Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  674  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
212243613--212243741
46
2.8
46
93
0
213
19
20
29
30
1.97
212253389--212253559
93
1.8
93
92
0
288
28
29
21
21
1.98
212253381--212253556
46
3.8
46
78
12
189
30
28
19
21
1.98
212253432--212253575
46
3.1
44
75
15
132
29
29
20
21
1.98
212259924--212259972
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
212260794--212260960
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
212265663--212265695
16
2.1
15
94
5
57
42
18
27
12
1.85
212266451--212266479
14
2.1
14
100
0
58
27
27
20
24
1.99
212267918--212267966
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
212268781--212268947
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
212277045--212277207
39
4.2
39
91
0
263
22
20
33
23
1.97
212277045--212277238
39
4.9
39
89
0
253
22
21
32
23
1.98
212281905--212281989
29
3.0
29
87
3
84
25
22
15
36
1.93
212281917--212281989
29
2.5
29
97
0
137
23
24
15
36
1.93
212290893--212291022
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
212290909--212291060
40
3.8
40
78
6
148
22
26
23
27
1.99
212290909--212291058
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
212301075--212301243
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
212309105--212309273
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
212317414--212317463
24
2.1
24
100
0
100
24
12
12
52
1.72
212318218--212318323
42
2.5
42
96
1
196
26
16
34
22
1.95
212318356--212318417
31
2.0
31
90
6
99
35
14
20
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
212326348--212326391
21
2.1
21
100
0
88
25
9
29
36
1.86
212326386--212326447
31
2.0
31
90
6
99
35
14
20
29
1.93
212336170--212336329
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
212339649--212339954
49
6.3
49
91
3
478
29
30
8
32
1.86
212339649--212339954
97
3.2
97
93
1
492
29
30
8
32
1.86
212339649--212339949
146
2.1
144
91
3
480
29
30
7
31
1.86
212351992--212352158
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
212351992--212352158
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
212352983--212353028
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
212361699--212361865
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
212361715--212361865
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
212364284--212364365
29
2.8
29
98
0
155
29
14
30
25
1.95
212372871--212372901
2
15.5
2
93
0
53
51
3
0
45
1.17
212372994--212373066
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
212380372--212380399
5
5.6
5
100
0
56
17
39
0
42
1.50
212380458--212380712
55
4.8
54
78
9
242
20
25
17
36
1.94
212383767--212383934
40
4.2
40
80
3
196
25
22
27
25
2.00
212387788--212387832
2
22.5
2
90
0
72
48
2
2
46
1.26
212388472--212388545
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
212395021--212395090
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
212399114--212399157
2
22.0
2
85
0
61
50
2
4
43
1.35
212399785--212399858
29
2.6
29
86
4
96
27
16
31
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
212402255--212402286
13
2.5
13
94
0
55
50
28
6
15
1.68
212423343--212423552
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
212426129--212426310
40
4.6
40
79
8
176
24
24
28
23
2.00
212426129--212426310
78
2.3
80
82
6
210
24
24
28
23
2.00
212434138--212434319
40
4.6
40
79
8
176
24
24
28
23
2.00
212434138--212434319
78
2.3
80
82
6
210
24
24
28
23
2.00
212442125--212442306
40
4.6
40
79
8
176
24
24
28
23
2.00
212442125--212442306
78
2.3
80
82
6
210
24
24
28
23
2.00
212445341--212445503
38
4.4
38
85
11
241
22
22
16
38
1.93
212445364--212445477
31
3.5
31
89
8
147
23
21
14
40
1.90
212445364--212445503
69
2.0
69
98
0
271
23
21
15
39
1.92
212445695--212445789
24
4.0
24
85
10
124
26
24
21
28
1.99
212445695--212445788
47
2.0
49
85
12
133
26
24
21
27
1.99
212445840--212445899
20
3.0
20
90
0
102
31
20
11
36
1.88
212445942--212445989
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
212453686--212453850
37
4.6
36
82
16
209
21
23
17
38
1.93
212453709--212453845
69
2.0
67
97
2
256
22
21
16
39
1.92
212453745--212453822
31
2.5
31
95
0
138
23
20
14
42
1.88
212454037--212454131
24
4.0
24
85
10
124
26
24
21
28
1.99
212454037--212454130
47
2.0
49
85
12
133
26
24
21
27
1.99
212454182--212454241
20
3.0
20
90
0
102
31
20
11
36
1.88
212454284--212454331
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
212463020--212463192
46
3.7
46
80
13
219
21
21
28
28
1.98
212463017--212463187
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
212469312--212469428
45
2.6
46
80
12
145
25
18
29
26
1.98
212476737--212476867
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
212476736--212476867
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
212479686--212479721
8
4.5
8
92
0
63
44
22
22
11
1.84
212480142--212480189
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
212480233--212480373
20
6.9
20
75
12
117
36
7
19
36
1.81
212480193--212480323
39
3.3
39
68
16
122
34
4
19
41
1.72
212480192--212480366
82
2.1
82
97
2
332
34
5
20
39
1.76
212480319--212480373
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
212480424--212480600
24
7.4
24
94
3
286
29
22
22
25
1.99
212480806--212480900
31
3.1
31
98
0
181
38
15
22
23
1.92
212484019--212484069
17
2.9
17
82
5
57
86
0
13
0
0.58
212484011--212484069
20
3.0
20
90
2
93
84
0
15
0
0.62
212484011--212484075
18
3.4
18
80
14
69
81
0
16
1
0.77
212484011--212484069
19
3.1
19
85
9
84
84
0
15
0
0.62
212485038--212485383
44
7.9
44
79
7
353
28
16
27
27
1.97
212485014--212485337
175
1.9
175
92
0
549
29
16
25
27
1.97
212485038--212485470
219
2.0
219
88
0
650
28
15
27
28
1.96
212485345--212485709
87
4.2
87
91
0
550
26
14
26
32
1.95
212485827--212485937
58
1.9
58
85
3
152
36
12
27
24
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
212485751--212486015
136
1.9
136
93
0
449
33
15
25
24
1.95
212485885--212486088
78
2.6
77
90
3
336
31
17
25
25
1.97
212486132--212486274
76
1.9
76
89
0
223
32
13
30
23
1.94
212486618--212486739
17
6.9
18
83
10
116
37
11
13
37
1.80
212486634--212486751
35
3.3
35
86
9
166
36
12
14
36
1.84
212486626--212486751
54
2.3
54
97
0
234
37
11
14
36
1.83
212486626--212486751
19
6.9
19
87
10
192
37
11
14
36
1.83
212489076--212489225
41
3.6
41
77
10
162
22
22
28
27
1.99
212489056--212489225
41
4.2
40
74
18
161
22
22
27
27
1.99
212497418--212497567
41
3.6
41
77
10
162
22
22
28
27
1.99
212497398--212497567
41
4.2
40
74
18
161
22
22
27
27
1.99
212499235--212499281
21
2.3
20
80
20
53
17
4
8
70
1.29
212499235--212499281
22
2.3
21
82
13
62
17
4
8
70
1.29
212502647--212503013
46
8.4
46
86
11
531
24
25
15
35
1.94
212502800--212503013
84
2.6
84
97
2
407
23
24
16
35
1.95
212502802--212502874
25
3.1
25
60
25
59
21
21
19
36
1.95
212502845--212503002
36
4.1
37
84
15
212
23
25
17
33
1.96
212502927--212503002
38
2.0
38
100
0
152
23
26
18
31
1.97
212504616--212504730
58
2.0
58
98
0
221
24
19
15
40
1.90
212508789--212508964
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
212508786--212508957
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
212516352--212516527
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
212516349--212516520
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
212520298--212520443
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
212520330--212520481
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
212528418--212528563
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
212528450--212528601
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
212532059--212532128
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
212540087--212540156
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
212545200--212545371
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
212545192--212545367
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
212547750--212547838
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770