genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.483.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  483  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
149126600--149126702	29	3.6	27	81	5	98	29	33	16	21	1.95
149136842--149136913	29	2.5	29	86	0	90	30	33	13	22	1.93
149138227--149138267	22	2.0	21	86	13	59	7	14	0	78	0.96
149139192--149139354	39	4.2	41	78	8	130	26	21	26	24	1.99
149147189--149147339	40	3.8	40	80	6	164	26	22	27	23	2.00
149151519--149151640	47	2.6	47	96	0	217	36	13	23	25	1.92
149151619--149151813	54	3.6	54	84	7	252	35	16	25	22	1.95
149156088--149156225	54	2.6	55	86	10	189	34	15	22	28	1.94
149156095--149156227	27	5.0	26	86	4	151	33	16	23	26	1.95
149156576--149156617	14	3.1	14	75	6	50	28	21	26	23	1.99
149156578--149156974	216	1.8	217	80	4	480	24	20	21	33	1.97
149156965--149157072	27	4.0	26	80	10	101	20	21	21	37	1.95
149156965--149157072	54	2.0	53	82	5	128	20	21	21	37	1.95
149157218--149157293	37	2.1	37	82	5	91	21	19	9	50	1.75
149157277--149157311	18	1.9	18	94	0	61	20	14	8	57	1.63
149158551--149158580	15	2.0	15	93	0	51	50	33	13	3	1.58
149166509--149166538	15	2.0	15	93	0	51	50	33	13	3	1.58
149169443--149169593	42	3.6	42	80	8	171	32	15	25	27	1.95
149175197--149175364	40	4.2	40	77	3	151	23	26	23	27	2.00
149183207--149183374	40	4.2	40	79	3	160	23	26	23	27	2.00
149183223--149183372	80	1.9	80	83	8	198	22	26	24	27	1.99
149186891--149186991	28	3.5	28	86	6	114	28	13	27	29	1.95
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
149186920--149186991	29	2.5	28	91	6	110	29	13	27	29	1.95
149192104--149192285	39	4.6	39	84	2	222	24	22	29	23	1.99
149195714--149195776	31	2.0	31	96	0	117	42	6	28	22	1.78
149197901--149198051	40	3.8	40	77	13	141	25	24	27	22	2.00
149197938--149198067	40	3.2	40	80	2	154	23	23	27	24	2.00
149201925--149202096	93	1.8	93	94	0	308	27	30	21	20	1.98
149201917--149202092	46	3.8	46	81	10	214	28	29	21	21	1.98
149204468--149204505	15	2.6	15	87	4	51	55	15	18	10	1.68
149210522--149210665	27	5.4	27	81	4	157	25	18	16	39	1.91
149226571--149226722	40	3.8	40	82	1	144	23	26	24	25	2.00
149227960--149227996	18	2.1	18	90	5	58	0	13	5	81	0.86
149234596--149234763	40	4.2	40	79	4	151	24	27	23	25	2.00
149235992--149236032	17	2.3	18	87	4	57	0	14	4	80	0.87
149240655--149240963	24	12.9	24	96	0	555	20	18	25	35	1.96
149243492--149243606	41	2.8	41	77	12	119	31	26	20	22	1.98
149247376--149247659	119	2.4	120	81	9	348	25	20	26	26	1.99
149247376--149247659	40	7.1	40	88	5	323	25	20	26	26	1.99
149254626--149254888	39	6.7	38	89	5	330	25	21	26	26	1.99
149254626--149254888	79	3.3	79	87	6	372	25	21	26	26	1.99
149254666--149254895	118	1.9	118	86	6	322	26	20	26	26	1.99
149268101--149268141	21	2.0	21	90	0	64	9	4	48	36	1.58
149277271--149277352	29	2.8	29	98	0	155	29	14	30	25	1.95
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
149285167--149285248	29	2.8	29	98	0	155	29	14	30	25	1.95
149290275--149290440	40	4.2	39	81	3	172	24	27	22	25	2.00
149290291--149290440	79	1.9	79	84	5	205	24	27	22	26	2.00
149298262--149298428	40	4.2	40	81	2	176	24	27	22	25	2.00
149298278--149298428	80	1.9	79	83	6	198	23	27	22	25	2.00
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149304019--149304521	49	10.3	49	94	1	751	31	9	29	29	1.88
149304026--149304541	242	2.1	245	89	1	786	31	9	30	29	1.89
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149306536--149306835	40	7.6	40	82	5	270	23	21	28	26	1.99
149306653--149306835	79	2.3	79	91	1	296	24	22	28	25	1.99
149309739--149310293	49	11.3	49	93	0	815	31	9	29	29	1.89
149310362--149310448	37	2.3	36	94	5	147	20	19	33	26	1.97
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149372483--149372874	150	2.6	151	89	1	617	31	24	18	25	1.98
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149374696--149374878	79	2.3	79	80	9	194	25	21	27	25	1.99
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149382674--149382865	40	4.8	40	79	7	151	24	24	28	22	2.00
149382673--149382890	79	2.7	79	79	6	183	24	23	27	24	2.00
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149453736--149454421	85	8.2	85	87	6	844	14	33	34	17	1.90
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149463135--149463834	42	16.5	42	86	5	833	14	32	34	18	1.91
149471680--149471733	24	2.2	24	86	0	72	12	40	31	14	1.84
149471767--149471887	58	2.1	59	92	1	199	30	23	21	23	1.99
149472284--149472361	24	3.2	24	96	0	138	7	41	35	15	1.76
149472548--149473247	85	8.2	85	86	5	861	14	32	34	18	1.91
149472548--149473247	42	16.5	42	86	5	833	14	32	34	18	1.91
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
149481093--149481146	24	2.2	24	86	0	72	12	40	31	14	1.84
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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