Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  768  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
243853339--243853391
21
2.6
19
77
14
52
66
22
5
5
1.35
243866748--243866905
30
5.5
30
85
9
195
33
13
25
27
1.93
243866777--243866905
57
2.3
55
89
8
188
34
13
25
26
1.93
243873988--243874118
59
2.3
57
93
5
219
34
13
25
26
1.93
243873958--243874118
88
1.8
88
85
5
227
32
13
25
27
1.94
243873988--243874118
29
4.5
29
93
4
212
34
13
25
26
1.93
243876544--243876581
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
243878201--243878269
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
243884510--243884547
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
243887182--243887261
31
2.6
31
94
3
137
23
21
13
41
1.89
243887449--243887590
47
3.0
47
89
6
198
26
22
21
28
1.99
243887449--243887590
24
6.0
24
90
4
200
26
22
21
28
1.99
243887640--243887699
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
243887742--243887789
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
243889017--243889140
26
4.8
26
82
13
150
41
6
22
29
1.79
243889017--243889140
50
2.4
53
81
12
161
41
6
22
29
1.79
243889194--243889260
26
2.5
26
85
7
82
31
7
20
40
1.80
243892011--243892092
30
2.7
30
92
7
130
24
20
12
42
1.86
243892278--243892419
24
6.0
24
90
5
200
26
21
22
28
1.99
243892278--243892418
46
3.0
48
88
7
198
26
21
22
28
1.99
243892277--243892419
70
2.0
72
87
5
211
26
21
22
29
1.99
243892470--243892529
20
3.0
20
90
0
102
33
20
11
35
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
243892572--243892619
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
243893843--243893972
27
4.9
27
92
0
190
40
7
21
30
1.81
243893994--243894115
26
4.7
26
86
7
167
31
7
20
40
1.80
243893995--243894115
51
2.3
53
87
4
183
30
7
20
41
1.80
243897934--243897997
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
243898188--243898328
24
6.0
24
89
6
191
26
22
21
29
1.99
243898188--243898327
46
3.0
47
88
6
185
27
22
21
28
1.99
243898187--243898328
70
2.0
71
86
6
200
26
22
21
29
1.99
243908556--243908626
25
2.8
26
83
12
110
36
21
18
23
1.95
243908556--243908645
26
3.5
27
83
8
116
35
21
20
23
1.96
243909345--243909498
77
2.0
80
89
8
246
25
3
12
59
1.48
243917609--243917733
40
3.2
39
78
8
130
21
25
24
28
1.99
243917548--243917733
80
2.3
79
78
13
193
23
27
23
25
2.00
243924300--243924332
15
2.1
16
94
5
59
24
15
18
42
1.88
243927418--243927577
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
243942348--243942455
26
4.2
26
92
0
180
32
7
25
35
1.84
243956818--243956919
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
243962764--243962808
20
2.2
20
100
0
90
20
22
28
28
1.98
243972901--243973009
40
2.8
40
83
9
134
23
24
28
22
2.00
243976719--243976968
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
243986063--243986306
40
6.2
40
87
4
329
26
29
21
23
1.99
243986063--243986306
116
2.1
120
90
5
383
26
29
21
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
243997432--243997459
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
243997849--243997881
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
243999656--243999694
4
9.5
4
84
15
53
20
0
2
76
0.90
243999646--243999695
21
2.4
21
90
6
75
18
0
6
76
0.99
243999656--243999701
11
4.2
11
83
8
58
19
0
4
76
0.96
244002437--244002486
22
2.3
22
89
3
75
38
16
20
26
1.92
244005890--244006021
29
4.6
29
84
1
149
25
31
16
26
1.97
244011540--244011584
23
2.0
23
100
0
90
28
22
8
40
1.84
244015697--244015908
40
5.3
40
82
2
212
24
26
22
26
2.00
244015697--244015908
80
2.7
80
82
2
248
24
26
22
26
2.00
244025184--244025332
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
244025225--244025332
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
244034736--244034787
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
244034826--244034884
27
2.3
26
82
5
66
22
22
20
35
1.96
244038222--244038273
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
244038312--244038371
27
2.3
27
85
2
77
21
23
20
35
1.96
244044821--244044869
24
2.0
24
96
0
89
36
36
2
24
1.67
244047135--244047301
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
244052977--244053015
18
2.1
18
85
4
51
25
35
15
23
1.94
244054621--244054658
10
3.7
10
86
6
58
76
7
5
10
1.15
244054620--244054659
11
3.7
11
86
6
64
77
7
5
10
1.11
244063651--244063860
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
244072701--244072839
46
2.8
49
77
12
169
20
20
30
28
1.98
244075706--244075770
15
4.3
15
74
16
55
10
15
13
60
1.60
244075874--244075917
17
2.9
14
78
18
52
20
0
27
52
1.47
244075880--244075914
17
2.1
17
100
0
70
22
0
28
48
1.51
244078158--244078291
46
2.9
48
80
12
179
20
20
29
28
1.98
244081104--244081163
21
3.0
20
80
4
75
21
25
23
30
1.99
244085460--244085497
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
244085766--244085935
45
3.7
47
87
9
235
28
28
20
22
1.99
244085714--244085932
46
4.8
45
83
12
218
29
28
20
22
1.98
244085766--244085935
93
1.8
90
86
10
245
28
28
20
22
1.99
244091200--244091383
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
244091240--244091428
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
244096917--244097100
40
4.7
40
86
6
234
25
27
22
25
2.00
244096917--244097099
78
2.3
80
82
9
214
25
27
22
25
2.00
244101473--244101574
29
3.5
29
83
2
125
25
16
33
24
1.96
244101562--244101662
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
244110353--244110525
46
3.8
46
79
14
214
28
29
21
20
1.98
244110361--244110529
91
1.8
92
94
2
304
27
29
21
20
1.98
244112898--244112974
15
5.4
15
73
14
65
57
14
18
10
1.65
244115897--244116067
93
1.8
93
96
0
315
27
29
22
20
1.98
244115889--244116069
46
3.9
46
81
9
233
27
29
21
20
1.98
244119603--244119665
21
3.1
19
78
14
63
23
33
28
14
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
244121259--244121305
24
2.0
23
83
4
58
59
8
0
31
1.27
244125201--244125233
12
2.8
12
95
0
57
3
9
0
87
0.63
244125178--244125233
24
2.3
24
78
9
60
3
7
7
82
0.95
244125178--244125239
12
5.2
11
75
11
52
3
8
6
82
0.94
244125611--244125646
13
2.8
13
91
0
63
22
41
25
11
1.86
244125928--244125974
20
2.3
21
85
10
62
21
38
23
17
1.93
244125970--244126071
40
2.6
41
95
4
183
17
33
20
28
1.96
244127607--244127686
25
3.0
26
77
15
83
30
13
22
33
1.93
244135446--244135515
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
244137918--244137980
30
2.1
31
90
3
101
23
23
15
36
1.94
244138172--244138332
22
7.0
22
88
9
218
27
22
21
28
1.99
244138172--244138333
46
3.5
46
88
9
226
27
22
21
29
1.99
244138172--244138332
68
2.3
68
89
8
238
27
22
21
28
1.99
244138379--244138462
20
4.2
20
95
0
150
32
21
11
34
1.90
244138384--244138458
11
7.4
11
68
17
63
30
20
13
36
1.91
244138504--244138550
24
1.9
25
86
4
69
25
14
25
34
1.94
244139694--244139782
25
3.4
27
82
13
98
21
24
21
32
1.98
244139704--244139785
25
3.1
27
84
10
107
20
25
20
32
1.97
244139846--244139952
27
3.9
27
74
16
85
31
8
18
41
1.81
244139895--244140055
27
6.1
27
79
11
167
29
6
21
42
1.77
244139908--244140069
52
3.1
51
81
10
168
29
6
22
41
1.78
244140048--244140311
27
9.8
27
81
11
256
40
7
22
29
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
244140142--244140214
34
2.1
34
87
5
103
39
5
28
26
1.78
244140093--244140268
87
2.1
84
84
5
228
42
6
22
27
1.79
244143134--244143197
31
2.1
31
90
0
101
25
23
15
35
1.94
244143386--244143565
22
8.0
22
87
10
235
27
22
21
28
1.99
244143408--244143565
63
2.4
66
86
12
234
28
21
21
28
1.99
244143612--244143655
20
2.2
20
95
0
79
31
22
11
34
1.90
244143618--244143662
20
2.2
20
92
0
72
31
22
13
33
1.92
244143697--244143743
24
1.9
25
86
4
69
25
14
25
34
1.94
244147281--244147410
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
244147281--244147444
40
4.1
40
78
4
145
21
28
25
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770