Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  284  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86440587--86440641
23
2.5
22
76
8
58
29
0
16
54
1.42
86441838--86441863
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
86447737--86447924
29
6.6
29
87
2
254
26
15
31
26
1.96
86447733--86447953
85
2.6
86
83
4
257
26
15
31
26
1.96
86458451--86458580
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
86458415--86458580
80
2.1
78
81
8
194
25
24
27
22
2.00
86466485--86466614
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
86481936--86482145
46
4.7
46
84
10
285
21
24
14
39
1.91
86482058--86482133
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
86484283--86484334
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
86488577--86488634
16
3.4
16
68
13
53
3
5
27
63
1.31
86488564--86488634
35
2.0
35
97
0
133
5
7
25
61
1.43
86493181--86493239
29
2.0
29
100
0
118
28
27
16
27
1.97
86494775--86494849
37
2.0
37
94
0
132
30
9
17
42
1.80
86496183--86496284
40
2.5
40
87
0
141
24
17
23
34
1.96
86496275--86496356
26
3.0
27
85
7
103
26
10
30
31
1.91
86499090--86499265
47
3.6
47
71
15
158
37
13
23
26
1.91
86499090--86499320
101
2.3
101
91
3
367
37
13
23
25
1.91
86499244--86499548
55
5.6
55
81
5
345
35
18
24
21
1.95
86499252--86499548
108
2.7
108
91
0
468
35
18
24
21
1.96
86520686--86520849
45
3.6
44
76
16
163
21
18
28
31
1.97
86528001--86528151
39
3.9
39
91
2
225
24
32
19
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86530618--86530743
46
2.7
45
84
10
157
26
19
30
22
1.98
86534254--86534380
46
2.8
46
96
0
227
21
20
27
30
1.98
86542147--86542321
85
2.0
87
81
11
209
25
16
25
33
1.96
86542159--86542316
43
3.7
42
77
12
162
24
17
27
31
1.97
86544684--86544813
40
3.3
39
83
4
163
23
28
25
23
1.99
86549924--86549961
16
2.3
17
86
4
51
44
39
5
10
1.61
86551289--86551402
28
4.0
28
83
2
129
28
15
28
26
1.96
86554065--86554103
16
2.4
17
91
4
62
48
35
5
10
1.59
86555419--86555518
29
3.5
29
84
1
121
25
15
30
30
1.95
86556379--86556431
18
2.8
18
74
5
52
30
5
3
60
1.37
86558152--86558250
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
86560364--86560492
64
2.0
64
100
0
258
33
20
10
35
1.87
86561716--86561814
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
86569378--86569476
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
86571586--86571714
64
2.0
64
100
0
258
33
20
10
35
1.87
86577424--86577491
28
2.5
28
90
4
104
30
25
14
29
1.95
86582697--86582724
14
2.0
14
100
0
56
14
14
0
71
1.15
86582721--86582799
5
14.2
6
80
17
66
32
2
16
48
1.60
86582722--86582803
11
7.5
11
69
23
50
32
2
17
47
1.60
86582758--86582803
20
2.2
21
92
7
85
32
0
19
47
1.50
86590975--86591036
32
1.9
32
96
0
115
38
22
9
29
1.86
86598330--86598357
13
2.2
13
100
0
56
28
7
14
50
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86608263--86608306
21
2.1
21
83
8
54
25
9
2
63
1.35
86610538--86610581
22
2.0
22
100
0
88
18
22
4
54
1.61
86614700--86614761
32
1.9
32
96
0
115
29
9
22
38
1.86
86622937--86623015
5
14.2
6
77
19
66
48
16
2
32
1.60
86622933--86622978
20
2.2
21
92
7
85
47
19
0
32
1.50
86622933--86622979
11
4.5
11
87
12
73
46
19
0
34
1.50
86623012--86623039
14
2.0
14
100
0
56
71
0
14
14
1.15
86631286--86631379
18
5.4
18
92
3
131
36
25
9
28
1.87
86631286--86631366
9
9.0
9
70
0
54
34
27
9
28
1.89
86633745--86633833
21
4.1
21
84
5
90
53
10
23
12
1.68
86633745--86633813
21
3.3
21
87
2
95
55
8
24
11
1.64
86637980--86638008
14
2.1
14
100
0
58
51
6
13
27
1.66
86643695--86643727
16
2.1
16
94
0
57
39
9
12
39
1.74
86644193--86644226
15
2.3
15
89
0
50
35
2
23
38
1.70
86645227--86645266
19
2.1
19
90
0
62
30
15
2
52
1.55
86646953--86646981
14
2.1
14
100
0
58
34
0
13
51
1.42
86647106--86647145
21
1.9
21
89
0
62
30
12
0
57
1.36
86647729--86647753
11
2.3
11
100
0
50
64
8
0
28
1.22
86648417--86648456
14
2.7
15
88
7
55
17
5
0
77
0.94
86653111--86653156
23
2.0
23
100
0
92
34
13
13
39
1.83
86653698--86653725
14
2.0
14
100
0
56
35
7
21
35
1.81
86654884--86654941
29
2.0
29
100
0
116
37
17
13
31
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86670993--86671035
15
3.2
15
69
30
51
65
0
6
27
1.18
86670986--86671035
25
2.0
25
100
0
100
64
0
8
28
1.22
86676664--86676737
33
2.3
33
86
6
100
44
4
0
51
1.20
86676730--86676949
11
21.4
10
69
24
97
65
2
2
29
1.21
86676779--86676859
22
3.4
24
82
17
114
69
3
3
23
1.21
86676847--86676901
13
4.4
13
93
2
87
67
0
0
32
0.91
86676853--86676949
15
6.7
15
75
12
78
63
0
3
32
1.10
86676796--86676959
43
3.7
42
74
16
118
66
1
3
28
1.16
86676755--86676951
49
4.0
50
75
14
139
65
2
3
28
1.21
86676895--86676998
20
5.4
20
69
21
62
59
0
5
33
1.28
86676797--86676957
13
11.8
14
66
26
55
66
1
3
28
1.16
86676973--86677056
26
3.6
23
69
13
64
53
3
0
42
1.18
86676977--86677065
23
3.7
26
71
13
82
51
4
1
42
1.29
86682705--86682735
15
2.1
15
100
0
62
19
12
0
67
1.22
86683410--86683443
16
2.1
17
94
5
61
64
0
11
23
1.26
86684344--86684405
16
4.0
15
74
13
54
20
9
11
58
1.61
86684362--86684412
16
3.2
16
97
0
93
21
11
13
52
1.72
86685730--86685763
14
2.4
14
90
5
50
67
0
17
14
1.23
86687033--86687121
9
10.3
9
70
20
57
59
0
2
38
1.10
86687029--86687086
19
3.1
19
83
11
68
65
0
0
34
0.93
86687002--86687143
34
4.1
35
75
15
109
60
0
3
35
1.19
86687025--86687143
24
4.9
24
76
11
109
61
0
2
36
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86687079--86687114
15
2.3
16
95
4
65
55
0
5
38
1.23
86687025--86687164
23
6.2
22
74
17
85
60
0
2
36
1.11
86687552--86687578
13
2.1
13
100
0
54
48
0
7
44
1.31
86687739--86687788
19
2.5
21
84
9
70
36
2
0
62
1.07
86687865--86687903
17
2.3
17
86
8
53
23
2
5
69
1.21
86688039--86688070
15
2.0
17
88
11
50
31
3
9
56
1.47
86688692--86688734
18
2.4
18
88
0
59
69
6
13
9
1.35
86693459--86693489
15
2.1
15
100
0
62
12
19
19
48
1.81
86696905--86696988
20
4.4
19
73
23
70
33
5
1
59
1.29
86696910--86696959
16
2.8
17
85
11
57
36
8
0
56
1.29
86698693--86698729
18
2.1
18
89
0
56
54
0
24
21
1.45
86701583--86701616
17
2.0
17
94
0
59
38
2
11
47
1.55
86704158--86704259
29
3.5
29
90
0
150
23
33
15
27
1.95
86712018--86712119
29
3.5
29
90
0
150
23
33
15
27
1.95
86716940--86716978
16
2.4
17
91
4
62
48
35
5
10
1.59
86718453--86718558
29
3.7
28
84
2
131
27
14
29
29
1.95
86718461--86718571
58
1.9
57
87
5
161
27
15
28
27
1.96
86719444--86719470
3
9.0
3
100
0
54
33
0
0
66
0.92
86724653--86724690
17
2.2
17
90
0
58
63
7
7
21
1.47
86731353--86731383
14
2.3
13
94
5
53
61
12
6
19
1.53
86733273--86733383
57
1.9
57
85
1
150
26
14
32
27
1.95
86733260--86733374
29
4.0
29
81
6
128
26
14
31
26
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86746617--86747489
435
2.0
435
100
0
1746
35
16
14
33
1.89
86753244--86753330
43
2.0
43
80
8
97
29
31
18
20
1.96
86768276--86768713
27
16.2
27
77
5
258
39
20
11
29
1.87
86768670--86768726
27
2.1
27
83
0
69
31
19
14
35
1.91
86768757--86768848
27
3.4
27
83
3
105
32
19
25
22
1.97
86768989--86769069
27
3.0
27
75
14
76
22
22
18
37
1.95
86769590--86769639
18
2.8
17
77
16
57
44
18
12
26
1.84
86773124--86773356
40
5.8
39
81
7
164
23
26
23
27
2.00
86773124--86773358
80
2.9
79
79
5
238
23
25
23
27
2.00
86773168--86773355
40
4.7
40
83
3
191
24
26
22
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770