Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  612  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
191418103--191418205
29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
191424492--191424528
19
2.1
18
85
14
51
75
0
16
8
1.02
191425837--191425939
29
3.6
29
81
2
118
23
16
32
28
1.96
191431972--191432154
40
4.6
39
82
5
163
24
23
27
24
2.00
191431972--191432161
79
2.4
82
81
7
230
24
23
27
24
2.00
191431972--191432189
79
2.7
79
79
6
183
24
22
27
25
1.99
191436164--191436237
35
2.1
35
94
0
130
32
13
25
28
1.94
191438463--191438529
28
2.5
27
80
11
75
17
23
22
35
1.95
191444511--191444644
46
2.9
48
80
12
179
20
20
29
28
1.98
191447559--191447627
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
191447550--191447637
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
191450020--191450153
46
2.9
47
81
12
177
20
21
29
27
1.98
191459688--191459829
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
191459727--191459855
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
191462062--191462237
46
3.8
46
79
10
196
21
20
28
29
1.98
191462059--191462230
93
1.8
93
91
0
281
21
20
29
28
1.98
191468275--191468760
47
10.3
47
92
0
783
28
29
8
33
1.87
191468325--191468403
25
3.3
25
66
16
76
31
29
5
34
1.79
191468493--191468615
22
5.3
22
62
18
61
26
30
10
32
1.90
191468744--191468777
17
2.0
17
100
0
68
29
23
11
35
1.90
191468697--191468824
64
2.0
64
95
0
229
29
28
9
32
1.88
191475549--191475581
14
2.4
14
94
0
57
45
0
9
45
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
191475724--191475772
23
2.1
23
88
0
71
24
6
4
65
1.33
191475978--191476103
3
42.7
3
67
7
53
31
9
0
58
1.30
191488336--191488506
93
1.8
93
89
2
272
27
28
21
22
1.99
191488333--191488503
46
3.7
45
76
16
163
28
28
21
22
1.99
191488926--191488985
30
2.0
30
83
0
75
30
21
10
38
1.86
191493553--191493591
6
6.7
6
88
5
62
79
0
2
17
0.84
191494977--191495263
126
2.3
127
88
3
420
22
27
25
23
2.00
191497508--191497545
2
19.0
2
94
0
67
47
0
0
52
1.00
191497814--191497865
26
2.0
26
100
0
104
26
0
26
46
1.53
191502995--191503066
36
2.0
36
100
0
144
33
16
25
25
1.96
191512047--191512213
40
4.2
40
80
5
187
23
27
22
26
1.99
191512063--191512213
80
1.9
79
85
6
207
23
27
22
26
1.99
191515780--191515839
6
10.0
6
73
12
52
15
5
3
76
1.08
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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1.98
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Period
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Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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23
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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