Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  30  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8704190--8704268
39
2.0
40
80
11
92
59
3
3
32
1.33
8709283--8709729
220
2.0
220
94
0
788
31
23
17
28
1.97
8716468--8716510
21
2.0
21
90
0
68
58
13
13
13
1.64
8725307--8725354
18
2.7
17
84
9
60
54
2
0
43
1.12
8727231--8727294
2
33.5
2
73
9
53
42
3
1
53
1.26
8727189--8727288
18
5.2
20
75
17
70
37
2
4
57
1.29
8727298--8727332
17
2.0
18
88
5
54
28
2
2
65
1.21
8734601--8734643
13
3.3
13
80
0
50
27
9
9
53
1.63
8739996--8740050
28
2.0
28
88
0
83
41
14
16
27
1.87
8741422--8741532
38
3.0
37
72
18
97
38
1
2
56
1.24
8741482--8741536
20
2.7
20
81
16
67
40
1
1
56
1.21
8741473--8741539
26
2.6
26
79
9
66
37
1
1
59
1.16
8741822--8741859
13
2.8
14
84
4
51
76
0
7
15
1.01
8742915--8743024
45
2.4
45
83
3
141
21
19
18
40
1.91
8743216--8743247
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
8743778--8743821
7
6.0
7
80
19
54
84
0
0
15
0.63
8743781--8743822
6
7.0
6
84
15
52
83
0
0
16
0.65
8743778--8743821
15
2.9
15
90
9
72
84
0
0
15
0.63
8754448--8754520
33
2.1
34
82
9
87
23
28
19
28
1.98
8757116--8757190
33
2.3
32
84
6
98
17
20
41
21
1.90
8769718--8769767
10
5.0
10
79
13
50
66
2
8
24
1.29
8769718--8769757
20
2.0
20
90
9
64
65
2
7
25
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8769787--8770294
252
2.0
252
100
0
1016
28
20
10
39
1.86
8770643--8770687
22
2.0
22
82
0
54
11
11
0
77
0.99
8770676--8770714
20
2.0
20
85
10
53
23
15
0
61
1.33
8770715--8770891
96
1.8
96
92
0
300
31
28
16
24
1.96
8772006--8772103
15
6.3
15
72
23
69
74
1
3
21
1.01
8772001--8772103
30
3.3
29
77
16
107
74
0
2
21
1.00
8772006--8772103
10
11.0
9
76
19
75
74
1
3
21
1.01
8772008--8772103
34
2.7
36
81
10
110
75
1
3
20
1.01
8775815--8775864
10
5.0
10
79
11
50
68
2
8
22
1.26
8776021--8776054
17
1.9
18
88
5
52
20
20
0
58
1.39
8782522--8782556
2
18.0
2
88
5
54
48
2
0
48
1.16
8783562--8783653
24
3.8
24
91
0
130
33
30
14
21
1.93
8785993--8786095
29
3.6
29
92
2
154
26
32
15
26
1.96
8794923--8795007
24
3.5
24
91
0
125
32
29
15
22
1.94
8795459--8795488
2
15.0
2
92
0
51
46
0
3
50
1.18
8802262--8802286
6
4.2
6
100
0
50
32
0
32
36
1.58
8806258--8806333
34
2.2
34
83
2
89
31
23
19
25
1.98
8814549--8814833
49
5.9
48
94
2
459
28
29
9
32
1.88
8818878--8819163
137
2.1
136
94
0
491
32
24
18
24
1.97
8820951--8821086
26
5.2
26
88
5
204
37
24
5
33
1.77
8820951--8821086
52
2.6
52
96
2
247
37
24
5
33
1.77
8845268--8845346
13
6.5
14
69
26
56
49
15
0
35
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8845268--8845346
36
2.2
36
90
0
122
49
15
0
35
1.45
8845304--8845347
23
1.9
23
100
0
88
54
13
0
31
1.39
8845829--8845854
12
2.2
12
100
0
52
7
15
30
46
1.74
8845886--8846085
41
4.9
41
91
4
273
33
24
23
18
1.97
8845886--8846085
81
2.5
79
84
9
260
33
24
23
18
1.97
8845909--8846085
41
4.4
41
93
3
288
33
24
23
18
1.96
8846459--8846508
22
2.3
22
79
3
57
28
2
34
36
1.69
8846683--8846731
22
2.3
21
78
3
53
24
0
28
46
1.53
8848700--8848827
46
2.8
46
90
3
197
19
20
30
29
1.97
8854177--8854458
42
6.6
42
78
2
249
28
15
24
32
1.95
8854176--8854415
85
2.8
84
87
3
320
27
15
25
32
1.95
8854176--8854458
43
6.6
42
77
2
251
28
15
24
32
1.95
8854176--8854457
85
3.3
85
85
3
273
28
15
24
32
1.95
8856512--8856589
38
2.1
38
92
0
129
41
15
12
30
1.85
8863909--8864126
40
5.5
40
91
2
325
23
22
27
25
2.00
8866157--8866288
41
3.3
41
87
3
169
31
16
28
22
1.96
8867809--8867848
18
2.3
17
79
8
53
47
5
2
45
1.38
8870124--8870168
21
2.1
21
84
8
56
37
2
20
40
1.65
8870921--8870974
26
2.1
26
82
3
65
51
3
3
40
1.37
8873051--8873209
79
2.0
79
98
0
309
41
15
10
32
1.81
8874476--8874518
3
14.3
3
100
0
86
32
0
0
67
0.91
8875462--8875501
19
2.2
18
86
4
53
30
0
0
70
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8875462--8875511
18
2.7
18
81
9
57
32
2
0
66
1.03
8876960--8877006
19
2.5
19
79
10
51
36
0
4
59
1.17
8876971--8877006
18
1.9
19
88
5
56
41
0
0
58
0.98
8877003--8877035
12
2.5
13
90
9
50
18
3
0
78
0.87
8877799--8878048
55
4.5
55
81
9
290
27
10
13
49
1.74
8877871--8877963
21
4.5
21
64
15
59
25
7
15
51
1.69
8877807--8878038
116
2.0
116
88
3
342
26
9
13
50
1.72
8878008--8878072
33
2.0
33
90
0
103
29
12
12
46
1.78
8881605--8881655
20
2.6
18
80
17
57
37
17
17
27
1.93
8886541--8886590
21
2.4
22
77
12
61
0
34
0
66
0.92
8886797--8886883
3
30.3
3
68
21
53
63
4
1
31
1.22
8886817--8886883
19
3.5
19
72
25
52
65
4
1
28
1.21
8889113--8889150
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
8889270--8889356
3
30.3
3
69
17
60
63
3
1
32
1.19
8889290--8889356
19
3.5
19
72
25
52
65
4
1
28
1.21
8889270--8889363
40
2.3
40
79
15
97
61
3
1
34
1.19
8890202--8890252
23
2.3
22
83
6
66
41
9
19
29
1.84
8890208--8890251
23
1.9
23
90
0
70
38
9
22
29
1.85
8891439--8891532
41
2.3
41
84
0
125
30
28
23
17
1.97
8902347--8902403
30
1.9
30
88
0
87
33
15
28
22
1.95
8902742--8903155
94
4.4
94
79
6
399
26
21
29
22
1.99
8902739--8903157
141
2.9
142
76
11
399
26
21
29
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8902742--8903155
49
8.7
49
75
9
324
26
21
29
22
1.99
8909895--8910110
39
5.5
39
86
1
263
29
16
25
28
1.97
8909894--8910110
117
1.9
117
89
1
337
29
16
24
28
1.97
8911320--8911381
31
2.0
31
93
0
106
17
9
20
51
1.73
8913766--8914108
94
3.7
93
79
8
342
27
20
30
21
1.98
8913762--8914120
47
7.7
44
73
13
222
27
20
30
21
1.98
8916847--8916876
12
2.6
11
90
10
51
20
0
6
73
1.05
8916858--8916950
30
2.9
32
78
13
86
23
4
12
59
1.52
8922673--8922753
42
1.9
42
97
0
153
38
7
6
48
1.56
8922854--8922934
40
2.0
40
97
0
153
22
14
13
49
1.78
8923549--8923591
22
1.9
23
86
13
63
53
2
0
44
1.13
8923860--8923949
44
2.0
44
100
0
180
25
20
4
50
1.67
8924006--8924063
24
2.4
24
88
5
82
50
0
32
17
1.46
8931401--8931479
39
2.0
40
82
7
99
27
3
3
64
1.28
8945512--8945687
46
3.8
46
76
12
198
20
19
29
30
1.97
8945509--8945680
93
1.8
93
93
0
299
20
20
29
29
1.98
8947518--8947629
50
2.2
50
91
0
179
22
35
23
18
1.96
8949784--8949837
27
2.0
27
100
0
108
51
11
7
29
1.64
8951389--8951489
48
2.1
48
98
0
193
33
12
5
47
1.66
8954909--8954947
3
13.0
3
83
0
51
0
5
58
35
1.20
8959599--8959647
24
2.0
24
92
0
80
46
18
8
26
1.76
8959599--8959655
24
2.4
24
85
5
62
45
19
10
24
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8962710--8962768
18
3.0
20
76
16
61
77
1
0
20
0.85
8962716--8962769
13
4.2
13
81
6
65
81
0
0
18
0.69
8962716--8962769
19
2.8
19
81
10
65
81
0
0
18
0.69
8962732--8962762
7
4.3
7
95
4
53
87
0
0
12
0.55
8962803--8962850
24
2.0
24
95
0
87
35
20
14
29
1.93
8964507--8964541
2
18.0
2
94
5
63
48
0
0
51
1.00
8964887--8965049
87
1.9
86
83
3
211
26
13
22
38
1.91
8966545--8966584
12
3.3
12
85
0
53
30
30
2
37
1.71
8998516--8998631
42
2.6
45
89
10
177
30
18
27
24
1.98
8998519--8998881
49
7.8
48
75
10
238
28
19
27
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770