Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  541  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168252794--168252838
21
2.1
21
95
0
81
24
6
4
64
1.37
168252805--168252851
24
2.1
23
88
11
71
27
2
2
68
1.13
168254779--168254851
35
2.1
35
100
0
146
39
19
5
35
1.75
168258798--168258966
58
2.9
57
93
4
286
28
28
19
23
1.98
168258805--168258963
29
5.5
28
70
14
110
28
27
20
23
1.99
168259120--168259467
43
8.2
43
94
1
567
31
33
23
11
1.90
168259132--168259465
127
2.6
129
92
2
559
31
33
23
11
1.90
168260862--168260934
35
2.1
35
100
0
146
39
19
5
35
1.75
168264880--168265048
58
2.9
57
93
4
286
28
28
19
23
1.98
168264887--168265045
29
5.5
28
70
14
110
28
27
20
23
1.99
168265202--168265550
43
8.2
43
94
1
576
31
33
23
11
1.90
168265202--168265550
85
4.1
86
93
1
576
31
33
23
11
1.90
168265214--168265550
128
2.6
128
93
0
568
31
33
23
10
1.90
168266946--168267018
35
2.1
35
100
0
146
39
19
5
35
1.75
168269750--168269816
23
3.0
23
79
12
68
5
17
8
67
1.38
168274420--168274585
86
1.9
87
82
7
212
20
21
21
36
1.95
168286647--168286672
6
4.3
6
100
0
52
69
15
15
0
1.20
168293567--168293642
39
1.9
39
97
0
143
17
2
31
48
1.60
168299192--168299242
22
2.3
22
87
12
70
33
3
21
41
1.72
168305196--168305412
46
4.7
46
74
12
169
28
20
29
21
1.98
168306851--168306999
72
2.0
74
93
5
259
28
12
14
43
1.83
168309776--168309801
12
2.2
12
100
0
52
7
15
30
46
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168309825--168309919
41
2.3
40
87
7
129
45
18
20
15
1.86
168309856--168310144
41
7.4
40
82
13
336
35
23
22
18
1.96
168309937--168310144
40
5.2
41
90
6
354
34
23
22
20
1.97
168309937--168310144
81
2.6
80
91
6
350
34
23
22
20
1.97
168310545--168310604
25
2.4
25
94
0
102
31
6
20
41
1.78
168311177--168311208
15
2.1
15
94
0
55
59
0
9
31
1.29
168319651--168319768
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
168319619--168319782
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
168328608--168328760
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
168336619--168336771
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
168338468--168338622
27
5.7
28
80
8
142
27
7
22
42
1.79
168338468--168338638
54
3.2
53
78
5
164
28
7
22
40
1.81
168338497--168338646
81
1.9
80
80
4
176
28
8
23
40
1.84
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1.98

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