Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  46  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13233762--13233937
46
3.8
46
78
15
191
29
28
20
21
1.98
13233813--13233956
46
3.1
46
74
14
143
29
27
19
22
1.98
13237278--13237924
311
2.1
311
86
3
901
31
8
18
41
1.81
13241529--13241604
34
2.2
36
81
9
95
50
7
2
39
1.46
13243234--13243453
99
2.2
99
82
3
255
35
18
18
28
1.94
13243307--13243528
99
2.2
99
80
4
252
34
16
20
28
1.94
13245742--13245800
30
2.0
30
82
0
73
37
30
15
16
1.90
13246324--13247201
313
2.8
311
87
2
1196
31
8
18
41
1.80
13246988--13247026
18
2.1
18
86
13
53
33
10
10
46
1.72
13248548--13248575
14
2.0
14
100
0
56
50
14
7
28
1.69
13248578--13248674
36
2.7
37
89
9
132
35
15
9
40
1.79
13248585--13248674
19
4.9
19
89
8
143
35
14
10
40
1.79
13248793--13248832
21
2.0
20
85
5
53
10
2
15
72
1.21
13249039--13249206
45
3.8
45
88
3
241
27
29
12
29
1.93
13249039--13249206
89
1.9
89
88
2
257
27
29
12
29
1.93
13249176--13249361
78
2.4
78
90
0
300
26
23
17
31
1.97
13249524--13249738
78
2.8
78
89
2
324
23
23
20
32
1.98
13249176--13249958
376
2.1
376
91
0
1271
26
22
18
32
1.97
13249946--13250044
44
2.2
44
87
3
137
30
25
17
27
1.97
13258410--13258515
19
5.8
19
86
8
159
35
14
11
38
1.82
13258410--13258515
54
1.9
55
94
1
187
35
14
11
38
1.82
13258624--13258672
19
2.7
18
79
17
64
12
2
12
73
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13274872--13275226
92
3.8
92
89
2
487
33
19
20
26
1.97
13275159--13275305
44
3.4
43
74
11
140
29
19
24
27
1.98
13277284--13277346
29
2.2
29
85
5
83
31
3
6
58
1.39
13277530--13277560
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
13278417--13278747
129
2.6
128
84
3
423
25
16
20
38
1.92
13281075--13281126
27
1.9
27
92
0
86
46
15
7
30
1.74
13283755--13283817
28
2.3
29
83
8
78
34
3
3
58
1.30
13284870--13285200
129
2.6
128
85
3
432
25
16
20
38
1.93
13286192--13286301
26
4.2
26
89
0
175
33
6
23
36
1.80
13288081--13288365
135
2.1
137
96
1
520
24
18
25
31
1.97
13292062--13292169
26
4.2
26
90
2
175
34
4
24
37
1.76
13292062--13292169
51
2.1
51
91
3
173
34
4
24
37
1.76
13293928--13294213
136
2.1
137
96
0
520
24
18
25
32
1.97
13296994--13297026
16
1.9
18
88
11
52
60
0
33
6
1.21
13296989--13297027
9
3.9
10
86
10
53
61
0
33
5
1.18
13302005--13302035
9
3.4
9
100
0
62
35
19
12
32
1.90
13302999--13303290
99
2.9
99
75
10
276
37
16
19
27
1.92
13306213--13306388
88
2.0
88
92
0
289
39
9
23
27
1.86
13311763--13311846
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
13319431--13319594
38
4.3
38
87
3
238
21
23
26
29
1.99
13319587--13319711
43
2.9
43
85
0
169
15
24
30
30
1.95
13324276--13324631
3
120.3
3
70
7
181
30
8
1
58
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13324766--13324799
15
2.3
15
89
0
50
35
14
0
50
1.44
13326578--13326616
2
19.5
2
94
0
69
48
0
2
48
1.15
13327182--13327245
31
2.1
31
88
2
94
6
4
18
70
1.27
13328103--13328788
217
3.2
217
92
4
1143
30
21
17
30
1.96
13328103--13328788
143
4.7
145
90
4
1091
30
21
17
30
1.96
13328098--13328802
72
9.7
73
90
4
1092
31
21
17
30
1.96
13337029--13337065
19
1.9
19
89
10
58
40
5
27
27
1.78
13338713--13338738
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
13338947--13339072
39
3.3
38
73
12
116
52
3
6
37
1.46
13339016--13339075
24
2.5
24
74
15
61
58
5
5
31
1.41
13342084--13342193
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
13342596--13342620
8
3.1
8
100
0
50
12
12
52
24
1.72
13342630--13342703
31
2.4
30
78
8
96
4
4
21
70
1.21
13342643--13342715
28
2.6
27
91
8
110
5
4
20
69
1.25
13343168--13343265
26
3.8
26
94
0
169
32
8
22
36
1.84
13344750--13344801
25
2.0
26
85
3
70
38
23
13
25
1.91
13350201--13350308
26
4.2
26
93
0
189
32
7
24
36
1.83
13353605--13353629
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
13354232--13354262
16
1.9
16
93
0
53
48
0
0
51
1.00
13357119--13357179
17
3.4
17
66
16
50
52
16
3
27
1.59
13357117--13357192
38
2.1
38
90
5
120
52
15
2
28
1.56
13357298--13357356
29
2.0
29
90
3
91
50
6
6
35
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13357311--13357369
29
2.0
29
83
6
73
49
11
6
32
1.66
13357488--13357795
3
102.7
3
74
6
203
31
8
0
58
1.35
13357964--13357997
15
2.3
15
89
0
50
35
14
0
50
1.44
13365571--13365615
20
2.3
20
81
14
58
26
15
28
28
1.96
13373523--13373809
137
2.1
137
96
0
520
31
24
18
24
1.98
13374057--13374109
26
2.0
27
82
13
67
28
13
18
39
1.88
13375595--13375730
26
5.2
26
97
0
236
36
24
5
33
1.78
13379800--13379927
64
2.0
64
93
0
220
31
17
14
35
1.91
13379995--13380796
88
9.0
88
83
3
890
33
21
23
21
1.97
13380453--13380597
44
3.3
45
69
11
120
33
18
24
22
1.97
13379995--13380789
264
3.0
263
85
2
1007
33
21
23
22
1.97
13380797--13380831
15
2.3
15
90
0
52
25
8
0
65
1.21
13381013--13381046
15
2.3
15
89
0
50
35
14
0
50
1.44
13382467--13382493
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
13383227--13383278
28
1.9
26
84
7
68
61
7
1
28
1.34
13385952--13386012
17
3.4
17
66
16
50
52
16
3
27
1.59
13385950--13386025
38
2.1
38
92
5
129
51
17
2
28
1.59
13386079--13386119
21
2.0
21
90
0
64
21
7
14
56
1.63
13387077--13387551
195
2.4
195
78
4
449
45
10
11
32
1.76
13395873--13395898
13
2.0
13
100
0
52
53
15
0
30
1.42
13396784--13396809
13
2.0
13
100
0
52
15
23
38
23
1.92
13405734--13405849
60
1.9
60
83
0
151
23
31
23
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13408738--13408767
14
2.1
14
100
0
60
33
13
0
53
1.40
13415364--13415389
13
2.0
13
100
0
52
53
15
0
30
1.42
13416222--13416350
61
2.1
61
83
8
156
21
20
31
27
1.98
13418645--13418712
34
2.0
34
85
5
93
29
23
26
20
1.99
13422165--13422241
40
1.9
40
84
5
102
16
15
29
37
1.90
13432045--13432078
17
2.1
16
88
5
50
29
5
0
64
1.17
13432918--13432942
12
2.1
12
100
0
50
28
16
16
40
1.89
13433373--13433724
194
1.8
194
84
6
489
44
11
11
32
1.77
13433368--13433825
195
2.4
195
80
8
490
44
11
11
32
1.77
13436162--13436219
27
2.2
27
90
3
91
68
6
0
24
1.13
13438591--13438875
136
2.1
136
93
1
482
32
23
18
25
1.97
13440659--13440716
26
2.2
26
93
0
98
36
24
5
34
1.78
13442303--13442337
16
2.2
16
90
5
54
88
2
8
0
0.61
13442328--13442362
17
2.0
18
88
5
54
60
31
2
5
1.35
13444485--13444537
26
2.0
26
92
0
88
35
9
15
39
1.79
13444585--13444637
27
2.0
27
92
7
90
56
11
5
26
1.56
13444594--13444636
14
3.1
14
73
6
52
55
11
4
27
1.55
13445525--13445855
98
3.4
98
74
7
287
44
12
12
30
1.78
13445619--13445865
97
2.5
97
74
7
239
44
13
11
29
1.79
13445541--13445896
195
1.8
195
82
6
461
44
12
11
30
1.78
13446615--13446660
2
22.5
2
95
4
83
47
2
0
50
1.13
13446813--13446846
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13454119--13454172
27
2.0
28
92
3
92
57
11
5
25
1.55
13454129--13454171
14
3.1
14
73
6
52
55
11
4
27
1.55
13455108--13455287
97
1.8
97
81
1
225
44
10
12
32
1.77
13455152--13455631
97
4.8
98
69
9
337
44
12
11
31
1.78
13455073--13455631
195
2.8
201
83
4
697
44
11
11
32
1.77
13455073--13455765
195
3.5
193
79
8
666
43
11
11
33
1.77
13456246--13456329
26
3.2
26
93
0
141
34
4
23
36
1.76
13459421--13459460
6
6.7
6
91
0
62
50
15
2
32
1.57
13462580--13462613
15
2.4
14
90
5
50
58
2
0
38
1.13
13462821--13462908
17
5.1
17
74
17
60
59
2
3
35
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770