Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  739  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
234039646--234039718
35
2.1
35
100
0
146
39
19
5
35
1.75
234044639--234044739
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
234052587--234052687
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
234061320--234061376
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
234061318--234061388
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
234061329--234061383
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
234061432--234061595
23
7.1
23
91
5
269
28
21
21
29
1.98
234061807--234061891
31
2.7
30
84
10
102
32
17
25
23
1.97
234065195--234065376
40
4.7
39
83
11
230
24
22
27
25
2.00
234065196--234065374
77
2.3
79
83
9
233
24
22
27
25
2.00
234073206--234073388
40
4.7
40
84
9
243
24
22
27
25
2.00
234073207--234073386
77
2.3
80
84
8
244
25
22
27
25
2.00
234081222--234081405
40
4.7
40
86
8
252
24
22
27
25
2.00
234081222--234081403
78
2.3
80
86
6
255
24
22
27
25
2.00
234083821--234083911
41
2.2
42
90
2
139
35
20
13
30
1.91
234084055--234084144
26
3.6
25
89
4
137
27
23
25
23
2.00
234085511--234085684
40
4.3
40
80
5
174
24
27
21
27
1.99
234085527--234085678
80
1.9
80
83
5
200
23
26
23
26
2.00
234096194--234096377
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
234096234--234096422
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
234098172--234098236
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
234108580--234108709
66
2.0
66
85
0
179
36
11
20
31
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
234128641--234128860
40
5.6
39
88
4
273
25
28
22
23
1.99
234128641--234128824
40
4.7
40
93
2
282
25
28
23
22
1.99
234128641--234128824
79
2.3
80
90
1
282
25
28
23
22
1.99
234128641--234128860
119
1.8
119
85
3
309
25
28
22
23
1.99
234128641--234128860
79
2.8
78
83
10
261
25
28
22
23
1.99
234136805--234137024
40
5.6
39
88
4
273
25
28
22
23
1.99
234136805--234136988
39
4.7
40
92
2
282
26
27
23
22
2.00
234136805--234136988
79
2.3
79
90
1
280
26
27
23
22
2.00
234138820--234139077
49
5.3
49
90
2
380
29
30
7
32
1.85
234145733--234145953
40
5.6
40
94
4
362
26
28
23
21
1.99
234145733--234145953
79
2.8
80
92
6
362
26
28
23
21
1.99
234153852--234154109
40
6.5
40
91
4
373
25
28
22
22
1.99
234162019--234162242
40
5.8
38
91
5
305
26
30
21
21
1.98
234161993--234162242
77
3.2
78
87
8
320
26
29
22
22
1.99
234166208--234166374
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
234174187--234174353
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
234182170--234182336
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
234188037--234188203
46
3.6
47
84
8
177
26
17
30
25
1.97
234188449--234188506
29
2.0
29
100
0
116
20
13
13
51
1.75
234190903--234191076
46
3.8
45
81
6
215
21
21
28
28
1.99
234193997--234194046
15
3.5
15
86
5
68
10
18
12
60
1.59
234196413--234196585
46
3.8
45
77
13
176
21
20
27
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
234199507--234199545
15
2.6
15
88
8
53
15
17
12
53
1.72
234199531--234199594
31
2.1
31
85
11
87
9
17
18
54
1.69
234201929--234202104
46
3.8
46
76
11
162
21
19
27
30
1.98
234201924--234202097
93
1.9
93
87
2
260
22
20
28
29
1.98
234216608--234216718
59
1.9
56
82
12
136
39
17
16
27
1.90
234217909--234218074
40
4.2
40
78
8
162
25
22
27
24
2.00
234217909--234218058
79
1.9
79
84
5
205
26
22
27
24
2.00
234225411--234225610
83
2.4
83
86
3
267
32
21
19
27
1.97
234228533--234228592
23
2.8
21
80
16
61
31
6
3
58
1.40
234228534--234228595
21
2.8
22
81
16
74
32
6
3
58
1.40
234229201--234229229
14
2.0
15
93
6
51
13
13
10
62
1.55
234239064--234239262
83
2.4
83
86
3
265
32
21
19
27
1.97
234242180--234242239
23
2.8
20
80
16
66
31
6
3
58
1.40
234242181--234242242
21
2.8
22
81
16
74
32
6
3
58
1.40
234244006--234244061
27
2.1
27
96
0
103
28
8
26
35
1.87
234247979--234248164
40
4.7
40
86
5
227
25
26
22
25
2.00
234256008--234256192
40
4.7
40
86
6
227
25
27
22
25
2.00
234262555--234262739
40
4.7
40
86
6
227
25
27
22
25
2.00
234266916--234267064
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
234266957--234267064
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
234275034--234275182
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
234275075--234275182
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
234284019--234284148
36
3.5
38
88
6
203
29
19
26
24
1.98
234286004--234286100
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
234288489--234288585
30
3.2
30
72
8
81
29
15
26
27
1.96
234291486--234291556
20
3.5
20
84
3
90
45
22
18
14
1.85
234293026--234293065
19
2.1
19
90
0
62
27
35
15
22
1.94
234295772--234295868
30
3.2
30
79
2
106
29
14
25
29
1.95
234301992--234302031
19
2.1
19
85
0
53
27
32
15
25
1.95
234302510--234302554
14
3.3
14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
234303534--234303593
29
2.1
29
93
0
102
41
30
0
28
1.56
234303540--234303587
15
3.3
15
73
5
53
43
27
0
29
1.55
234306870--234307039
40
4.3
40
83
5
220
26
27
21
24
2.00
234314765--234314921
40
3.9
40
84
3
217
27
28
21
23
1.99
234315259--234315296
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
234321650--234321687
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
234327720--234327850
40
3.3
40
85
0
172
24
27
21
26
1.99
234327737--234327887
40
3.8
40
85
4
180
23
25
22
28
1.99
234335752--234335920
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
234340751--234340911
45
3.6
45
86
5
206
23
21
27
26
1.99
234346725--234346934
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
234354860--234355069
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
234362990--234363239
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
234367651--234367810
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
234375677--234375836
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
234387862--234387955
29
3.2
29
98
0
179
26
27
15
29
1.96
234387825--234387955
58
2.3
58
86
2
174
25
32
16
25
1.96
234395701--234395794
29
3.2
29
98
0
179
26
27
15
29
1.96
234395664--234395794
58
2.3
58
86
2
174
25
32
16
25
1.96
234403529--234403622
29
3.2
29
98
0
179
26
27
15
29
1.96
234403492--234403622
58
2.3
58
86
2
174
25
32
16
25
1.96
234407533--234407782
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
234415696--234415865
40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
234423234--234423393
29
5.5
30
88
8
213
26
25
14
33
1.94
234423234--234423393
59
2.8
57
88
4
214
26
25
14
33
1.94
234439032--234439181
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
234439056--234439239
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
234439369--234439406
19
2.1
18
90
9
60
23
5
31
39
1.77
234447901--234448063
71
2.3
70
96
1
299
34
17
28
19
1.95
234453266--234453294
13
2.2
13
100
0
58
20
20
13
44
1.85
234457617--234457662
20
2.3
20
92
0
74
32
13
26
28
1.93
234460639--234460672
14
2.4
14
85
0
50
64
8
0
26
1.22
234460852--234460876
6
4.2
6
100
0
50
32
16
16
36
1.90
234461889--234461928
22
1.9
20
85
10
53
22
25
15
37
1.93
234462653--234462707
26
2.2
25
81
15
69
41
12
9
36
1.75
234467730--234467937
40
5.2
39
84
1
209
25
25
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
234467730--234467935
80
2.6
81
84
3
247
24
26
22
26
2.00
234475771--234475978
40
5.2
39
84
1
209
25
25
22
26
2.00
234475771--234475976
80
2.6
81
84
3
247
24
26
22
26
2.00
234481266--234481350
25
3.4
26
83
6
86
28
16
29
25
1.97
234481309--234481356
25
1.9
25
91
0
78
29
14
31
25
1.95
234482612--234482638
9
3.0
9
100
0
54
88
0
11
0
0.50
234483931--234484097
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
234495057--234495187
29
4.6
29
77
5
106
24
16
35
23
1.95
234501622--234501646
12
2.1
12
100
0
50
84
0
8
8
0.79
234502792--234502865
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770