Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  504  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
155890986--155891040
9
5.7
9
76
16
56
34
7
20
38
1.80
155890980--155891046
20
3.3
20
87
0
98
34
8
20
35
1.84
155891096--155891262
24
7.0
23
85
6
210
29
22
20
27
1.99
155891096--155891262
47
3.5
47
86
4
212
29
22
20
27
1.99
155891096--155891261
71
2.3
71
89
3
244
28
22
21
27
1.99
155896983--155897112
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
155905001--155905130
40
3.2
40
82
4
165
23
24
28
23
2.00
155908909--155909057
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
155908950--155909057
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
155917025--155917173
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
155917066--155917173
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
155925291--155925389
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
155926705--155926814
48
2.3
48
88
0
157
32
24
18
24
1.97
155928024--155928071
20
2.4
20
100
0
96
20
39
27
12
1.89
155933280--155933309
12
2.5
12
94
0
51
16
23
30
30
1.96
155934158--155934461
41
7.5
41
81
1
317
35
12
29
22
1.91
155934158--155934455
81
3.7
81
89
0
400
35
12
28
23
1.91
155934441--155934481
20
2.0
20
85
0
55
41
12
31
14
1.83
155937572--155937711
57
2.5
57
82
7
171
37
22
16
23
1.94
155937572--155937744
29
6.1
28
73
8
136
37
21
15
24
1.93
155940248--155940407
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
155948326--155948485
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
155968125--155968225
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
155968341--155968391
25
2.0
25
100
0
102
19
13
35
31
1.91
155971397--155971505
27
4.0
26
83
10
121
38
22
22
17
1.93
155971397--155971505
54
2.0
54
83
3
139
38
22
22
17
1.93
155986482--155986513
15
2.1
15
94
0
55
12
12
3
71
1.25
155987516--155987627
27
4.1
27
79
12
86
38
22
24
15
1.92
155987516--155987627
54
2.1
54
85
6
147
38
22
24
15
1.92
155991212--155991312
28
3.5
29
87
6
134
30
27
12
28
1.93
155999125--155999225
28
3.5
29
87
6
134
30
27
12
28
1.93
156001287--156001450
40
4.2
40
76
8
151
26
21
27
24
2.00
156009760--156009890
40
3.2
40
75
6
138
25
25
27
22
2.00
156012442--156012515
29
2.6
29
86
4
96
27
16
31
25
1.96
156014380--156014426
22
2.1
22
92
0
76
10
23
25
40
1.87
156015418--156015464
23
2.0
23
100
0
94
25
8
25
40
1.84
156017141--156017221
27
3.0
27
85
0
108
29
20
23
25
1.99
156017206--156017599
81
4.9
81
77
5
323
41
19
9
30
1.82
156017206--156017627
27
15.7
27
78
2
292
40
19
9
30
1.83
156017844--156017881
18
2.1
18
95
0
67
44
2
34
18
1.64
156017883--156018005
41
3.0
41
91
0
201
20
18
30
30
1.96
156018146--156018211
22
3.0
22
78
8
62
22
24
22
30
1.99
156018422--156018466
22
2.0
22
83
8
56
11
28
22
37
1.88
156026398--156026428
11
2.8
11
100
0
62
29
25
9
35
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156026542--156026570
14
2.0
15
93
6
51
62
20
0
17
1.33
156030088--156030261
46
3.8
44
79
9
188
28
29
21
20
1.98
156030095--156030266
92
1.9
93
93
1
301
27
30
21
20
1.98
156030139--156030280
45
3.1
44
70
26
116
29
28
20
21
1.98
156032635--156032723
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
156032635--156032714
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
156032646--156032723
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
156035618--156035792
46
3.8
45
79
10
192
28
29
20
21
1.98
156035625--156035797
93
1.9
93
92
2
294
27
30
20
21
1.98
156039319--156039459
29
4.9
29
97
0
255
26
31
14
27
1.95
156043451--156043606
29
5.6
29
88
7
223
25
32
14
27
1.95
156043393--156043606
58
3.8
55
78
9
211
25
33
15
25
1.95
156043395--156043604
111
1.9
110
80
5
244
25
33
15
25
1.95
156051510--156051627
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
156051478--156051641
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
156059073--156059190
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
156059041--156059204
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
156061797--156061856
30
2.0
30
83
6
77
38
6
26
28
1.81
156062503--156062646
50
2.9
50
87
1
191
25
18
27
28
1.98
156065388--156065419
15
2.1
15
94
5
55
12
12
15
59
1.61
156068155--156068300
50
2.9
50
87
1
204
26
17
28
28
1.98
156069485--156069514
9
3.3
9
100
0
60
26
0
20
53
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156070964--156071123
43
3.8
43
74
10
141
31
30
15
23
1.95
156080002--156080078
25
3.1
25
81
1
84
31
25
12
29
1.93
156081853--156081929
34
2.3
34
90
0
118
28
22
22
27
1.99
156090289--156090514
40
5.6
42
82
11
167
23
25
23
27
2.00
156090322--156090514
40
4.8
41
85
5
225
24
26
22
25
2.00
156101357--156101577
40
5.6
40
86
5
279
24
23
26
25
2.00
156101361--156101577
82
2.7
79
86
8
264
23
23
27
24
2.00
156109441--156109661
40
5.6
40
82
6
254
23
23
27
25
2.00
156121908--156122114
40
5.2
40
80
3
211
26
22
26
24
2.00
156121912--156122118
79
2.6
79
78
6
213
26
22
26
24
2.00
156129916--156130123
40
5.2
40
80
2
211
25
22
26
24
2.00
156137325--156137435
47
2.4
47
84
3
134
28
26
7
37
1.83
156137439--156137666
46
5.0
46
96
0
411
31
27
6
34
1.83
156140355--156140465
40
2.8
40
79
8
118
22
27
24
26
2.00
156141129--156141390
40
6.7
40
92
3
408
25
29
21
24
1.99
156141111--156141390
118
2.4
118
88
3
413
25
28
21
23
1.99
156141129--156141386
78
3.3
78
91
4
403
25
28
22
24
1.99
156143943--156144053
47
2.4
47
89
3
161
27
27
9
36
1.87
156144053--156144192
46
3.0
46
96
0
253
30
27
7
35
1.84
156151652--156151725
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
156151709--156151784
29
2.6
29
77
4
82
22
21
35
21
1.96
156156446--156156520
29
2.6
29
78
4
80
21
36
21
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156156504--156156577
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
156159879--156159929
27
2.0
26
88
7
77
15
25
21
37
1.93
156159971--156160031
23
2.5
24
76
5
61
19
19
16
44
1.87
156173521--156173742
40
5.6
40
90
5
346
26
28
21
23
1.99
156173498--156173741
79
3.1
79
90
5
354
26
27
20
25
1.99
156179741--156179805
33
2.0
33
84
0
85
56
7
20
15
1.63
156188147--156188187
21
2.0
21
85
9
57
43
2
0
53
1.13
156189302--156189364
30
2.1
30
96
0
117
23
3
15
57
1.53
156190859--156190896
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
156191124--156191294
93
1.8
93
89
0
270
29
28
20
22
1.98
156191119--156191291
46
3.7
46
78
10
190
30
27
20
22
1.98
156196943--156197043
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
156196943--156197093
40
3.8
40
84
4
180
28
22
25
23
1.99
156196939--156197110
40
4.4
38
77
10
161
29
21
26
23
1.99
156204972--156205142
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
156208428--156208452
12
2.1
12
100
0
50
24
12
32
32
1.91
156209505--156209776
48
5.8
48
75
9
272
27
23
21
27
1.99
156214536--156214591
28
2.0
28
100
0
112
25
25
0
50
1.50
156214951--156215219
49
5.7
48
77
8
248
24
28
20
27
1.99
156214951--156215181
98
2.4
92
84
6
293
24
29
19
26
1.99
156214951--156215219
98
2.9
95
81
7
291
24
28
20
27
1.99
156219799--156220005
79
2.6
80
78
6
188
24
29
23
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
156219898--156220005
40
2.7
40
86
0
135
21
30
25
23
1.99
156223521--156223579
30
2.0
30
86
0
82
35
23
5
35
1.77
156226075--156226134
30
2.0
30
100
0
120
50
10
23
16
1.75
156227921--156228111
42
4.5
42
86
3
267
27
15
26
30
1.96
156229333--156229478
78
1.9
78
97
0
274
23
14
26
35
1.93
156229978--156230047
31
2.3
32
90
9
119
74
17
5
2
1.14
156229982--156230047
30
2.2
30
94
5
116
77
13
6
3
1.08
156230259--156230297
17
2.3
18
86
8
55
17
7
0
74
1.05
156230352--156230400
13
3.7
13
81
10
55
73
4
0
22
1.00
156230529--156230585
29
2.0
29
83
13
73
22
8
7
61
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770