Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  585  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
182708635--182708764
40
3.2
40
81
4
156
23
23
28
24
2.00
182711963--182712026
28
2.3
28
100
0
128
18
18
43
18
1.88
182720642--182720677
17
2.1
17
100
0
72
41
5
16
36
1.72
182726289--182726437
80
1.9
80
82
2
192
22
30
24
22
1.99
182726330--182726437
40
2.7
38
85
8
128
20
29
25
24
1.99
182732471--182732598
40
3.2
39
84
5
150
24
22
28
25
2.00
182747011--182747193
39
4.6
39
87
0
240
22
30
22
24
1.99
182748914--182748971
20
2.8
20
97
2
107
43
8
13
34
1.75
182750243--182750273
16
1.9
16
93
0
53
16
6
25
51
1.68
182758526--182758558
15
2.2
15
89
10
50
57
0
3
39
1.14
182759431--182759542
29
3.9
29
85
6
140
28
30
14
26
1.95
182759419--182759529
58
1.9
57
87
1
159
27
30
15
26
1.96
182765803--182765975
46
3.7
46
77
10
190
22
20
26
30
1.99
182765800--182765970
93
1.8
93
91
0
279
22
21
27
29
1.99
182773351--182773523
46
3.7
46
79
10
208
21
20
27
29
1.98
182773348--182773518
93
1.8
93
93
0
297
21
21
28
28
1.98
182781343--182781445
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
182801368--182801453
43
2.0
43
100
0
172
37
11
11
39
1.78
182805099--182805266
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
182811224--182811325
51
2.0
51
100
0
204
29
29
15
25
1.96
182813064--182813148
43
2.0
43
97
2
163
37
11
11
38
1.79
182817973--182818233
92
2.8
93
89
0
398
29
26
19
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
182817963--182818220
46
5.6
46
72
9
202
30
27
18
23
1.98
182824271--182824421
40
3.8
40
78
6
155
27
23
27
21
1.99
182824273--182824421
80
1.9
79
84
6
203
26
24
27
21
1.99
182824271--182824437
80
2.1
79
81
7
196
26
23
26
22
2.00
182832277--182832427
40
3.8
40
78
6
155
27
23
27
21
1.99
182832279--182832427
80
1.9
79
84
6
203
26
24
27
21
1.99
182832277--182832443
80
2.1
79
81
7
196
26
23
26
22
2.00
182835078--182835106
2
14.5
2
100
0
58
51
48
0
0
1.00
182837339--182837545
40
5.2
40
92
4
314
24
23
27
25
2.00
182844950--182845301
41
8.6
41
85
2
415
23
18
28
29
1.98
182846060--182846094
15
2.3
15
95
0
61
57
0
8
34
1.29
182846066--182846132
23
2.8
23
76
13
64
56
0
4
38
1.19
182847835--182849154
634
2.1
632
95
3
2406
25
13
18
42
1.87
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Score
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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0
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13
27
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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