Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  11  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2974914--2974960
21
2.2
20
79
17
51
51
0
6
42
1.27
2982991--2983151
76
2.1
76
97
0
304
38
21
9
31
1.85
2983021--2983141
39
3.2
39
62
29
96
38
23
9
28
1.85
2986198--2986273
41
1.9
39
87
12
111
53
10
2
32
1.49
2987311--2987346
18
1.9
18
88
5
54
25
5
0
69
1.10
2988599--2988663
24
2.7
24
83
4
87
26
10
12
50
1.72
2990312--2990342
12
2.7
11
90
9
53
29
0
0
70
0.87
2990323--2990382
30
2.0
30
87
6
86
31
3
10
55
1.50
2991732--2991823
23
4.0
23
80
5
105
15
14
27
43
1.85
2991738--2991855
23
5.0
23
77
11
80
15
16
23
44
1.85
2991814--2991882
25
2.8
25
93
0
111
17
17
15
49
1.80
2991914--2991970
23
2.5
23
91
0
87
28
5
24
42
1.76
2994233--2994258
8
3.2
8
100
0
52
26
23
11
38
1.89
2995271--2995309
20
1.9
21
89
5
62
41
0
0
58
0.98
2995267--2995315
21
2.4
22
76
13
59
36
0
0
63
0.95
2997513--2997623
23
4.7
23
75
8
100
14
18
25
42
1.87
2997589--2997653
25
2.6
25
92
0
103
15
18
20
46
1.84
3002411--3002485
37
2.0
38
84
7
100
57
6
18
17
1.61
3005741--3005817
30
2.5
30
79
12
86
61
3
0
35
1.15
3005742--3005837
41
2.5
40
76
10
101
59
5
0
35
1.20
3006199--3006244
21
2.1
21
84
4
56
36
0
2
60
1.09
3006350--3006396
21
2.5
18
78
18
51
48
4
2
44
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3007048--3007110
18
3.3
18
68
12
54
17
4
47
30
1.68
3007049--3007134
39
2.2
39
89
4
129
18
4
52
24
1.64
3007130--3007374
45
5.6
45
77
12
224
20
5
54
19
1.64
3007101--3007428
21
15.2
21
72
9
176
20
5
53
19
1.65
3007088--3007428
63
5.3
63
83
7
389
20
5
53
20
1.65
3007130--3007430
45
6.9
45
77
13
195
20
5
54
19
1.64
3013117--3013198
42
2.0
42
82
4
103
15
29
26
28
1.96
3015700--3015766
25
2.7
25
90
4
100
26
20
20
31
1.98
3017620--3017672
21
2.5
21
84
6
72
11
33
33
20
1.88
3019083--3019117
18
1.9
18
94
0
61
54
2
8
34
1.46
3019075--3019116
9
4.7
9
82
11
50
52
4
9
33
1.55
3019498--3019607
3
36.0
3
72
7
69
59
3
4
32
1.35
3020762--3020806
21
2.1
21
83
0
54
11
2
40
46
1.52
3027572--3027596
1
25.0
1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
3032569--3032776
90
2.3
90
85
0
281
28
25
13
31
1.94
3034914--3034954
14
2.6
16
77
22
50
39
2
0
58
1.11
3040337--3040406
24
3.1
22
75
20
65
34
1
1
62
1.13
3049435--3049854
210
2.0
210
98
0
804
35
11
21
31
1.89
3051981--3052028
24
2.0
24
100
0
96
45
12
12
29
1.78
3052688--3053516
44
19.2
44
82
7
932
30
14
27
26
1.96
3052909--3052979
35
2.0
35
97
0
133
23
18
28
29
1.98
3053272--3053343
37
1.9
37
91
0
117
38
11
27
22
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3053229--3053387
81
2.0
81
87
5
232
35
13
25
25
1.92
3055294--3055348
21
2.6
21
77
13
58
32
5
0
61
1.19
3056457--3056486
14
2.1
14
93
0
51
46
36
0
16
1.47
3067010--3067091
27
3.0
27
96
0
146
17
14
23
45
1.85
3077633--3077679
13
3.5
13
81
13
60
74
0
0
25
0.82
3077625--3077679
23
2.5
22
82
5
74
76
0
0
23
0.79
3077626--3077672
5
9.8
5
81
9
53
74
0
0
25
0.82
3077712--3077782
37
1.9
37
83
8
92
66
0
4
29
1.11
3079304--3079368
34
1.9
33
90
6
103
30
3
38
27
1.72
3082120--3082152
13
2.3
15
85
15
52
87
0
12
0
0.53
3082121--3082152
7
4.7
7
92
7
57
87
0
12
0
0.54
3092931--3093105
71
2.5
69
86
3
226
28
14
23
34
1.94
3093203--3093484
141
2.0
139
96
1
519
25
17
19
37
1.93
3093818--3093927
26
4.2
26
94
2
177
34
4
24
36
1.76
3095700--3095986
137
2.1
137
96
0
520
24
17
25
32
1.97
3096888--3096921
13
2.5
13
90
4
50
20
11
8
58
1.59
3096700--3097050
140
2.5
140
94
2
605
24
17
20
37
1.94
3097056--3097196
72
2.0
72
98
0
273
32
15
18
33
1.92
3097150--3097245
49
2.0
49
97
0
183
30
16
20
32
1.95
3096970--3097471
275
1.8
273
87
3
758
31
16
18
33
1.94
3097078--3097317
121
2.0
121
95
0
435
30
16
18
33
1.94
3097199--3097553
79
4.7
75
86
5
457
31
17
19
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3097199--3097553
151
2.4
150
86
4
475
31
17
19
32
1.95
3097475--3097648
95
1.8
95
82
4
226
28
21
18
31
1.97
3097570--3097762
79
2.5
76
86
3
242
31
18
18
31
1.95
3097728--3097889
88
1.8
88
85
2
227
25
17
20
36
1.94
3097914--3097975
30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83
3097327--3098143
254
3.3
248
82
7
766
28
17
19
35
1.94
3098868--3098892
8
3.1
8
100
0
50
24
52
12
12
1.72
3101677--3102021
3
112.7
3
67
17
119
61
4
2
31
1.31
3101773--3101827
20
2.7
21
76
20
55
56
7
0
36
1.27
3101591--3102154
150
3.7
149
85
10
641
60
5
3
31
1.35
3102766--3102804
19
2.1
18
85
4
51
15
0
5
79
0.90
3103795--3103857
30
2.1
30
90
0
99
55
15
3
25
1.55
3107779--3107817
20
1.9
21
89
5
62
51
15
12
20
1.76
3108174--3108214
11
3.9
11
78
12
50
53
0
0
46
1.00
3108173--3108214
20
2.0
21
86
4
59
52
0
0
47
1.00
3110138--3110184
24
2.0
24
100
0
94
46
8
10
34
1.69
3112147--3112203
24
2.4
25
82
11
66
42
3
5
49
1.42
3116314--3116360
5
9.8
5
80
15
55
59
0
4
36
1.17
3116315--3116350
19
1.9
18
94
5
63
55
0
5
38
1.23
3116561--3116595
3
11.7
3
87
0
52
60
0
0
40
0.97
3117244--3117277
14
2.2
16
85
15
54
47
0
52
0
1.00
3117238--3117290
22
2.4
22
78
12
63
45
0
54
0
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3117810--3117872
22
2.9
22
90
0
90
7
6
52
33
1.56
3125736--3125777
21
2.0
22
85
4
59
45
2
2
50
1.27
3127608--3127636
6
4.8
6
100
0
58
0
13
0
86
0.58
3141891--3141930
16
2.6
16
92
4
64
55
5
20
20
1.62
3141986--3142034
18
2.7
18
87
3
62
34
0
18
46
1.49
3142002--3142037
18
2.0
18
100
0
72
27
0
22
50
1.50
3142005--3142044
18
2.2
18
90
0
62
30
0
15
55
1.41
3144631--3144753
43
2.9
42
76
7
140
26
26
16
30
1.96
3145840--3145996
10
15.2
10
68
13
77
61
0
3
35
1.17
3145869--3145981
41
2.7
41
78
8
120
61
0
4
32
1.21
3145904--3145996
31
3.1
29
73
15
91
62
1
2
34
1.14
3145906--3146035
21
6.6
20
69
17
58
61
1
5
31
1.28
3145906--3146032
60
2.1
61
82
8
154
60
1
5
32
1.29
3146504--3146534
16
1.9
16
93
0
53
22
6
3
67
1.28
3146598--3146651
20
2.8
19
78
10
56
24
3
3
68
1.22
3146620--3146658
18
2.2
17
95
4
69
20
0
2
76
0.90
3146597--3146746
21
7.5
20
74
13
98
30
3
2
64
1.24
3146619--3146779
10
16.7
10
69
19
76
27
3
2
66
1.19
3146619--3146724
9
11.0
9
69
19
56
28
1
2
66
1.16
3146665--3146746
30
2.7
31
79
12
107
34
3
1
60
1.22
3148669--3148717
21
2.3
21
89
0
71
24
16
12
46
1.81
3149814--3149876
31
2.0
31
96
0
117
46
22
1
30
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3150600--3150702
36
2.9
36
77
0
98
23
32
16
28
1.96
3152508--3152576
21
3.3
21
82
13
88
59
0
2
37
1.12
3152573--3152653
29
2.8
28
72
5
72
60
1
11
27
1.38
3152861--3152919
9
6.2
9
81
11
64
30
5
0
64
1.15
3152866--3152934
20
3.5
20
86
3
88
27
5
0
66
1.14
3152918--3152981
30
2.1
30
85
5
85
31
4
1
62
1.25
3157783--3157865
43
1.9
43
90
0
130
22
22
2
51
1.59
3158484--3158524
19
2.2
18
86
4
55
34
17
0
48
1.47
3161797--3161837
13
3.2
13
100
0
82
53
7
0
39
1.29
3169217--3169278
22
2.7
23
75
5
63
8
6
11
74
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770