Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  128  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37382307--37382340
18
1.9
18
88
5
52
29
17
11
41
1.85
37383374--37383448
28
2.7
28
83
8
98
30
33
13
22
1.92
37387757--37387924
40
4.2
40
77
3
151
23
26
23
27
2.00
37398667--37398826
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
37404570--37404715
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
37404602--37404753
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
37408165--37408264
28
3.5
28
95
1
182
29
16
30
25
1.96
37412269--37412435
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
37413257--37413302
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
37420277--37420443
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
37421264--37421309
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
37423188--37423360
46
3.8
45
75
13
172
22
21
26
29
1.99
37423185--37423355
93
1.8
93
91
0
279
22
21
27
28
1.99
37428729--37428992
46
5.6
48
76
9
179
31
18
26
23
1.98
37428729--37429046
48
6.7
47
77
7
236
30
19
26
23
1.98
37428769--37429048
94
2.9
97
83
4
284
31
19
26
22
1.98
37449452--37449624
43
4.0
43
76
14
185
23
16
27
32
1.96
37453828--37453976
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
37453869--37453976
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
37460253--37460500
40
6.2
40
89
2
367
25
24
28
21
1.99
37460253--37460500
118
2.1
120
88
3
367
25
24
28
21
1.99
37468425--37468634
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37473266--37473456
46
4.2
46
82
0
220
19
23
13
43
1.87
37473476--37473591
45
2.6
45
91
0
187
20
23
17
38
1.93
37476759--37476797
20
2.0
20
85
10
53
48
2
0
48
1.15
37478966--37479024
26
2.3
27
76
8
68
45
10
13
30
1.76
37487509--37487623
58
2.0
58
96
0
212
26
12
32
29
1.92
37491711--37491867
51
3.1
50
91
1
251
28
24
15
31
1.96
37500052--37500106
26
2.1
27
83
10
69
61
1
1
34
1.17
37501658--37501735
29
2.7
29
86
5
106
29
3
15
51
1.61
37501635--37501737
31
3.5
28
79
12
100
32
2
16
48
1.61
37501988--37502060
36
2.0
36
86
0
101
27
8
21
42
1.81
37502006--37502064
18
3.3
18
72
9
57
28
8
20
42
1.81
37504644--37504687
23
1.9
23
90
0
70
36
15
27
20
1.93
37504671--37504727
25
2.2
26
81
3
71
36
22
28
12
1.90
37514154--37514190
18
2.1
18
100
0
74
43
5
10
40
1.63
37514381--37514547
41
4.1
40
80
4
183
36
19
21
22
1.95
37514715--37514759
14
3.2
14
83
0
63
31
0
20
48
1.49
37514720--37514766
7
6.7
7
76
9
51
29
0
23
46
1.52
37514804--37514911
7
15.1
7
66
9
58
22
0
37
39
1.60
37521503--37521545
22
2.0
21
86
4
59
44
0
0
55
0.99
37526908--37527044
40
3.5
40
82
6
152
27
23
27
22
2.00
37534842--37534989
40
3.7
40
85
3
172
26
22
27
22
2.00
37548616--37548710
29
3.3
29
89
1
129
25
14
31
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37550001--37550046
19
2.5
18
79
6
56
32
4
23
39
1.75
37556101--37556419
50
6.6
49
77
9
286
24
27
19
28
1.98
37556157--37556431
95
2.9
98
80
6
284
25
28
18
27
1.98
37556101--37556422
144
2.2
142
82
7
373
24
27
19
28
1.99
37556535--37556569
14
2.5
14
95
0
61
45
17
2
34
1.63
37561862--37561923
29
2.1
29
100
0
124
46
0
24
29
1.53
37563670--37563897
46
5.0
46
90
1
314
39
14
23
21
1.91
37565273--37565297
12
2.1
12
100
0
50
32
40
16
12
1.84
37567586--37567662
40
1.9
40
94
0
136
14
15
33
36
1.88
37569795--37569831
16
2.3
17
81
13
51
37
2
0
59
1.12
37570318--37570365
20
2.3
21
89
3
71
37
35
6
20
1.78
37570380--37570418
20
2.0
20
85
5
53
43
35
5
15
1.69
37570416--37570488
35
2.1
35
86
0
101
50
19
1
28
1.56
37570436--37570490
28
2.0
28
82
7
67
47
23
1
27
1.62
37570422--37570508
35
2.5
34
81
9
95
49
22
2
25
1.62
37570535--37570592
21
2.7
21
75
2
62
50
24
1
24
1.59
37570604--37570641
20
1.9
20
88
0
58
42
39
2
15
1.61
37570601--37570681
34
2.4
33
81
8
83
40
35
3
19
1.70
37573307--37573350
22
2.0
22
91
8
72
65
2
0
31
1.05
37573313--37573352
14
2.8
14
82
17
55
65
2
0
32
1.06
37573302--37573359
8
7.5
8
77
14
59
65
1
1
31
1.13
37573491--37573701
48
4.3
47
75
19
168
55
3
4
35
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37573491--37573682
26
7.8
25
77
17
174
56
3
4
35
1.38
37573495--37573682
74
2.5
71
77
17
179
56
3
4
35
1.38
37573481--37573682
25
8.3
24
73
18
136
55
3
4
35
1.40
37573573--37573682
12
8.8
12
67
17
64
59
3
2
34
1.29
37573802--37573830
15
1.9
15
100
0
58
65
0
0
34
0.93
37573879--37573932
15
3.6
14
78
11
54
61
1
5
31
1.30
37586709--37586735
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
37588879--37588913
2
17.0
2
88
5
52
51
2
0
45
1.16
37588940--37588988
19
2.7
19
84
6
66
48
10
14
26
1.75
37590827--37590890
28
2.3
28
91
5
103
32
29
7
29
1.86
37591016--37591096
27
2.9
28
81
3
83
18
25
20
34
1.96
37591042--37591096
29
1.9
28
85
3
74
21
25
20
32
1.97
37590996--37591110
55
2.1
56
80
11
130
18
24
21
35
1.95
37591538--37591578
18
2.3
18
86
0
55
24
2
4
68
1.22
37597871--37597895
13
1.9
13
100
0
50
40
16
4
40
1.67
37600305--37600329
12
2.1
12
100
0
50
24
24
8
44
1.80
37602042--37602214
46
3.8
45
77
13
172
21
19
28
30
1.98
37602039--37602209
93
1.8
93
89
2
272
21
19
29
29
1.98
37609182--37609295
40
2.8
39
84
2
138
25
28
22
22
1.99
37617179--37617345
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
37617195--37617345
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
37620244--37620282
19
2.1
19
85
0
51
71
7
5
15
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37620721--37620835
55
2.1
56
80
8
128
34
21
24
19
1.96
37620746--37620835
27
3.2
27
81
7
101
32
24
24
18
1.97
37620944--37621005
28
2.2
28
88
0
88
33
8
24
33
1.85
37621252--37621283
8
4.0
8
91
0
55
3
25
25
46
1.67
37622072--37622104
12
2.6
13
85
9
50
45
0
45
9
1.35
37634347--37634393
23
2.1
22
92
4
76
70
0
6
23
1.10
37635101--37635149
26
2.0
24
84
8
62
63
8
0
28
1.23
37636909--37637007
44
2.2
44
83
0
126
30
19
15
35
1.92
37636973--37637202
94
2.4
94
81
4
250
28
18
18
35
1.94
37637075--37637368
137
2.1
139
82
3
344
27
17
19
35
1.94
37637067--37637548
231
2.1
232
87
1
700
28
18
17
36
1.93
37637310--37637505
44
4.3
44
73
11
151
29
15
17
37
1.91
37637212--37637462
94
2.7
94
86
0
340
28
17
19
34
1.95
37642158--37642366
49
4.3
49
90
4
320
29
30
7
32
1.85
37647304--37647460
40
4.0
40
92
5
248
25
26
22
24
2.00
37647304--37647460
78
2.0
80
91
5
257
25
26
22
24
2.00
37652255--37652529
45
6.0
45
87
5
356
26
18
30
24
1.98
37654513--37654538
11
2.4
11
100
0
52
30
30
0
38
1.58
37655822--37655860
21
1.9
19
85
10
51
17
43
12
25
1.85
37658856--37658900
22
2.0
22
100
0
90
46
26
4
22
1.70
37661582--37661632
25
2.0
25
100
0
102
39
7
7
45
1.62
37671083--37671184
43
2.4
42
85
3
132
27
30
23
18
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37672733--37672842
26
4.2
26
91
0
175
33
6
24
35
1.81
37675973--37676003
12
2.6
12
94
0
53
12
25
48
12
1.77
37679282--37679433
40
3.8
40
82
5
164
28
23
25
23
1.99
37679280--37679450
40
4.3
39
76
10
150
28
22
26
23
1.99
37682060--37682227
35
4.6
35
85
7
185
33
23
10
32
1.89
37682055--37682227
75
2.4
73
83
9
210
33
23
10
32
1.89
37686815--37687001
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
37686838--37687001
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
37686838--37687035
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
37694379--37694565
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770