Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  391  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120111469--120111498
14
2.1
14
100
0
60
36
0
6
56
1.26
120119338--120119422
44
1.9
44
83
9
111
41
2
0
56
1.12
120119410--120119458
22
2.2
22
78
7
55
42
4
0
53
1.20
120120580--120120615
16
2.3
16
95
4
65
66
0
0
33
0.92
120125121--120125269
71
2.1
71
98
0
289
26
15
18
39
1.90
120125398--120125492
40
2.4
38
81
8
102
13
12
36
36
1.83
120126278--120126313
18
2.0
18
94
0
63
63
16
0
19
1.30
120131108--120131247
74
1.9
74
88
5
212
38
6
19
35
1.77
120132487--120132517
8
3.9
8
95
0
53
83
0
0
16
0.64
120132841--120132877
5
7.6
5
96
3
67
18
0
0
81
0.70
120137411--120137440
15
1.9
16
93
6
53
76
0
3
20
0.92
120137718--120137746
9
3.3
9
90
9
51
55
6
13
24
1.63
120137823--120137922
22
4.4
23
69
16
84
59
0
10
31
1.31
120137839--120137922
30
2.7
32
78
7
84
59
0
9
30
1.29
120139038--120139098
22
2.8
22
80
2
61
68
6
6
18
1.33
120139189--120139280
36
2.5
36
79
10
98
53
1
10
34
1.43
120139305--120139336
16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
120139440--120139482
16
2.8
15
86
6
59
62
0
6
30
1.21
120139577--120139603
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
120139697--120139740
3
14.7
3
100
0
88
65
0
0
34
0.93
120140198--120140275
28
2.6
30
86
10
115
52
17
5
24
1.65
120140471--120140500
12
2.5
12
100
0
60
6
0
6
86
0.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120140804--120141593
205
3.9
205
94
1
1318
29
22
18
29
1.98
120148815--120148940
29
4.6
29
78
11
138
24
32
15
27
1.95
120148845--120148925
28
3.2
25
85
11
119
27
30
13
28
1.94
120148836--120148940
29
3.9
28
86
9
146
25
31
14
28
1.95
120156732--120156844
29
3.9
29
92
0
181
28
30
13
27
1.94
120156713--120156843
58
2.3
57
89
1
190
26
32
14
25
1.95
120161863--120161941
38
2.1
38
95
0
140
31
16
17
34
1.93
120172457--120172605
31
4.8
31
86
4
185
27
19
25
27
1.99
120172623--120172745
47
2.7
46
84
2
147
28
16
25
30
1.96
120172615--120172798
49
3.8
49
81
9
173
27
15
25
32
1.95
120177051--120177164
50
2.3
51
90
3
185
37
14
21
25
1.92
120177155--120177327
93
1.9
93
85
0
238
28
19
24
27
1.99
120177155--120177334
31
5.8
31
85
0
207
28
20
24
27
1.99
120177352--120177473
47
2.6
46
85
2
154
27
15
26
30
1.96
120177403--120177527
49
2.6
47
88
3
171
28
14
26
30
1.95
120181770--120181883
50
2.3
51
87
3
167
38
14
21
25
1.91
120181874--120182051
31
5.8
30
84
7
207
27
21
23
27
1.99
120181895--120182043
61
2.4
60
83
5
174
28
22
22
27
1.99
120182108--120182232
49
2.6
49
91
3
193
28
15
26
30
1.96
120190304--120190328
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
120190374--120190404
16
1.9
16
93
0
53
35
12
0
51
1.40
120191807--120191840
12
2.8
12
95
0
59
41
23
0
35
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120193447--120193490
19
2.4
19
85
7
56
50
2
9
38
1.47
120195308--120195376
28
2.5
28
92
2
113
43
26
10
20
1.83
120197599--120197629
5
6.2
5
92
0
53
25
19
16
38
1.92
120202981--120203144
43
3.8
43
79
9
181
31
23
21
23
1.99
120205859--120205918
30
2.0
30
90
0
93
28
25
8
38
1.84
120210626--120210807
39
4.6
38
81
10
197
26
28
20
24
1.99
120210626--120210807
79
2.3
79
83
5
217
26
28
20
24
1.99
120218333--120218513
43
4.3
43
87
6
264
31
29
25
13
1.94
120218333--120218506
84
2.1
84
91
3
278
31
29
24
14
1.95
120220417--120220511
48
2.0
48
95
0
172
31
28
6
33
1.82
120223765--120223814
24
2.1
24
100
0
100
16
12
22
50
1.77
120224173--120224268
47
2.0
47
95
0
174
37
2
21
38
1.66
120224630--120224741
25
4.5
25
77
2
118
32
21
20
25
1.98
120226644--120226815
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
120226636--120226811
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
120229194--120229282
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
120229194--120229273
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
120229205--120229282
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
120232234--120232405
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
120232226--120232401
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
120236675--120236718
20
2.2
20
88
4
63
25
15
31
27
1.96
120242087--120242249
39
4.2
39
92
0
254
22
20
32
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120250065--120250227
39
4.2
39
93
0
263
23
20
31
24
1.98
120250065--120250257
39
4.9
39
90
0
251
23
21
31
23
1.98
120251979--120252022
20
2.2
20
88
4
63
25
15
31
27
1.96
120253251--120253376
28
4.5
27
91
4
180
29
7
12
50
1.69
120253251--120253376
56
2.2
56
90
2
200
29
7
12
50
1.69
120262048--120262219
43
4.0
44
72
10
158
32
24
18
24
1.97
120268902--120269068
40
4.2
40
78
6
171
26
22
27
23
1.99
120273558--120273798
79
3.0
79
82
6
274
25
24
21
29
1.99
120273581--120273805
40
5.7
41
84
7
261
25
24
22
27
2.00
120279473--120279547
29
2.6
29
89
4
107
26
16
32
25
1.96
120279582--120279616
2
17.5
2
93
0
61
51
0
0
48
1.00
120283170--120283243
29
2.6
29
80
0
85
21
32
17
28
1.96
120290278--120290405
40
3.2
40
78
4
116
25
23
27
23
2.00
120298335--120298464
40
3.3
39
83
4
163
23
25
28
23
1.99
120299841--120299993
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
120303364--120303414
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
120305157--120305256
40
2.5
40
81
3
112
26
29
23
22
1.99
120305201--120305307
40
2.7
39
80
12
119
24
27
25
23
2.00
120308718--120308768
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
120315814--120315919
19
5.7
19
92
4
180
36
15
12
35
1.84
120315814--120315919
36
2.8
37
91
5
169
36
15
12
35
1.84
120315844--120315881
17
2.5
15
87
12
51
34
15
10
39
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120315806--120315929
55
2.2
54
86
11
171
36
15
11
37
1.83
120316694--120316811
31
3.5
35
89
9
135
22
23
16
37
1.94
120316717--120316811
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
120317003--120317121
24
5.0
24
89
5
170
26
22
21
28
1.99
120317003--120317121
47
2.5
48
89
5
170
26
22
21
28
1.99
120317172--120317231
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
120317172--120317226
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
120317274--120317321
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
120324835--120324928
31
3.1
31
96
1
172
23
21
15
39
1.92
120325119--120325237
24
5.0
24
89
5
170
26
22
21
28
1.99
120325119--120325237
47
2.5
48
89
5
170
26
22
21
28
1.99
120325288--120325347
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
120325288--120325342
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
120325390--120325437
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
120328509--120328559
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
120330631--120330678
25
1.9
25
91
8
80
45
2
12
39
1.54
120332743--120332793
26
2.0
26
88
7
77
47
3
11
37
1.59
120334861--120334910
26
1.9
26
92
8
84
48
4
12
36
1.59
120336945--120336995
26
2.0
26
88
7
77
45
1
11
41
1.52
120336984--120337017
18
1.9
18
88
5
52
20
5
11
61
1.50
120338395--120338448
16
3.2
16
78
21
58
27
0
1
70
0.98
120338392--120338452
21
2.9
20
71
20
52
29
0
1
68
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
120341026--120341203
40
4.5
40
90
2
261
25
23
27
23
2.00
120346773--120346812
19
2.1
19
95
0
71
72
0
12
15
1.12
120347701--120347748
15
3.1
16
83
16
57
70
2
0
27
0.98
120347692--120347762
11
6.5
11
76
12
58
66
2
1
29
1.15
120352368--120352417
26
2.0
25
92
4
82
46
2
12
40
1.52
120353795--120353934
27
5.2
28
90
5
184
35
22
24
17
1.96
120355551--120355659
26
4.2
26
97
0
191
35
24
6
33
1.81
120357300--120357350
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
120361787--120361855
21
3.3
21
87
2
95
11
24
8
55
1.64
120364221--120364314
18
5.4
18
92
3
131
28
9
25
36
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770