genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.303.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  303  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
92573461--92573884	218	1.9	217	93	1	733	35	20	17	26	1.95
92573601--92573744	78	1.9	77	86	4	209	30	20	18	30	1.96
92573678--92573936	140	1.8	141	91	2	432	36	19	17	26	1.94
92573233--92574098	358	2.4	354	90	4	1341	35	19	17	27	1.94
92573688--92574030	140	2.5	138	84	4	395	35	20	16	28	1.94
92573969--92574565	73	7.8	73	71	16	375	32	23	16	27	1.95
92574191--92574354	87	1.9	86	91	1	265	34	24	14	26	1.94
92573973--92574661	152	4.4	153	79	10	739	33	22	16	27	1.95
92586600--92586636	18	2.0	19	89	5	58	59	0	5	35	1.20
92587761--92587800	16	2.5	16	100	0	80	45	0	55	0	0.99
92588830--92588880	13	3.8	13	80	12	59	21	0	3	74	0.98
92589163--92589222	32	1.9	32	86	6	88	6	5	10	78	1.08
92589916--92589970	23	2.6	21	78	13	67	27	14	1	56	1.49
92590269--92590357	3	30.0	3	73	10	67	32	7	2	57	1.40
92590287--92590353	20	3.2	21	83	8	75	32	8	1	56	1.39
92591632--92591660	14	2.0	15	93	6	51	65	6	0	27	1.18
92591639--92591752	12	9.1	13	78	12	53	57	5	0	36	1.28
92591692--92591753	2	31.0	2	93	0	106	50	3	0	46	1.17
92591682--92591753	12	6.0	12	93	0	99	50	4	1	44	1.30
92591682--92591744	8	7.9	8	90	0	63	50	3	1	44	1.27
92591849--92591873	2	12.5	2	100	0	50	52	0	0	48	1.00
92593128--92593709	87	6.6	88	74	14	371	35	19	16	28	1.93
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
92593361--92593730	92	4.0	93	80	7	362	37	18	17	26	1.93
92593528--92593566	15	2.6	15	88	8	53	53	5	12	28	1.60
92593228--92593975	87	8.7	86	72	15	351	36	18	16	29	1.92
92593637--92594341	72	9.3	73	76	13	484	34	18	17	29	1.94
92593748--92593953	83	2.4	85	84	9	244	34	17	16	31	1.92
92593920--92595037	147	7.2	145	71	16	583	32	20	18	29	1.96
92594185--92594670	163	3.0	164	82	7	569	32	19	18	28	1.96
92594536--92594726	77	2.5	75	82	12	239	33	20	16	29	1.95
92594729--92594763	14	2.5	14	90	0	52	57	5	20	17	1.60
92594650--92594820	93	1.8	93	86	2	245	32	19	20	26	1.97
92594339--92594984	243	2.7	238	81	8	724	32	19	18	28	1.96
92594747--92595037	75	3.9	73	86	3	377	31	20	18	29	1.96
92605169--92605215	2	24.0	2	84	4	60	53	4	0	42	1.20
92605144--92605227	22	3.8	23	76	16	70	54	5	2	36	1.38
92605169--92605215	12	4.0	12	91	2	69	53	4	0	42	1.20
92605308--92605338	2	15.5	2	100	0	62	51	0	0	48	1.00
92610738--92610763	13	2.0	13	100	0	52	0	38	23	38	1.55
92613123--92613330	40	5.2	39	84	1	218	25	26	22	25	2.00
92613123--92613329	80	2.6	80	83	1	245	25	26	22	25	2.00
92619210--92619339	65	2.0	65	98	1	253	18	30	18	33	1.95
92621135--92621339	40	5.1	39	79	3	194	25	24	22	27	2.00
92625060--92625229	93	1.8	92	96	1	313	28	28	20	21	1.98
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
92625055--92625226	45	3.7	46	78	13	210	29	27	20	22	1.98
92625648--92625707	30	2.0	30	90	0	93	30	25	8	36	1.85
92629897--92630067	92	1.9	92	92	0	288	29	28	20	21	1.98
92629893--92630063	46	3.7	46	78	14	190	30	28	20	21	1.98
92630486--92630545	30	2.0	30	90	0	93	30	25	8	36	1.85
92632542--92632604	24	2.6	24	100	0	126	34	26	17	20	1.95
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92836124--92836300	79	2.2	80	84	3	232	23	27	23	25	2.00
92844144--92844319	40	4.4	40	85	2	192	23	27	22	26	2.00
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
92854709--92854784	24	3.3	22	76	12	73	18	23	21	36	1.95
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92859552--92859719	40	4.2	40	79	1	158	22	27	23	26	2.00
92859568--92859717	80	1.9	80	84	5	205	21	27	24	26	1.99
92867559--92867725	40	4.2	40	79	2	158	22	27	23	26	2.00
92867575--92867723	80	1.9	79	84	6	203	21	27	24	26	1.99
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92875658--92875807	67	2.2	67	81	8	171	32	17	28	21	1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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