Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  297  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90642367--90642405
15
2.6
15
88
8
53
28
12
5
53
1.60
90642203--90642742
87
6.0
91
75
11
352
27
16
18
37
1.93
90642222--90642560
187
1.8
181
81
6
412
28
17
19
34
1.95
90644172--90644268
8
12.4
8
81
12
76
42
3
4
50
1.37
90644179--90644245
2
34.0
2
87
3
100
46
1
2
49
1.26
90644163--90644292
12
10.8
12
75
10
86
37
2
6
53
1.38
90644218--90644269
14
3.6
14
77
15
52
40
1
1
55
1.22
90644274--90644302
15
2.0
15
93
6
51
27
0
6
65
1.18
90645583--90645669
12
7.2
12
73
17
58
55
2
9
33
1.44
90645921--90645954
15
2.3
15
89
0
50
55
2
11
29
1.50
90648330--90648371
22
1.9
22
85
9
59
69
2
19
9
1.28
90652791--90652905
59
2.0
57
85
10
153
40
17
15
26
1.89
90654090--90654254
39
4.2
38
76
10
147
26
22
26
24
2.00
90661931--90662096
40
4.2
40
78
8
162
25
22
27
24
2.00
90661931--90662080
79
1.9
79
84
5
205
26
22
27
24
2.00
90677227--90677455
96
2.4
96
82
5
259
23
27
20
28
1.99
90677231--90677465
48
4.9
48
73
6
170
25
27
20
27
1.99
90685079--90685211
49
2.7
49
81
6
153
23
24
21
31
1.98
90685229--90685397
48
3.6
48
79
3
198
24
27
18
29
1.98
90694117--90694175
28
2.1
28
100
0
118
16
11
25
45
1.82
90694793--90694854
27
2.3
27
91
0
97
27
16
16
40
1.89
90694810--90694960
54
2.8
54
86
2
160
29
9
19
41
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90694808--90694960
81
1.9
81
86
5
220
30
9
19
40
1.83
90694837--90694960
27
4.6
27
85
2
169
30
7
20
41
1.79
90694944--90695014
27
2.6
27
75
4
72
29
7
26
36
1.83
90694837--90694960
54
2.3
54
92
0
203
30
7
20
41
1.79
90694834--90694987
81
1.9
81
79
2
175
31
7
21
38
1.82
90698255--90698309
28
2.0
28
100
0
110
20
10
21
47
1.80
90698931--90698992
27
2.3
27
91
0
97
27
16
16
40
1.89
90698948--90699098
54
2.8
54
86
2
160
29
9
19
41
1.83
90698946--90699098
81
1.9
81
86
5
220
30
9
19
40
1.83
90698975--90699098
27
4.6
27
85
2
169
30
7
20
41
1.79
90699082--90699152
27
2.6
27
75
4
72
29
7
26
36
1.83
90698975--90699098
54
2.3
54
92
0
203
30
7
20
41
1.79
90698972--90699125
81
1.9
81
79
2
175
31
7
21
38
1.82
90700511--90700673
46
3.5
46
92
1
256
23
22
24
30
1.99
90700518--90700680
23
7.1
23
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Size
Copy
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Period
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Copy
Number
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Matches
Percent
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Score
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Period
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Copy
Number
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Indices
Period
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Copy
Number
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2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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