Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  556  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
173043684--173043744
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
173043794--173043934
24
6.0
24
90
7
200
29
21
22
26
1.99
173043794--173043934
46
3.0
47
88
8
198
29
21
22
26
1.99
173044126--173044214
31
3.1
30
87
12
125
38
16
22
22
1.93
173045325--173045424
27
3.7
28
82
6
107
42
20
8
30
1.80
173045325--173045431
54
2.0
54
81
3
126
40
20
8
30
1.82
173045420--173045676
81
3.2
81
87
2
329
28
22
8
40
1.82
173045420--173045676
27
9.6
27
85
3
295
28
22
8
40
1.82
173045420--173045694
107
2.6
108
82
2
286
29
22
8
39
1.83
173045635--173045752
27
4.3
27
75
14
107
36
18
9
35
1.83
173045809--173045901
27
3.4
27
88
2
125
35
20
24
19
1.96
173047058--173047105
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
173047148--173047208
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
173047258--173047376
47
2.5
48
86
5
152
28
20
23
27
1.99
173047258--173047376
24
5.0
24
86
5
152
28
20
23
27
1.99
173047568--173047631
31
2.1
31
90
0
101
35
15
25
23
1.94
173060152--173060389
49
4.8
49
79
5
271
30
25
17
26
1.97
173062872--173062938
25
2.7
25
83
0
89
47
10
19
22
1.79
173063056--173063120
27
2.5
26
82
5
76
38
20
23
18
1.93
173063075--173063128
26
2.0
27
89
3
83
37
20
25
16
1.93
173063080--173063135
26
2.1
27
86
3
78
39
25
21
14
1.91
173063934--173064012
6
12.8
6
70
15
54
46
12
21
18
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
173063946--173064012
25
2.7
25
88
0
98
44
13
22
19
1.85
173064130--173064208
27
2.9
27
87
5
106
36
22
24
16
1.94
173064372--173064433
22
2.8
22
78
9
72
32
24
25
17
1.97
173064865--173065183
27
11.9
27
88
1
453
23
21
18
35
1.95
173065223--173065406
27
6.9
26
75
11
124
29
9
22
38
1.85
173065222--173065406
54
3.4
54
78
5
162
29
9
22
38
1.85
173065347--173065406
26
2.3
25
83
13
68
26
8
23
41
1.82
173068647--173068813
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
173088130--173088297
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
173097044--173097103
27
2.4
24
78
10
68
45
6
0
48
1.29
173097270--173097303
17
1.9
18
94
5
61
52
5
5
35
1.50
173107269--173107426
24
6.6
24
93
0
255
35
25
18
20
1.95
173107269--173107426
48
3.3
48
96
0
282
35
25
18
20
1.95
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2
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58
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Indices
Period
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Copy
Number
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27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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