Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  574  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
178997594--178997653
30
2.0
30
86
0
84
30
23
8
38
1.84
179000846--179001109
40
6.7
40
87
3
347
24
23
27
24
2.00
179007622--179007788
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
179016683--179016707
7
3.6
7
100
0
50
12
0
28
60
1.32
179017574--179017643
27
2.5
28
90
2
115
25
12
28
32
1.93
179021521--179021551
15
2.0
16
93
6
55
51
0
6
41
1.27
179037323--179037388
28
2.4
28
92
0
114
25
18
24
31
1.97
179042628--179042835
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
179042628--179042833
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
179046852--179047019
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
179053214--179053374
29
5.6
29
87
1
207
25
16
32
26
1.96
179058405--179058471
34
2.0
34
85
5
91
28
23
20
26
1.99
179061363--179061511
31
4.8
31
92
0
235
26
19
27
26
1.99
179061580--179061742
49
3.5
48
82
8
162
28
15
26
28
1.96
179061673--179061765
42
2.3
38
87
7
123
31
15
27
25
1.95
179061673--179061782
38
2.8
40
83
9
127
30
16
27
25
1.96
179065577--179065637
27
2.3
26
80
8
68
26
13
22
37
1.91
179067952--179068119
40
4.2
40
81
3
196
27
25
21
25
1.99
179067948--179068119
80
2.2
79
86
4
240
27
25
22
25
2.00
179077591--179077773
79
2.3
81
84
7
232
25
27
22
24
2.00
179077570--179077773
40
5.1
40
82
8
238
25
27
22
24
2.00
179080855--179081021
40
4.2
40
80
2
176
23
28
23
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
179088864--179088991
39
3.3
39
81
7
161
24
28
24
22
1.99
179088880--179088988
40
2.8
38
86
9
148
22
29
25
22
1.99
179091783--179091851
20
3.5
20
86
7
106
36
10
20
33
1.86
179091897--179092084
24
8.0
23
89
4
238
29
21
21
27
1.98
179091896--179092062
70
2.4
70
91
5
259
29
21
20
28
1.98
179099948--179100114
40
4.2
40
80
2
167
23
27
23
25
2.00
179102142--179102232
37
2.4
37
96
1
164
25
32
18
23
1.97
179102272--179102470
48
4.2
48
95
1
355
32
28
6
32
1.83
179102272--179102470
95
2.1
96
97
0
373
32
28
6
32
1.83
179102462--179102794
47
7.0
47
93
2
549
29
28
8
33
1.87
179102462--179102792
144
2.3
143
98
0
635
29
28
8
33
1.87
179106423--179106763
40
8.6
40
87
5
397
26
28
20
24
1.99
179108670--179108760
37
2.4
37
96
1
164
25
32
18
23
1.97
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20
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
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2.3
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0
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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1.8
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
120
23
16
23
36
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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