Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  384  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118299052--118299138
37
2.3
36
88
5
129
25
32
20
21
1.98
118299207--118299602
49
8.1
49
97
0
720
28
27
10
34
1.90
118299349--118299480
27
5.3
27
59
23
72
30
25
8
35
1.86
118312778--118312826
25
2.0
25
91
0
80
44
22
12
20
1.84
118315431--118315638
40
5.2
40
84
4
233
25
22
26
25
2.00
118330188--118330239
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
118332991--118333115
41
3.0
42
78
12
141
24
19
26
29
1.98
118336425--118336493
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
118338123--118338160
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
118338324--118338357
18
1.9
17
88
5
50
11
23
44
20
1.84
118339461--118339510
24
2.0
25
81
11
59
8
36
2
54
1.42
118342770--118342856
43
2.0
43
82
12
108
26
19
27
26
1.99
118346886--118346936
25
2.0
25
100
0
102
31
15
21
31
1.95
118349025--118349192
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
118357025--118357174
40
3.8
39
84
3
151
24
27
22
26
2.00
118367160--118367409
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
118371928--118372142
49
4.4
49
95
2
396
33
8
27
30
1.86
118372224--118372294
37
1.9
37
100
0
142
21
22
33
22
1.97
118383164--118383198
17
2.1
17
89
5
54
77
14
0
8
0.99
118386380--118386514
69
2.0
69
95
0
243
31
5
23
38
1.79
118386383--118386494
34
3.3
33
65
16
84
32
4
25
38
1.76
118386859--118386889
16
1.9
16
93
0
53
38
3
0
58
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118390501--118390602
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
118392692--118392867
46
3.8
46
80
14
218
21
20
28
29
1.98
118392689--118392859
93
1.8
93
94
2
308
21
21
29
28
1.98
118395291--118395378
40
2.2
40
95
2
158
40
2
14
42
1.58
118396581--118396642
31
2.0
31
100
0
124
25
25
19
29
1.99
118401733--118401769
17
2.2
17
100
0
74
72
10
5
10
1.25
118402620--118402745
46
2.7
46
85
4
164
29
18
30
21
1.97
118402622--118402845
46
4.8
48
74
13
148
26
17
33
22
1.96
118408044--118408240
55
3.6
54
75
4
157
21
21
18
39
1.93
118410566--118410666
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
118410595--118410670
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
118415643--118415896
46
5.4
48
77
12
219
28
18
29
23
1.98
118415827--118416002
96
1.8
96
82
8
230
27
19
28
23
1.98
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Percent
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Period
Size
Copy
Number
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Period
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2.5
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18
10
27
43
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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