Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  249  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74578515--74578608
38
2.4
40
89
3
138
23
20
32
23
1.97
74578425--74578600
89
2.0
91
96
2
329
25
21
32
20
1.98
74578386--74578637
129
2.0
130
87
3
366
24
21
32
21
1.98
74590182--74590447
37
6.6
39
82
11
290
24
21
31
21
1.98
74590275--74590371
48
2.0
50
91
4
162
27
21
31
18
1.97
74590237--74590409
87
2.0
89
94
4
307
26
20
32
20
1.97
74590325--74590447
40
3.2
40
82
3
126
23
21
31
22
1.98
74593775--74593965
39
4.8
40
86
0
199
25
32
20
21
1.98
74593811--74593973
39
4.2
39
89
0
245
25
33
19
22
1.97
74596501--74596543
2
22.0
2
88
4
61
44
0
2
53
1.13
74602892--74603035
39
3.7
39
93
0
243
27
29
22
20
1.99
74606803--74606871
34
2.0
34
91
0
111
23
17
21
37
1.94
74607622--74607692
23
3.3
21
74
14
56
33
8
16
40
1.79
74607634--74607692
23
2.6
23
79
10
59
33
6
18
40
1.77
74613519--74613655
39
3.5
39
85
0
193
28
21
24
24
1.99
74615383--74615637
40
6.4
40
85
2
293
26
27
21
23
1.99
74615409--74615637
120
1.9
119
87
4
336
26
28
21
23
1.99
74620915--74621081
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
74623227--74623391
40
4.2
40
80
3
165
26
22
27
24
2.00
74628898--74628947
13
3.8
13
89
0
73
28
4
24
44
1.72
74628895--74628947
26
2.0
26
92
0
88
26
5
24
43
1.76
74631851--74631896
20
2.1
23
84
11
62
28
0
2
69
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74637549--74637660
29
3.9
29
82
6
131
29
30
14
25
1.95
74637539--74637647
58
1.9
57
84
1
146
28
29
16
25
1.97
74640767--74640823
22
2.6
23
78
10
66
17
17
43
21
1.88
74644540--74644584
16
2.8
16
80
16
56
77
6
11
4
1.09
74648128--74648312
79
2.3
81
83
7
227
23
27
24
24
2.00
74648121--74648312
40
4.8
39
76
8
163
23
28
23
24
2.00
74651130--74651267
39
3.5
39
86
0
195
47
21
2
28
1.65
74656238--74656353
39
3.0
39
90
0
187
24
20
27
27
1.99
74656238--74656390
39
3.9
39
86
1
146
22
21
28
26
1.99
74657798--74657895
48
2.0
49
88
5
146
36
6
36
20
1.78
74657797--74657897
24
4.2
24
80
13
127
37
5
36
19
1.77
74665031--74665127
24
4.0
24
87
4
142
36
5
39
19
1.74
74665031--74665127
47
2.0
49
88
4
144
36
5
39
19
1.74
74689392--74689505
27
4.2
28
82
4
128
36
19
22
21
1.95
74689394--74689499
54
2.0
54
84
3
142
36
16
23
22
1.94
74694478--74694687
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
74702607--74702816
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
74718933--74718963
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
74720220--74720448
80
2.8
80
81
7
268
22
17
27
32
1.96
74720524--74720734
50
4.2
50
96
0
377
24
11
22
41
1.87
74730323--74730493
92
1.9
92
96
0
315
28
29
21
21
1.98
74730316--74730490
46
3.8
46
80
11
214
29
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74730324--74730509
46
4.0
46
73
18
145
28
29
20
21
1.98
74736966--74737107
38
3.7
38
91
3
223
25
21
30
22
1.98
74736967--74737147
77
2.3
78
87
3
249
23
22
30
23
1.99
74736967--74737147
38
4.6
39
86
3
222
23
22
30
23
1.99
74741093--74741263
92
1.9
92
94
0
306
28
29
21
20
1.98
74741086--74741260
46
3.8
46
80
11
205
29
29
21
20
1.98
74741094--74741279
46
4.0
46
73
18
136
28
29
20
20
1.98
74743867--74743981
55
2.1
56
82
11
139
35
21
23
19
1.96
74743892--74743981
28
3.2
27
86
10
112
33
23
23
20
1.97
74743892--74743981
27
3.2
28
81
13
114
33
23
23
20
1.97
74744087--74744150
28
2.3
28
91
0
101
31
9
28
31
1.88
74746307--74746624
158
2.0
159
96
0
593
31
24
15
27
1.96
74749049--74749113
24
2.6
25
85
4
87
32
12
20
35
1.89
74757948--74758098
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
74757985--74758114
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
74765983--74766111
40
3.2
40
76
5
129
24
24
27
24
2.00
74774560--74774605
14
3.3
14
87
0
65
34
0
34
30
1.58
74781096--74781144
22
2.3
20
89
6
71
18
6
0
75
1.00
74781095--74781146
10
4.9
10
81
11
59
19
5
0
75
1.01
74781495--74781535
14
2.9
14
85
0
64
39
4
31
24
1.76
74784406--74784449
19
2.4
19
85
7
56
50
2
9
38
1.47
74786264--74786332
28
2.5
28
90
6
106
43
26
8
21
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74787523--74787604
23
3.6
23
83
1
103
32
14
21
30
1.94
74787472--74787606
23
5.7
23
73
14
89
34
16
20
29
1.94
74791052--74791174
42
2.9
42
71
16
101
29
23
13
33
1.93
74792978--74793072
29
3.4
28
78
5
77
28
31
12
27
1.93
74794459--74794642
40
4.6
40
84
4
246
23
27
23
25
2.00
74794423--74794642
120
1.8
118
85
5
309
24
26
23
25
2.00
74802520--74802704
40
4.6
40
85
3
255
23
27
23
24
2.00
74812094--74812181
29
3.0
29
91
0
140
30
31
12
25
1.92
74812247--74812288
17
2.5
17
96
0
75
23
40
23
11
1.88
74812274--74812309
18
1.9
19
88
5
56
19
38
16
25
1.92
74812421--74812475
16
3.4
16
82
5
67
9
20
21
49
1.76
74821208--74821261
27
2.0
27
96
0
99
50
25
7
16
1.71
74824405--74824457
25
2.2
25
82
3
63
24
24
24
26
2.00
74839774--74839998
124
1.8
124
85
1
317
31
10
23
35
1.88
74839993--74840122
40
3.2
40
83
4
165
22
25
29
23
1.99
74840691--74840719
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
74842971--74843017
16
2.9
16
78
12
51
57
25
2
14
1.49
74847074--74847174
30
3.5
30
82
9
111
28
26
14
29
1.95
74847074--74847174
28
3.5
28
85
6
105
28
26
14
29
1.95
74856149--74856366
40
5.5
40
86
4
248
27
22
26
23
2.00
74856149--74856392
40
6.2
40
82
6
241
26
22
26
25
2.00
74864202--74864394
40
4.8
40
89
4
239
26
21
25
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74864212--74864394
79
2.3
80
85
4
246
26
22
25
25
2.00
74864212--74864438
40
5.7
39
86
3
190
27
22
25
24
2.00
74867085--74867184
51
2.0
51
87
0
146
24
16
28
32
1.96
74867421--74867458
6
6.3
6
96
0
67
36
0
15
47
1.46
74870562--74870769
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
74870563--74870769
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
74878237--74878455
46
4.7
46
75
13
196
26
20
29
22
1.99
74882418--74882459
22
1.9
22
100
0
84
42
21
19
16
1.89
74885321--74885542
46
4.8
46
86
7
324
28
29
21
20
1.98
74893617--74893720
39
2.7
39
87
0
136
30
27
19
22
1.98
74901169--74901275
41
2.5
43
81
4
137
19
15
30
33
1.93
74901171--74901286
43
2.8
42
82
2
126
22
14
31
31
1.94
74905062--74905102
15
2.7
15
100
0
82
12
17
14
56
1.68
74918641--74918763
42
2.9
42
80
3
122
26
15
27
30
1.96
74918725--74918824
51
2.0
51
87
0
146
24
16
28
32
1.96
74919061--74919098
6
6.3
6
96
0
67
36
0
15
47
1.46
74922198--74922405
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
74922199--74922405
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
74930321--74930527
40
5.2
40
84
0
216
25
22
26
25
2.00
74930321--74930527
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
74937797--74938112
47
6.7
45
74
14
230
27
21
28
22
1.99
74937797--74938015
94
2.3
94
86
6
302
27
21
27
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74937796--74938065
94
2.9
95
79
10
297
27
21
28
22
1.99
74937797--74938112
141
2.2
142
82
7
358
27
21
28
22
1.99
74941943--74942117
46
3.8
46
74
11
169
30
28
20
21
1.98
74941951--74942122
93
1.8
93
91
2
283
29
29
20
20
1.98
74952364--74952583
40
5.5
40
88
2
293
25
28
24
22
2.00
74955436--74955565
40
3.2
40
77
13
142
24
26
24
23
2.00
74955452--74955603
40
3.8
40
80
5
155
22
26
24
26
2.00
74955452--74955603
80
1.9
80
83
5
200
22
26
24
26
2.00
74963442--74963542
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
74963442--74963592
40
3.8
40
84
4
180
28
22
25
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770