Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  595  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
186235942--186236097
68
2.2
68
78
11
156
20
27
16
35
1.94
186238984--186239085
29
3.5
29
98
0
195
25
14
31
28
1.95
186238980--186239143
58
2.8
58
82
6
183
25
15
32
27
1.95
186247075--186247171
29
3.5
29
93
6
159
26
15
31
25
1.96
186253104--186253243
39
3.7
39
85
6
171
26
29
20
23
1.99
186255181--186255262
27
3.0
27
85
7
112
31
21
25
20
1.98
186255149--186255262
55
2.1
55
82
9
135
35
21
23
19
1.96
186255163--186255262
28
3.6
27
83
5
112
32
22
25
21
1.98
186255369--186255458
28
3.2
28
95
3
155
30
7
27
34
1.85
186255705--186255735
15
2.1
15
93
0
53
3
19
29
48
1.64
186256553--186256603
17
2.9
18
74
5
52
62
1
31
3
1.24
186263066--186263179
55
2.1
55
83
6
142
35
21
22
19
1.96
186263080--186263179
28
3.6
27
81
5
103
33
22
24
21
1.98
186263285--186263349
28
2.3
28
94
0
112
30
7
27
33
1.85
186268615--186268691
39
2.0
39
92
0
127
22
22
24
31
1.98
186268619--186268706
39
2.3
39
79
0
104
23
19
27
29
1.98
186271849--186271938
43
2.1
43
80
0
99
34
15
20
30
1.93
186271914--186272089
43
4.1
43
80
2
183
21
14
28
34
1.93
186271930--186272089
86
1.9
86
85
2
223
21
16
28
33
1.95
186273033--186273457
187
2.3
187
91
2
701
35
18
15
31
1.92
186277192--186277325
64
2.1
64
95
0
241
36
13
3
46
1.61
186277205--186277344
64
2.2
64
87
5
194
40
10
3
45
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
186277373--186277443
24
3.0
24
87
0
106
30
16
5
46
1.70
186277617--186277672
15
3.8
15
80
20
73
44
0
1
53
1.11
186277785--186278055
9
30.4
9
83
3
307
47
13
1
37
1.54
186278042--186278163
34
3.4
34
72
16
120
44
13
2
39
1.58
186278094--186278129
9
4.0
9
88
0
54
44
22
0
33
1.53
186278035--186278184
74
2.0
74
98
0
291
43
15
2
38
1.61
186282662--186282845
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
186294445--186294642
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
186294511--186294628
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
186294479--186294642
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
186296219--186296354
65
2.1
66
95
1
247
47
12
14
25
1.79
186313459--186313519
30
2.0
30
87
0
86
37
8
24
29
1.84
186313985--186314236
68
3.9
64
77
10
219
29
16
29
24
1.97
186316587--186316805
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26
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186324147--186324332
29
6.6
29
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220
25
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26
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186324147--186324302
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.7
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23
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1.95
186354150--186354339
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1
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1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
5
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29
19
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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87
22
20
36
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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