genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.412.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  412  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
126579140--126579200	24	2.5	24	81	5	70	21	14	29	34	1.93
126581478--126581646	27	6.3	26	80	9	153	43	18	18	19	1.89
126581472--126581622	53	2.8	54	84	4	198	43	19	19	17	1.89
126581472--126581633	80	2.0	80	84	4	211	41	20	18	18	1.90
126581478--126581646	54	3.2	52	82	5	196	43	18	18	19	1.89
126581651--126581736	27	3.2	27	71	3	66	29	13	16	40	1.87
126582095--126582130	18	2.0	18	88	0	54	19	16	19	44	1.87
126584953--126585154	27	7.5	27	83	5	239	37	20	21	21	1.95
126585088--126585180	27	3.4	27	79	7	100	36	17	21	24	1.94
126584959--126585180	81	2.7	81	82	6	202	36	20	20	22	1.95
126584952--126585180	54	4.2	53	82	7	239	37	20	20	21	1.95
126585167--126585301	27	5.0	27	87	1	155	27	15	19	37	1.92
126585169--126585303	53	2.5	54	85	5	193	25	15	20	38	1.92
126594851--126594933	29	2.9	29	100	0	166	26	28	14	30	1.95
126594803--126594933	58	2.3	58	84	5	158	25	32	16	25	1.96
126598732--126598939	40	5.2	39	81	3	193	24	25	24	25	2.00
126598732--126598938	80	2.6	80	81	3	229	24	26	24	25	2.00
126606757--126606882	40	3.2	40	88	0	189	24	27	23	23	2.00
126606757--126606925	80	2.1	80	82	5	209	24	27	24	24	2.00
126618379--126618438	30	2.0	30	87	9	88	28	25	6	40	1.80
126620823--126620976	64	2.3	65	84	7	193	22	29	16	31	1.95
126636748--126637042	120	2.5	119	87	6	402	23	21	27	27	1.99
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
126636748--126637009	40	6.6	40	94	1	422	22	22	27	27	1.99
126645848--126645917	27	2.6	27	95	2	122	30	27	14	28	1.95
126653870--126653939	27	2.6	27	95	2	122	30	27	14	28	1.95
126656075--126656367	40	7.4	40	86	3	364	25	20	26	27	1.99
126658907--126658967	29	2.1	29	96	0	113	22	36	21	19	1.95
126667591--126667833	40	6.2	40	84	8	322	24	24	29	20	1.99
126672159--126672196	18	2.1	18	100	0	76	57	15	15	10	1.64
126673122--126673305	40	4.6	40	88	2	271	25	26	23	25	2.00
126675475--126675521	20	2.3	20	92	0	76	38	29	2	29	1.69
126675604--126675715	43	2.6	41	79	8	127	28	25	16	28	1.97
126685286--126685389	37	2.8	37	94	0	181	25	33	17	24	1.96
126685438--126685917	48	10.0	48	92	0	753	30	28	6	34	1.83
126691946--126692014	27	2.5	28	90	2	104	28	28	14	27	1.95
126693353--126693390	20	2.1	18	85	14	51	10	15	0	73	1.09
126699945--126700013	27	2.5	28	90	2	104	28	28	14	27	1.95
126701350--126701386	20	2.0	19	85	15	51	10	16	0	72	1.10
126703263--126703319	30	1.9	30	96	0	105	31	1	26	40	1.66
126703880--126703995	43	2.7	43	90	2	180	21	17	31	30	1.96
126707381--126707450	27	2.5	28	93	2	115	27	14	28	30	1.95
126707381--126707462	27	3.0	27	84	8	69	28	15	25	30	1.96
126715312--126715381	27	2.5	28	93	2	115	27	14	28	30	1.95
126715312--126715393	27	3.0	27	84	8	69	28	15	25	30	1.96
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
126718787--126718890	42	2.4	43	79	6	122	26	18	23	31	1.97
126718752--126718908	43	3.7	43	71	10	124	26	18	24	30	1.98
126724589--126724676	40	2.2	40	78	13	110	26	28	23	21	1.99
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126914171--126914357	6	30.8	6	74	16	154	49	13	16	20	1.79
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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