Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  451  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
138946447--138946587
46
3.0
44
77
14
135
29
29
19
21
1.98
138955561--138955732
46
3.8
45
76
11
170
22
18
30
28
1.97
138960065--138960094
15
2.0
15
100
0
60
33
40
0
26
1.57
138962830--138962930
27
3.6
28
83
4
123
31
22
25
19
1.98
138963036--138963128
28
3.3
28
96
0
168
31
7
26
34
1.84
138972980--138973040
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
138989035--138989129
29
3.3
30
84
8
126
28
27
15
28
1.96
138993247--138993356
29
3.9
29
82
7
127
27
29
15
28
1.96
138996152--138996284
47
2.8
49
79
16
172
29
29
20
21
1.98
138996160--138996300
46
3.0
44
77
14
135
29
29
19
21
1.98
139003686--139003857
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
139003679--139003854
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
139007134--139007260
66
1.9
66
82
3
157
26
22
19
31
1.98
139013184--139013233
20
2.5
20
96
0
91
8
26
40
26
1.83
139015740--139015905
42
3.9
42
79
1
179
30
23
15
30
1.95
139019496--139019530
17
2.1
16
89
10
52
8
5
2
82
0.91
139019575--139019608
17
2.0
17
88
0
50
20
5
0
73
1.04
139019583--139019608
13
2.0
13
100
0
52
23
0
0
76
0.78
139019625--139019698
23
3.1
24
79
11
89
41
0
4
54
1.19
139019691--139019743
22
2.4
22
90
6
81
39
0
0
60
0.97
139019689--139019745
21
2.8
21
80
17
66
43
0
0
56
0.99
139019697--139019933
122
1.9
123
82
11
299
39
3
3
53
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
139019798--139019857
28
2.1
30
87
6
88
36
0
1
61
1.06
139019800--139019873
14
5.3
15
74
19
70
39
0
1
59
1.06
139019838--139019894
24
2.3
24
85
8
71
42
0
0
57
0.98
139019921--139019967
10
4.9
10
80
15
55
40
0
0
59
0.97
139019929--139019992
28
2.3
27
84
10
76
42
0
0
57
0.98
139019956--139020004
12
3.7
13
80
19
57
46
0
0
53
1.00
139020123--139020261
20
6.7
20
70
16
77
57
0
0
41
1.04
139020125--139020264
21
6.6
21
70
17
74
57
0
0
41
1.03
139020134--139020218
7
12.0
7
71
7
64
56
1
0
42
1.07
139020145--139020192
23
2.1
23
84
0
60
60
2
0
37
1.09
139020224--139020294
22
3.2
22
80
9
81
52
1
0
46
1.09
139020193--139020273
35
2.3
35
89
8
121
58
0
0
41
0.98
139021795--139021881
43
2.0
44
90
2
140
22
29
24
22
1.99
139021801--139021894
43
2.2
44
86
1
127
23
30
20
25
1.98
139022122--139022195
31
2.4
31
84
13
100
66
1
2
29
1.14
139027257--139027366
41
2.7
41
91
0
166
29
24
22
23
1.99
139027313--139027471
82
1.9
82
82
5
196
23
23
22
30
1.99
139027339--139027471
41
3.3
40
88
3
194
19
22
24
33
1.97
139034792--139034949
66
2.6
58
83
14
226
46
17
1
34
1.59
139034792--139034869
19
4.0
19
74
17
54
46
20
1
32
1.59
139034818--139034982
13
12.7
12
73
11
69
45
16
3
34
1.63
139034818--139034982
66
2.5
66
94
0
294
45
16
3
34
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
139034801--139035002
6
30.7
7
65
16
51
45
15
2
35
1.62
139034819--139035012
33
5.9
32
72
15
137
46
15
3
35
1.62
139034818--139035012
66
3.0
65
90
3
291
46
15
3
35
1.62
139035005--139035046
18
2.3
18
91
4
66
40
4
14
40
1.67
139035012--139035047
18
2.0
18
100
0
72
33
5
16
44
1.71
139037335--139037360
6
4.3
6
100
0
52
30
34
0
34
1.58
139044407--139044466
27
2.2
27
81
0
66
60
5
20
15
1.53
139044531--139044605
23
3.1
23
68
17
62
20
16
2
61
1.46
139044535--139044605
24
2.9
25
71
12
74
21
14
2
61
1.44
139044537--139044636
26
4.0
26
70
11
66
17
16
4
63
1.46
139044538--139044614
25
3.1
25
74
9
77
18
11
3
66
1.39
139044537--139044615
24
3.2
24
72
15
72
17
13
3
64
1.43
139044640--139044703
23
2.8
24
72
13
62
17
18
4
59
1.54
139044775--139044826
26
2.0
26
88
7
79
11
17
3
67
1.36
139044991--139045047
17
3.4
18
77
18
70
14
14
1
70
1.26
139044993--139045045
15
3.4
15
73
19
54
15
15
1
67
1.31
139047358--139047409
15
3.2
15
73
19
50
44
0
1
53
1.11
139047491--139047535
16
2.9
16
80
12
58
46
0
0
53
1.00
139048916--139048991
38
2.0
38
92
0
125
26
19
21
32
1.97
139051494--139051533
19
1.9
19
85
14
53
30
2
17
50
1.59
139054433--139054543
35
3.2
35
80
2
116
26
26
19
27
1.99
139055984--139056024
20
2.1
19
86
4
55
46
9
4
39
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
139056353--139056385
9
3.8
9
88
4
50
51
3
0
45
1.16
139056376--139056408
17
1.9
18
88
11
52
42
12
0
45
1.41
139067998--139068067
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
139067998--139068079
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
139083335--139083381
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
139083642--139084072
46
9.9
46
82
11
475
23
25
15
36
1.93
139083823--139084062
38
5.9
38
82
13
291
25
26
16
32
1.96
139083775--139084072
83
3.6
84
96
0
537
25
25
15
33
1.95
139086194--139086241
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
139086200--139086279
30
2.6
30
77
16
76
55
5
0
40
1.22
139087437--139087461
10
2.5
10
100
0
50
32
40
0
28
1.57
139087459--139087483
7
3.6
7
100
0
50
16
56
0
28
1.41
139088157--139089120
483
2.0
482
97
0
1802
22
13
25
38
1.91
139092950--139093205
40
6.5
40
88
2
322
23
23
28
25
1.99
139092950--139093179
119
1.9
119
86
3
329
22
23
29
25
1.99
139092950--139093191
79
3.0
80
86
4
321
22
23
28
25
1.99
139092950--139093205
119
2.2
119
84
4
322
23
23
28
25
1.99
139098111--139098173
15
4.1
15
76
15
58
34
4
0
60
1.18
139098096--139098173
17
4.7
17
73
20
60
34
3
2
58
1.30
139098134--139098188
27
2.0
28
82
3
67
36
9
0
54
1.32
139110281--139110953
220
3.1
219
91
2
1066
32
17
22
27
1.97
139110618--139110779
89
1.8
87
81
5
200
31
19
22
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
139110931--139111085
44
3.5
44
87
0
229
30
14
27
27
1.95
139112634--139112707
16
4.7
16
70
23
50
35
4
0
60
1.15
139112716--139112759
19
2.4
19
88
3
63
25
0
2
72
0.96
139116047--139116205
29
5.5
30
87
9
213
27
25
13
32
1.94
139116047--139116205
59
2.8
56
88
5
212
27
25
13
32
1.94
139126176--139126307
29
4.6
29
82
1
140
25
32
17
25
1.97
139133186--139133402
39
5.6
40
90
5
322
22
27
22
27
1.99
139133917--139134122
40
5.2
40
91
4
310
23
22
27
26
2.00
139141102--139141188
24
3.6
24
96
0
165
21
17
25
35
1.95
139141102--139141210
48
2.3
48
91
3
175
24
17
23
33
1.96
139141102--139141210
24
4.5
24
90
2
157
24
17
23
33
1.96
139143608--139143633
13
2.0
13
100
0
52
30
0
7
61
1.24
139145158--139145361
40
5.1
40
92
1
322
24
22
26
26
2.00
139157011--139157074
22
3.0
20
78
10
65
39
6
0
54
1.26
139157001--139157064
22
2.8
22
79
13
76
40
4
0
54
1.21
139157451--139157502
25
2.1
25
96
0
95
40
21
9
28
1.84
139157916--139158130
41
5.2
41
88
1
297
20
23
23
33
1.97
139158063--139158198
71
1.9
70
89
1
209
16
22
25
35
1.95
139158189--139158318
41
3.2
41
85
4
156
23
16
20
40
1.91
139157981--139158282
153
2.0
152
79
4
331
19
21
22
35
1.96
139158342--139158367
12
2.2
12
100
0
52
46
30
15
7
1.74
139161754--139161982
48
4.8
48
82
3
210
25
17
28
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
139161762--139161982
96
2.3
96
84
3
266
25
17
28
28
1.97
139165608--139165793
40
4.7
40
88
5
243
27
27
20
24
1.99
139168244--139168300
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
139168242--139168312
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
139168253--139168307
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
139168359--139168641
23
12.1
23
90
4
451
28
22
21
28
1.99
139168358--139168648
47
6.2
46
93
2
440
28
21
21
27
1.99
139168359--139168641
70
4.0
69
92
3
451
28
22
21
28
1.99
139175747--139175929
40
4.7
40
87
8
243
26
27
21
24
1.99
139175747--139175928
77
2.3
80
83
11
232
26
27
21
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770