Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  542  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168564489--168564669
46
3.9
46
81
9
233
27
29
21
20
1.98
168567046--168567134
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
168567046--168567125
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
168567057--168567134
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
168569043--168569091
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
168569914--168570080
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
168575196--168575294
27
3.7
25
74
11
90
29
25
15
30
1.95
168575171--168575256
27
3.2
27
78
18
67
29
26
18
25
1.98
168575243--168575375
27
4.9
27
67
15
96
33
19
12
35
1.89
168576892--168577100
104
2.0
104
94
0
364
39
14
13
33
1.85
168581922--168582059
56
2.4
58
78
4
147
23
26
10
39
1.88
168582029--168582159
51
2.6
51
86
2
174
26
26
11
35
1.91
168585560--168585692
69
1.9
70
92
1
223
32
13
17
36
1.89
168587015--168587309
47
6.3
47
91
0
455
35
8
28
27
1.86
168589427--168589607
40
4.6
40
90
2
269
21
27
24
26
1.99
168596134--168596194
18
3.6
18
66
29
53
22
6
9
60
1.51
168596138--168596205
33
2.1
33
97
0
127
20
5
10
63
1.47
168601758--168601814
26
2.4
23
76
18
62
64
0
1
33
1.04
168601766--168601815
26
1.9
26
87
0
73
62
0
2
36
1.07
168602105--168602333
3
74.0
3
66
24
70
60
0
3
34
1.18
168602113--168602231
20
5.8
20
71
25
88
61
0
4
33
1.21
168602158--168602332
7
25.9
7
68
20
97
60
0
2
36
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168602113--168602330
66
3.3
61
76
16
172
61
0
3
34
1.18
168602134--168602196
23
2.6
24
80
10
74
65
1
1
31
1.12
168602179--168602327
32
4.5
33
74
17
105
59
0
3
36
1.14
168602157--168602307
53
2.9
53
75
15
154
60
0
3
35
1.13
168602209--168602276
20
3.4
19
76
13
57
60
0
4
35
1.17
168602134--168602329
14
16.1
12
66
24
67
61
0
3
35
1.16
168602262--168602328
26
2.5
27
87
4
91
62
0
0
37
0.95
168602170--168602345
95
1.9
91
82
13
216
60
0
3
35
1.15
168605261--168605285
9
2.8
9
100
0
50
32
36
0
32
1.58
168606892--168606961
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
168620663--168620846
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
168620703--168620891
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
168626909--168626965
2
30.0
2
79
10
66
42
0
5
52
1.24
168630225--168630280
16
3.6
16
77
13
64
64
12
12
10
1.51
168631723--168631792
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
168639662--168639731
27
2.5
28
86
2
97
30
28
14
27
1.95
168641849--168641889
2
20.5
2
100
0
82
48
0
0
51
1.00
168648137--168648219
43
2.0
42
82
2
103
30
24
14
31
1.94
168649753--168649853
28
3.5
29
87
6
134
30
27
12
28
1.93
168659877--168659946
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
168667787--168667856
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
168670612--168670701
40
2.2
40
80
3
110
24
27
24
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168675131--168675169
18
2.2
18
90
0
60
61
2
5
30
1.31
168679988--168680255
46
5.8
43
72
12
133
28
19
29
22
1.98
168686504--168686756
68
3.8
65
75
11
214
30
16
28
24
1.97
168689401--168689572
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
168689393--168689568
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
168695365--168695552
49
3.8
48
79
5
205
29
25
18
26
1.98
168695375--168695557
100
1.8
100
92
2
314
30
25
19
25
1.98
168696765--168696918
46
3.3
46
75
9
143
27
18
31
22
1.97
168699995--168700142
39
3.8
39
84
7
203
24
29
20
25
1.99
168699995--168700142
76
1.9
79
87
6
223
24
29
20
25
1.99
168701840--168701913
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
168709648--168709779
29
4.6
29
82
1
140
25
32
17
25
1.97
168715398--168715565
40
4.2
40
79
6
162
23
26
22
27
2.00
168715414--168715563
80
1.9
80
83
8
198
22
26
23
27
2.00
168717366--168717581
40
5.5
40
88
5
291
23
27
24
24
2.00
168718285--168718312
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
168725103--168725147
21
2.1
21
100
0
90
42
13
4
40
1.64
168727821--168727866
22
2.0
23
83
4
58
56
6
8
28
1.54
168728775--168728800
13
2.0
13
100
0
52
46
0
23
30
1.53
168731865--168732112
40
6.2
40
91
1
374
26
29
21
22
1.99
168740103--168740346
40
6.2
40
86
5
329
26
29
20
22
1.99
168740103--168740345
76
3.1
78
86
5
312
26
29
20
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168740130--168740346
116
1.9
117
90
2
348
24
29
21
23
1.99
168748083--168748121
19
2.1
19
90
4
62
48
2
2
46
1.29
168748677--168748725
24
2.0
24
100
0
98
42
4
0
53
1.20
168748684--168748724
12
3.4
12
79
0
55
39
4
0
56
1.21
168749290--168750168
206
4.3
206
88
4
1275
29
20
17
31
1.96
168750130--168750433
44
6.9
44
72
9
244
27
24
17
31
1.97
168750130--168750433
132
2.3
132
91
2
502
27
24
17
31
1.97
168751292--168751316
10
2.5
10
100
0
50
0
8
0
92
0.40
168756919--168756965
22
2.2
21
84
3
58
36
21
8
34
1.84
168756936--168756997
19
3.2
19
93
4
97
35
19
9
35
1.85
168759349--168759385
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
168763282--168763367
33
2.6
33
78
9
84
26
23
19
30
1.98
168764285--168764311
12
2.2
12
100
0
54
59
7
11
22
1.56
168769766--168769814
9
5.8
9
79
11
59
79
4
0
16
0.88
168769765--168769814
16
3.0
16
81
16
57
78
4
0
18
0.91
168778179--168778340
33
4.9
33
82
3
182
29
20
20
29
1.98
168779840--168780006
40
4.2
40
79
2
158
23
27
22
26
2.00
168782184--168782297
40
2.8
39
84
2
138
25
28
22
22
1.99
168790038--168790085
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
168790129--168790187
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
168790238--168790332
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
168790239--168790332
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168790523--168790661
68
2.0
69
97
1
262
39
15
21
23
1.91
168790549--168790661
38
3.5
31
81
16
138
40
14
21
23
1.90
168790577--168790684
38
2.8
38
92
1
180
39
15
22
22
1.91
168798389--168798436
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
168798480--168798538
20
3.0
20
87
0
91
35
11
22
30
1.90
168798589--168798683
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
168798875--168799037
38
4.4
38
84
11
232
38
17
22
22
1.93
168798899--168799014
31
3.5
31
80
15
142
41
14
20
23
1.89
168798875--168799014
69
2.0
69
98
0
271
39
15
21
23
1.92
168800794--168800881
45
2.0
45
95
0
158
26
25
23
25
2.00
168805946--168806131
43
4.3
43
82
4
223
30
29
15
24
1.96
168807879--168807936
22
2.6
22
86
8
73
41
20
6
31
1.79
168810109--168810139
6
5.2
6
92
0
53
48
0
51
0
1.00
168810287--168810368
40
2.0
41
83
6
105
24
15
12
47
1.80
168810376--168810426
23
2.4
23
84
12
65
23
1
0
74
0.92
168810373--168810406
6
5.3
6
89
10
50
23
0
0
76
0.79
168810373--168810406
13
2.7
12
86
13
50
23
0
0
76
0.79
168810393--168810437
19
2.2
21
92
7
76
22
4
2
71
1.15
168811056--168811107
16
3.1
18
83
10
65
21
0
30
48
1.51
168811079--168811112
15
2.2
16
89
5
52
20
0
35
44
1.52
168811480--168811679
41
4.9
41
82
4
226
20
22
22
35
1.96
168812158--168812279
43
2.8
43
77
11
133
24
29
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168818886--168818984
43
2.3
43
87
0
135
29
25
18
27
1.98
168822253--168822510
49
5.3
49
94
0
439
31
8
31
29
1.86
168824780--168824980
40
5.1
40
93
0
332
24
21
28
24
1.99
168825144--168825194
25
2.0
25
85
7
68
29
7
33
29
1.85
168828683--168828937
49
5.3
49
95
2
455
30
7
30
30
1.86
168837512--168837592
26
3.2
26
92
1
137
30
6
24
38
1.80
168839069--168839121
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
168841034--168841079
19
2.4
19
88
0
65
8
47
26
17
1.76
168843394--168843423
11
2.7
11
89
0
51
70
3
0
26
1.03
168849730--168849929
46
4.3
44
77
11
170
25
31
18
25
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770