Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  432  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133323924--133324052
27
4.8
27
80
6
136
41
19
7
31
1.79
133323925--133324105
54
3.3
53
79
3
173
42
18
8
30
1.79
133324062--133324113
27
1.9
27
88
7
79
40
11
11
36
1.78
133324130--133324231
26
3.8
27
77
10
100
34
18
21
25
1.96
133324165--133324231
27
2.5
26
90
2
98
32
16
25
25
1.96
133324165--133324243
27
3.0
28
83
12
96
31
17
24
26
1.97
133325389--133325435
24
2.0
24
86
0
67
31
25
17
25
1.97
133325478--133325515
20
1.9
20
94
0
67
34
10
21
34
1.87
133325569--133325664
23
4.1
22
85
10
129
30
17
21
30
1.97
133325569--133325664
47
2.1
47
88
5
142
30
17
21
30
1.97
133328708--133328834
27
4.8
26
80
7
121
41
19
8
29
1.81
133328815--133328896
27
3.0
27
80
10
69
43
14
8
32
1.76
133328845--133328896
27
1.9
27
88
7
79
40
11
11
36
1.78
133330555--133330738
40
4.6
39
76
5
138
26
24
27
21
1.99
133330595--133330783
80
2.4
80
78
4
193
23
24
29
22
1.99
133338666--133338815
40
3.8
39
74
17
130
26
24
27
21
1.99
133338709--133338815
39
2.7
38
84
12
128
23
26
29
20
1.99
133338709--133338892
79
2.3
79
79
2
181
22
25
30
22
1.99
133340296--133340373
27
2.9
27
84
7
104
34
20
21
23
1.97
133343139--133343212
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
133343196--133343271
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
133343139--133343271
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133350999--133351072
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
133351056--133351131
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
133350999--133351131
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
133353913--133354072
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
133359392--133359616
124
1.8
124
85
1
317
30
11
24
34
1.90
133359611--133359740
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
133366452--133366581
49
2.7
49
83
3
165
22
29
21
26
1.99
133367365--133367415
20
2.7
18
82
14
59
37
21
0
41
1.54
133371802--133371900
28
3.5
29
80
6
105
30
26
15
28
1.96
133379484--133379582
28
3.5
29
80
6
105
30
26
15
28
1.96
133383956--133383999
18
2.4
18
92
7
72
11
22
40
25
1.87
133384112--133384216
27
3.9
27
81
5
131
30
14
15
40
1.87
133384176--133384259
43
2.0
43
92
0
141
19
15
21
44
1.87
133384219--133384280
27
2.3
27
91
0
106
24
12
19
43
1.86
133384599--133384635
18
2.1
18
100
0
74
21
16
10
51
1.74
133384601--133384677
6
12.8
6
69
14
52
20
18
12
48
1.81
133384601--133384663
23
2.7
23
85
9
74
20
19
12
47
1.81
133387852--133387999
79
1.9
80
81
4
183
22
31
24
21
1.99
133387892--133387999
40
2.7
40
86
0
135
21
30
25
23
1.99
133389381--133389578
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
133389447--133389564
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
133389415--133389578
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133397003--133397120
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
133396971--133397134
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
133405321--133405348
14
2.0
14
100
0
56
14
14
0
71
1.15
133405345--133405423
5
14.2
6
80
17
66
32
2
16
48
1.60
133405346--133405427
11
7.5
11
69
23
50
32
2
17
47
1.60
133405382--133405427
20
2.2
21
92
7
85
32
0
19
47
1.50
133413600--133413661
32
1.9
32
96
0
115
38
22
9
29
1.86
133417779--133417822
22
2.0
22
100
0
88
54
4
22
18
1.61
133420053--133420096
21
2.1
21
83
8
54
63
2
9
25
1.35
133430001--133430028
13
2.2
13
100
0
56
50
14
7
28
1.69
133437322--133437383
32
1.9
32
96
0
115
29
9
22
38
1.86
133445559--133445637
5
14.2
6
77
19
66
48
16
2
32
1.60
133445555--133445600
20
2.2
21
92
7
85
47
19
0
32
1.50
133445555--133445601
11
4.5
11
87
12
73
46
19
0
34
1.50
133445634--133445661
14
2.0
14
100
0
56
71
0
14
14
1.15
133453910--133454003
18
5.4
18
92
3
131
36
25
9
28
1.87
133453910--133453990
9
9.0
9
70
0
54
34
27
9
28
1.89
133456369--133456457
21
4.1
21
84
5
90
53
10
23
12
1.68
133456369--133456437
21
3.3
21
87
2
95
55
8
24
11
1.64
133464020--133464121
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
133467448--133467499
16
3.4
15
75
20
54
57
5
1
34
1.33
133477813--133477854
21
2.2
19
84
16
52
64
4
9
21
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133481778--133481806
15
1.9
15
100
0
58
58
0
6
34
1.25
133488584--133488707
59
2.1
58
86
7
171
47
7
0
44
1.36
133489930--133489958
15
1.9
15
100
0
58
58
0
6
34
1.25
133493038--133493162
59
2.1
58
88
5
180
48
7
0
44
1.36
133498237--133498286
21
2.4
21
82
0
55
12
18
22
48
1.80
133498478--133498516
19
2.0
20
90
9
64
64
0
0
35
0.94
133498707--133498742
17
2.1
18
89
5
56
36
2
0
61
1.11
133501121--133501180
26
2.3
26
97
0
111
30
20
18
31
1.96
133501782--133502002
116
1.9
113
89
2
343
28
11
12
47
1.77
133501910--133502011
52
2.0
52
88
0
150
29
10
14
45
1.79
133502005--133502056
27
1.9
27
96
0
95
19
11
11
57
1.63
133504950--133505078
49
3.0
42
83
10
145
51
7
20
19
1.71
133504995--133505092
49
2.0
50
93
2
171
53
8
20
18
1.70
133505281--133505317
15
2.4
16
95
4
67
21
29
21
27
1.99
133511902--133511948
23
2.0
23
100
0
94
25
17
31
25
1.97
133511952--133512010
18
3.3
18
66
4
57
33
15
27
23
1.95
133511925--133512085
35
4.7
36
80
8
178
32
14
29
23
1.95
133511944--133512074
70
1.9
70
88
3
201
34
14
29
22
1.93
133511943--133512146
103
2.0
104
81
7
245
35
11
27
25
1.91
133514171--133514242
9
8.0
9
73
0
54
33
26
9
30
1.89
133514170--133514223
18
3.0
18
88
0
81
35
27
9
27
1.87
133514184--133514242
27
2.2
27
87
0
82
33
25
8
32
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133515105--133515184
39
2.1
39
85
0
106
20
38
17
23
1.93
133517561--133517591
16
1.9
16
93
0
53
0
29
6
64
1.18
133521020--133521170
40
3.8
39
84
2
151
23
27
22
26
2.00
133521020--133521170
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
26
2.00
133528958--133529086
40
3.3
39
80
4
152
24
27
23
24
2.00
133528974--133529122
40
3.8
40
79
6
153
22
26
22
27
1.99
133531057--133531164
27
4.0
27
90
0
153
25
20
19
35
1.96
133531058--133531173
54
2.1
54
87
0
169
26
18
17
37
1.93
133531086--133531171
27
3.2
27
94
0
154
27
17
16
38
1.91
133531156--133531550
27
14.6
27
78
9
252
30
9
20
39
1.84
133531156--133531550
54
7.3
52
76
9
278
30
9
20
39
1.84
133531211--133531550
81
4.2
82
77
5
327
31
9
20
39
1.84
133531302--133531550
134
1.9
133
82
2
293
31
9
19
39
1.84
133534204--133534322
29
4.1
29
86
1
159
25
12
30
31
1.93
133544974--133545097
39
3.2
39
88
0
185
32
19
25
22
1.97
133544973--133545127
78
2.0
76
82
5
186
30
20
27
21
1.98
133552958--133553047
39
2.3
38
81
9
110
33
20
25
21
1.97
133557764--133557881
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
133557732--133557895
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
133564159--133564276
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
133564127--133564290
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
133571504--133571528
7
3.6
7
100
0
50
12
0
28
60
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133572388--133572455
27
2.5
28
90
2
111
26
11
27
33
1.91
133580089--133580206
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
133580057--133580220
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
133587588--133587785
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
133587654--133587771
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
133587622--133587785
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
133594021--133594238
40
5.5
40
87
3
298
22
22
28
25
1.99
133594017--133594212
80
2.5
80
93
0
338
22
22
29
25
1.99
133599357--133599517
29
5.6
29
86
7
186
26
26
15
31
1.96
133607334--133607494
29
5.6
29
86
7
186
26
26
15
31
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770