	30	10	24	35	1.88
110670628--110670757	40	3.2	40	83	4	165	22	25	29	23	1.99
110678705--110678834	40	3.2	40	83	4	165	22	25	29	23	1.99
110686505--110686686	78	2.3	81	85	6	248	25	27	22	24	2.00
110686484--110686686	40	5.1	40	83	9	247	25	27	22	24	2.00
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
110694530--110694712	39	4.7	40	84	7	207	26	27	21	24	1.99
110694532--110694712	79	2.3	79	84	7	226	25	27	22	24	2.00
110699869--110699955	24	3.6	24	96	0	165	21	17	25	35	1.95
110699869--110699977	48	2.3	48	91	3	175	24	17	23	33	1.96
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110707741--110707827	24	3.6	24	96	0	165	21	17	25	35	1.95
110707741--110707849	48	2.3	48	91	3	175	24	17	23	33	1.96
110707741--110707849	24	4.5	24	90	2	157	24	17	23	33	1.96
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110713568--110713749	38	4.6	39	80	10	194	26	28	21	23	1.99
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110732027--110732257	107	2.1	108	84	0	302	29	22	9	39	1.84
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110735630--110735851	81	2.7	80	81	2	246	35	19	20	24	1.96
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110736728--110736838	31	3.5	31	95	1	195	18	16	14	50	1.78
110736876--110737126	27	9.3	27	83	1	279	32	23	7	37	1.82
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110736888--110737126	54	4.4	54	87	0	325	30	23	7	38	1.83
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110739182--110739402	54	4.1	54	79	5	205	40	21	8	29	1.82
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110743286--110743507	54	4.1	54	79	4	205	40	22	8	29	1.82
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
110743487--110743723	27	8.8	27	83	0	287	30	22	9	37	1.86
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110746844--110747119	54	5.1	54	81	5	263	39	19	9	31	1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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