Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  735  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
232542750--232542917
80
2.1
80
87
4
241
26
28
22
23
1.99
232550754--232550921
40
4.2
40
85
5
207
26
28
22
23
1.99
232550754--232550921
80
2.1
80
87
4
241
26
28
22
23
1.99
232552770--232552908
40
3.5
40
84
4
140
23
28
23
24
1.99
232552770--232552961
79
2.4
81
81
6
214
24
28
22
24
2.00
232563855--232564004
41
3.7
41
85
1
221
20
23
28
28
1.99
232571116--232571265
41
3.7
41
85
1
221
20
23
28
28
1.99
232579830--232580013
40
4.6
40
85
6
207
26
20
27
25
1.99
232583486--232583672
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
232583509--232583672
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
232583509--232583706
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
232591054--232591240
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
232591077--232591240
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
232591077--232591274
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
232593076--232593110
16
2.2
16
90
5
54
45
0
8
45
1.34
232594403--232594471
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
232600400--232600511
40
2.8
40
85
9
140
21
28
25
24
1.99
232600388--232600552
40
4.1
40
78
4
136
24
26
23
25
2.00
232608167--232608319
39
3.9
39
92
0
252
23
20
32
23
1.98
232608168--232608349
39
4.6
39
89
0
247
23
21
31
23
1.98
232614029--232614189
39
4.1
38
81
9
180
24
22
27
24
2.00
232614029--232614189
79
2.1
78
83
5
200
24
22
27
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
232619401--232619553
39
3.9
39
92
0
252
23
20
32
23
1.98
232619402--232619584
39
4.6
39
89
0
249
23
22
31
22
1.99
232624404--232624509
56
1.9
56
90
0
167
33
26
13
26
1.93
232632021--232632079
28
2.1
28
100
0
118
16
11
25
45
1.82
232633703--232633740
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
232639967--232640035
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
232641660--232641697
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
232647021--232647090
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
232655007--232655076
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
232662966--232663035
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
232668173--232668278
42
2.5
42
96
1
196
30
14
33
21
1.93
232668283--232668415
29
4.6
29
89
6
200
34
14
24
27
1.94
232676226--232676325
42
2.4
42
100
0
200
29
15
35
21
1.93
232676311--232676469
29
5.5
30
88
8
213
33
14
25
27
1.94
232676311--232676469
59
2.8
57
88
5
214
33
14
25
27
1.94
232684291--232684387
40
2.4
42
96
3
180
29
14
35
20
1.92
232684374--232684529
29
5.5
29
84
8
196
33
14
25
27
1.94
232685921--232686021
41
2.5
41
95
1
177
24
21
28
24
1.99
232688715--232688899
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
232688716--232688907
40
4.8
40
79
7
151
24
24
28
22
2.00
232688715--232688932
79
2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00
232696767--232696951
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
232696768--232696959
40
4.8
40
79
7
151
24
24
28
22
2.00
232696767--232696984
79
2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00
232709790--232709970
40
4.6
38
77
10
152
27
22
27
23
1.99
232709788--232709970
77
2.3
81
80
5
196
26
22
27
23
1.99
232717804--232717987
40
4.6
39
76
9
140
26
23
27
22
2.00
232717844--232718032
80
2.4
81
78
4
195
23
23
29
23
1.99
232726128--232726197
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
232728918--232728984
29
2.3
29
86
0
89
26
8
23
40
1.84
232729427--232729557
30
4.4
30
86
1
149
27
47
3
21
1.68
232730052--232730173
25
5.0
25
71
10
74
36
4
2
57
1.31
232730115--232730173
25
2.4
25
85
0
82
35
3
0
61
1.13
232730197--232730255
25
2.5
24
78
10
68
33
8
6
50
1.59
232730213--232730261
25
2.0
25
91
0
80
34
8
6
51
1.57
232730414--232730461
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
232730414--232730465
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
232734012--232734047
12
3.0
12
83
0
54
30
22
2
44
1.67
232742453--232742479
14
1.9
14
100
0
54
14
14
7
62
1.51
232742454--232742486
14
2.4
14
90
5
50
18
18
6
57
1.60
232742541--232742567
14
1.9
14
100
0
54
14
14
7
62
1.51
232742315--232742736
88
4.8
89
95
1
758
26
17
21
34
1.95
232742315--232742736
177
2.4
178
95
1
758
26
17
21
34
1.95
232742706--232742769
33
1.9
33
100
0
128
17
15
23
43
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
232742753--232742779
14
1.9
14
100
0
54
14
14
7
62
1.51
232742616--232742854
122
2.0
123
95
0
435
24
17
21
35
1.95
232742739--232742967
89
2.6
89
92
0
395
24
18
19
37
1.94
232742931--232742978
15
3.3
15
82
5
53
16
12
6
64
1.46
232742842--232743041
103
1.9
103
85
8
271
25
17
18
39
1.92
232742842--232743052
104
2.0
103
83
7
266
24
17
18
40
1.91
232743838--232743972
30
4.5
30
85
1
157
27
46
3
22
1.68
232744484--232744548
25
2.5
26
77
2
78
36
3
0
60
1.13
232744564--232744624
24
2.7
22
84
5
77
32
8
6
52
1.57
232744780--232744827
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
232744780--232744831
8
6.5
8
82
8
61
30
1
1
65
1.14
232746448--232746488
13
3.1
13
89
3
64
51
2
7
39
1.43
232746454--232746491
20
1.9
20
88
0
58
52
5
5
36
1.47
232746448--232746502
27
2.0
27
82
6
67
54
3
7
34
1.46
232750509--232750557
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
232751383--232751549
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
232758516--232758564
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
232759386--232759552
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
232768076--232768293
40
5.4
40
87
3
269
26
23
26
23
2.00
232772271--232772437
40
4.2
40
80
2
167
23
27
23
25
2.00
232780294--232780460
40
4.2
40
80
2
167
23
27
23
25
2.00
232782512--232782668
43
3.6
44
79
9
171
24
17
24
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
232782954--232782989
17
2.1
17
94
0
63
19
5
16
58
1.58
232785209--232785383
46
3.8
45
77
10
183
21
21
28
28
1.99
232785205--232785376
93
1.8
93
91
0
281
20
22
29
27
1.98
232793155--232793205
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
232795275--232795325
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
232797394--232797444
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
232799513--232799563
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
232801632--232801682
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
232803751--232803801
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
232805870--232805920
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
232807988--232808038
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
232810106--232810156
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
232812997--232813132
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
232814581--232814655
26
2.8
26
75
4
69
37
22
10
29
1.88
232827086--232827215
66
2.0
66
85
0
179
31
20
11
36
1.89
232835272--232835489
40
5.5
40
92
2
316
22
24
28
24
1.99
232843364--232843581
40
5.5
40
92
2
316
22
24
28
24
1.99
232851454--232851670
40
5.5
40
91
3
307
22
24
28
24
1.99
232851454--232851670
79
2.7
80
88
4
307
22
24
28
24
1.99
232856466--232856514
21
2.3
21
93
6
82
26
38
18
16
1.91
232865115--232865278
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
232865115--232865312
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
232872689--232872852
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
232872689--232872886
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
232875477--232875525
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
232876347--232876512
40
4.2
39
77
9
158
25
21
27
24
1.99
232883467--232883515
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
232884337--232884503
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
232893892--232894137
40
6.2
40
90
3
365
26
29
21
23
1.99
232893892--232894137
78
3.1
78
91
2
359
26
29
21
23
1.99
232893883--232894137
118
2.2
120
88
3
383
26
29
21
23
1.99
232897044--232897173
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770