Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  452  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
139183850--139184057
40
5.2
39
84
1
209
25
25
22
26
2.00
139183850--139184055
80
2.6
81
84
3
247
24
26
22
26
2.00
139185715--139185862
40
3.7
40
90
0
224
27
25
22
24
2.00
139196102--139196143
21
2.0
21
85
0
57
21
16
42
19
1.89
139200310--139200690
47
8.1
47
89
1
530
33
11
29
25
1.90
139200432--139200506
22
3.3
22
64
29
57
30
13
30
25
1.94
139200664--139200800
46
3.0
46
86
0
193
35
10
29
24
1.88
139203778--139203948
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
139205599--139205794
40
4.9
40
98
0
365
22
22
30
23
1.99
139205958--139206010
25
2.1
25
82
6
63
35
13
30
20
1.91
139207590--139207738
40
3.7
40
81
3
183
25
25
22
26
2.00
139207590--139207737
80
1.9
80
85
5
210
25
25
22
27
2.00
139215887--139216068
40
4.6
40
84
4
235
24
26
23
25
2.00
139224553--139224582
13
2.4
13
94
5
53
60
0
16
23
1.36
139228024--139228153
40
3.2
40
84
4
174
23
29
24
22
1.99
139240805--139241015
48
4.4
48
78
12
186
27
29
18
24
1.98
139247519--139248552
72
13.7
73
75
12
700
33
19
16
30
1.94
139247514--139248552
147
6.9
148
83
7
1127
33
19
16
30
1.94
139248014--139248552
73
7.2
72
78
10
494
33
19
17
30
1.94
139250299--139250338
20
2.0
20
100
0
80
35
20
10
35
1.86
139256790--139256825
12
3.0
12
91
0
54
47
5
22
25
1.73
139258534--139258576
12
3.4
12
75
12
50
81
6
11
0
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
139258858--139258904
22
2.2
22
92
7
80
4
0
25
70
1.05
139258868--139258912
20
2.1
21
84
8
56
4
0
42
53
1.21
139258868--139258913
22
2.1
22
83
0
56
4
0
43
52
1.21
139264710--139264863
46
3.3
46
83
7
177
21
30
20
27
1.98
139264738--139264863
47
2.7
46
82
12
159
20
30
21
26
1.98
139266233--139266427
24
8.1
24
96
0
336
36
25
17
20
1.94
139270942--139270979
19
2.1
19
90
5
60
21
39
23
15
1.92
139271121--139271224
51
2.0
51
98
0
199
24
30
11
33
1.91
139272039--139272068
13
2.3
13
100
0
60
46
13
16
23
1.82
139275823--139275876
15
3.6
15
78
9
65
61
14
14
9
1.57
139279587--139279707
44
2.7
43
87
3
161
33
30
16
19
1.94
139283928--139283957
11
2.7
11
89
0
51
60
0
0
40
0.97
139284719--139284766
26
1.9
24
83
8
60
6
8
10
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1.20
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Copy
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26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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