Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  488  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
150938498--150938627
40
3.2
40
83
4
165
23
29
25
22
1.99
150946540--150946668
40
3.2
41
81
8
160
23
28
25
22
1.99
150951858--150952028
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
150959894--150960064
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
150967887--150968428
180
3.0
180
96
1
998
40
9
15
35
1.79
150970084--150970140
28
2.0
28
96
0
105
21
10
33
35
1.87
150972490--150972525
9
3.9
9
88
3
54
22
0
19
58
1.40
150972490--150972536
20
2.4
19
89
3
67
21
0
21
57
1.41
150973436--150973473
20
2.0
20
94
5
69
28
7
5
57
1.49
150974200--150974250
24
2.1
24
85
0
66
35
17
11
35
1.87
150975778--150975904
63
2.0
63
95
0
227
33
22
7
37
1.82
150993558--150993596
8
4.9
8
87
0
60
41
23
25
10
1.86
150995727--150995879
39
3.9
39
91
0
234
24
20
30
24
1.99
150995728--150995910
39
4.6
39
88
0
231
24
22
30
23
1.99
151000897--151000925
15
1.9
15
100
0
58
20
10
13
55
1.68
151005701--151005885
79
2.3
81
83
7
227
23
27
24
24
2.00
151005694--151005885
40
4.8
39
76
8
163
23
28
23
24
2.00
151013757--151013941
79
2.3
81
83
7
227
23
27
24
24
2.00
151013750--151013941
40
4.8
39
76
8
163
23
28
23
24
2.00
151017597--151017697
28
3.5
29
86
6
125
29
27
13
28
1.95
151028452--151028502
20
2.5
20
96
0
93
35
9
21
33
1.86
151028549--151028715
23
7.1
23
94
2
271
28
21
20
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151028548--151028737
24
8.0
23
90
4
265
28
21
21
28
1.99
151028547--151028715
47
3.6
47
91
3
277
28
21
20
28
1.98
151034712--151034781
25
2.8
25
93
0
113
24
22
25
27
2.00
151034987--151035225
27
8.9
26
81
9
241
25
20
17
35
1.95
151034986--151035225
53
4.5
54
86
1
313
25
20
17
35
1.95
151034986--151035224
80
3.0
79
86
6
311
25
20
17
35
1.95
151035043--151035237
107
1.8
107
84
2
257
26
20
16
36
1.94
151035229--151035395
27
6.2
27
81
9
137
29
8
20
40
1.83
151035068--151035277
107
2.0
107
79
11
234
27
18
17
36
1.94
151035245--151035395
54
2.8
54
88
6
216
28
8
21
41
1.82
151035245--151035395
81
1.9
81
86
5
216
28
8
21
41
1.82
151035388--151035621
27
8.7
27
86
1
274
41
8
20
29
1.81
151037956--151038024
24
2.8
25
86
4
95
26
23
23
27
2.00
151038228--151038494
27
10.0
27
84
4
328
23
20
20
35
1.96
151038229--151038492
107
2.5
106
86
3
386
23
20
19
35
1.95
151038485--151038688
106
1.9
106
82
5
252
28
8
21
41
1.83
151038497--151038688
53
3.6
51
83
6
204
29
8
20
41
1.82
151038484--151038702
27
8.2
27
83
2
201
30
8
21
39
1.83
151038681--151038873
27
7.2
27
89
1
273
39
8
22
29
1.84
151038680--151038884
80
2.6
80
88
1
295
40
8
21
29
1.84
151042731--151042840
40
2.8
40
85
0
148
26
23
26
23
2.00
151042731--151042880
40
3.8
39
80
7
133
26
22
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151050925--151051092
40
4.2
40
80
3
196
25
22
27
25
2.00
151059031--151059194
40
4.1
40
76
3
161
27
21
25
26
1.99
151059031--151059194
80
2.1
79
81
3
186
27
21
25
26
1.99
151073851--151073915
24
2.6
26
80
4
71
26
23
15
35
1.94
151084401--151084433
11
3.1
11
86
4
50
0
27
21
51
1.48
151084402--151084435
10
3.3
10
84
8
50
0
23
20
55
1.43
151089349--151089529
77
2.3
81
83
7
239
24
28
22
24
1.99
151089347--151089529
40
4.7
40
83
9
234
25
28
21
24
1.99
151097492--151097669
40
4.6
40
78
15
189
25
28
22
23
1.99
151097492--151097670
38
4.7
39
80
14
185
25
28
22
23
1.99
151103584--151103765
39
4.6
39
89
0
247
23
31
21
23
1.98
151103614--151103766
39
3.9
39
92
0
252
23
32
20
23
1.98
151111661--151111811
38
3.9
39
90
3
234
23
31
20
23
1.98
151111661--151111810
77
1.9
78
93
1
257
24
31
20
24
1.98
151115522--151115563
17
2.5
17
84
0
57
16
21
35
26
1.94
151116009--151116118
27
4.1
27
81
10
136
38
20
10
30
1.86
151116009--151116162
80
1.9
81
82
6
197
39
19
9
31
1.83
151116128--151116187
27
2.2
27
81
0
66
45
16
10
28
1.80
151125378--151125429
27
1.9
27
100
0
104
17
23
19
40
1.91
151125466--151125532
24
2.8
24
86
2
98
16
20
19
43
1.88
151133301--151133352
26
2.0
27
84
3
70
17
23
19
40
1.91
151133405--151133450
24
1.9
24
95
0
83
19
13
21
45
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151135786--151135913
47
2.7
46
89
4
193
23
14
28
33
1.94
151139721--151139945
124
1.8
124
86
1
326
30
10
24
35
1.88
151139940--151140069
40
3.2
40
83
4
165
22
25
29
23
1.99
151147824--151148048
124
1.8
124
86
1
326
30
10
24
35
1.88
151148046--151148153
40
2.8
38
87
8
148
23
26
28
21
1.99
151148043--151148169
40
3.2
40
80
9
147
22
25
28
23
1.99
151154825--151154874
25
2.0
25
88
0
73
36
22
14
28
1.92
151154913--151154969
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
151154911--151154973
20
3.2
20
95
0
117
36
12
19
31
1.89
151155028--151155125
47
2.1
47
90
5
153
30
19
19
30
1.96
151155027--151155146
24
5.0
24
84
10
156
30
20
20
29
1.98
151155340--151155403
31
2.1
31
90
0
101
39
15
23
21
1.92
151157757--151158090
49
6.9
49
94
2
595
33
8
27
30
1.87
151157755--151158090
96
3.5
96
96
1
636
33
8
27
30
1.87
151157755--151158090
145
2.3
144
95
2
602
33
8
27
30
1.87
151158090--151158187
50
2.0
50
95
0
178
33
7
26
32
1.84
151158227--151158317
37
2.4
37
96
1
164
23
18
32
25
1.97
151165716--151165763
19
2.6
18
80
6
51
77
4
18
0
0.93
151165727--151165763
19
1.9
19
88
0
56
81
2
16
0
0.81
151166994--151167100
40
2.7
40
82
0
124
28
22
25
23
1.99
151167035--151167161
40
3.2
39
83
8
141
22
24
29
23
1.99
151173764--151173800
17
2.1
18
90
5
58
81
5
13
0
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151173764--151173800
18
2.1
18
90
5
58
81
5
13
0
0.86
151175039--151175145
40
2.7
40
82
0
124
28
22
25
23
1.99
151175080--151175206
40
3.2
39
83
8
141
22
24
29
23
1.99
151180879--151180913
2
17.5
2
100
0
70
51
48
0
0
1.00
151184139--151184204
34
2.0
33
84
3
87
24
25
22
27
2.00
151186863--151187049
40
4.7
40
80
4
171
28
22
25
22
1.99
151186863--151187016
80
1.9
80
85
0
209
27
22
26
23
1.99
151186902--151187084
80
2.3
80
78
2
181
27
24
26
20
1.99
151192208--151192286
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
151192926--151192965
2
20.0
2
89
0
62
45
2
2
50
1.28
151204989--151205155
40
4.2
40
79
2
158
23
26
23
26
2.00
151205005--151205153
80
1.9
79
83
6
194
22
26
24
26
2.00
151207993--151208033
18
2.3
18
95
0
73
46
14
4
34
1.66
151208855--151209008
42
3.6
42
85
3
202
27
26
14
30
1.95
151209629--151209729
49
2.1
49
96
0
184
48
15
9
25
1.76
151210780--151210848
29
2.4
29
92
0
111
26
23
24
26
2.00
151212570--151212608
21
1.9
20
84
5
51
46
17
2
33
1.62
151215657--151215874
40
5.4
40
85
3
251
26
23
26
23
2.00
151215656--151215888
79
2.9
79
80
4
252
26
23
26
23
2.00
151215817--151215900
40
2.1
40
82
4
98
26
27
26
20
1.99
151222496--151222736
39
6.2
39
91
0
383
22
32
20
23
1.98
151227034--151227252
40
5.4
40
85
2
251
25
24
26
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
151227034--151227252
120
1.8
121
84
3
298
25
24
26
23
2.00
151227085--151227278
40
4.8
40
85
5
149
26
24
26
22
2.00
151227101--151227278
80
2.2
80
82
0
194
27
24
26
21
1.99
151231080--151231205
43
2.9
43
75
11
105
30
26
17
24
1.97
151239477--151239606
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
151247585--151247714
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
151254750--151254806
9
5.9
9
76
15
60
35
7
21
36
1.80
151254748--151254818
20
3.5
20
90
0
115
35
9
21
33
1.86
151254865--151255031
23
7.1
23
95
2
280
28
22
20
28
1.99
151254864--151255053
24
8.0
23
91
4
274
28
22
21
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770