Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  741  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
234842384--234842570
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
234842407--234842570
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
234842407--234842604
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
234850222--234850382
69
2.3
70
97
1
306
33
18
29
19
1.95
234852755--234852833
15
5.4
15
79
8
83
10
17
13
58
1.63
234852746--234852832
30
3.0
30
80
9
90
10
17
16
56
1.67
234855216--234855391
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
234855212--234855383
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
234863201--234863303
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
234866041--234866142
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
234867688--234867750
31
2.0
32
93
6
112
20
20
25
33
1.97
234872022--234872198
40
4.5
40
83
4
180
23
25
22
28
1.99
234879923--234880100
40
4.5
40
80
4
175
23
25
22
28
1.99
234881769--234881853
37
2.3
37
95
0
152
24
20
34
21
1.97
234886390--234886563
39
4.5
40
76
9
164
24
28
21
26
1.99
234894348--234894532
39
4.7
40
82
9
229
24
28
21
25
1.99
234894348--234894531
38
4.7
38
82
10
221
25
28
21
25
1.99
234903189--234903308
38
3.1
40
88
7
169
25
27
20
26
1.99
234905969--234906119
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
22
2.00
234906006--234906135
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
234913347--234913475
29
4.6
29
85
5
156
28
15
31
24
1.96
234913348--234913475
57
2.3
56
83
4
159
28
15
31
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
234921295--234921395
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
234921324--234921399
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
234926287--234926806
273
1.9
275
88
1
792
43
6
8
41
1.61
234926811--234926958
76
2.0
75
86
6
210
32
10
9
47
1.71
234930169--234930224
15
3.7
15
79
15
71
10
14
12
62
1.55
234935000--234935169
40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
234943964--234944251
131
2.2
130
85
3
364
27
19
19
34
1.96
234944992--234945045
26
2.1
26
96
0
99
29
18
16
35
1.93
234945533--234945578
23
2.0
24
91
4
76
45
13
6
34
1.69
234946990--234947033
22
2.0
22
86
8
63
43
0
4
52
1.22
234949300--234949364
32
2.0
32
96
0
121
32
6
23
38
1.79
234951150--234951436
137
2.1
137
98
0
547
25
19
24
31
1.98
234954052--234954166
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
234954052--234954166
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
234955773--234955882
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
234958719--234958748
11
2.9
10
90
9
51
56
10
10
23
1.62
234959823--234959937
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
234959823--234959937
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
234961551--234961658
25
4.2
26
95
2
184
37
24
4
34
1.76
234961551--234961658
51
2.1
51
93
3
182
37
24
4
34
1.76
234962109--234962142
12
2.8
12
86
0
50
0
14
0
85
0.60
234965146--234965377
39
5.9
39
87
1
304
22
21
33
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
234965146--234965338
78
2.5
78
96
1
352
23
21
33
21
1.97
234971834--234972083
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
234980010--234980219
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
234983498--234983549
26
2.0
27
92
3
88
17
15
30
36
1.91
234984422--234984492
35
2.0
35
100
0
142
16
47
11
23
1.79
234984894--234984961
15
4.6
14
67
25
50
61
19
5
13
1.51
234984891--234984963
32
2.3
32
83
4
94
64
17
5
12
1.45
234985222--234985270
11
4.5
11
82
12
57
0
55
0
44
0.99
234985792--234985844
17
3.2
17
82
12
65
41
0
5
52
1.25
234985792--234985875
31
2.8
30
83
7
91
36
3
7
52
1.46
234985787--234985844
2
30.0
2
82
6
66
41
0
6
51
1.28
234986008--234986042
2
17.5
2
87
0
52
45
2
2
48
1.32
234998132--234998635
70
7.2
70
98
1
967
32
16
20
30
1.94
234998132--234998635
211
2.4
210
97
1
967
32
16
20
30
1.94
234998686--234998840
54
3.0
52
81
11
194
29
16
18
34
1.93
234999547--234999652
35
3.0
35
95
0
194
16
49
12
22
1.78
235000053--235000126
32
2.4
30
82
12
96
62
18
6
12
1.51
235000091--235000123
13
2.4
14
95
5
59
60
15
6
18
1.54
235000946--235000997
22
2.3
23
90
6
88
38
0
7
53
1.30
235000943--235000997
2
29.0
2
78
10
53
40
0
7
52
1.29
235001159--235001193
2
17.5
2
87
0
52
45
2
2
48
1.32
235005659--235005988
49
6.9
49
92
4
541
34
9
27
28
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
235005665--235005988
96
3.4
96
95
2
564
33
9
28
28
1.88
235005658--235006038
145
2.6
141
87
6
419
34
8
27
29
1.87
235005980--235006129
48
3.2
48
96
1
268
34
6
28
32
1.81
235006169--235006259
37
2.4
37
96
1
164
23
18
32
25
1.97
235008807--235008843
17
2.1
18
95
5
67
29
18
18
32
1.96
235009071--235009282
40
5.3
40
82
2
212
24
26
22
26
2.00
235009071--235009282
80
2.7
80
82
2
248
24
26
22
26
2.00
235017091--235017302
40
5.3
40
82
2
212
24
26
22
26
2.00
235017091--235017302
80
2.7
80
82
2
248
24
26
22
26
2.00
235019972--235020132
24
6.8
24
94
4
258
36
27
17
18
1.94
235019972--235020132
47
3.4
47
92
5
247
36
27
17
18
1.94
235019972--235020130
71
2.2
70
93
4
266
35
28
17
18
1.93
235026035--235026060
13
2.0
13
100
0
52
0
38
23
38
1.55
235027985--235028049
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
235036015--235036079
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
235041019--235041215
50
3.9
50
84
1
243
28
26
18
25
1.98
235041032--235041215
101
1.8
99
87
2
269
29
27
17
25
1.98
235049081--235049150
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
235053715--235053898
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
235053755--235053943
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
235055189--235055519
166
2.0
167
98
0
646
23
20
27
28
1.99
235059409--235059591
40
4.6
39
75
7
138
26
23
27
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
235063374--235063556
79
2.3
81
84
7
232
25
27
22
24
2.00
235063353--235063556
40
5.1
40
82
8
238
25
27
22
24
2.00
235071444--235071623
78
2.3
80
83
6
224
25
28
22
24
1.99
235071423--235071625
40
5.1
40
82
7
236
25
28
22
24
1.99
235074554--235074707
40
3.8
40
85
0
173
22
26
22
27
1.99
235074554--235074707
80
1.9
80
86
0
218
22
26
22
27
1.99
235083024--235083233
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
235091158--235091367
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
235098632--235098732
28
3.5
29
86
6
125
29
26
13
29
1.94
235102631--235102748
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
235102599--235102762
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
235108414--235108461
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
235108579--235108721
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
235108579--235108721
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
235108579--235108722
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
235108913--235108950
20
1.9
20
100
0
76
28
26
26
18
1.98
235108932--235108996
31
2.1
31
97
0
121
40
15
21
23
1.91
235114974--235115021
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
235115069--235115122
11
5.4
11
70
20
55
37
11
20
31
1.88
235115064--235115122
19
3.0
20
95
5
111
35
10
20
33
1.86
235115172--235115314
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
235115172--235115314
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
235115172--235115315
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
235115506--235115595
31
3.1
31
90
7
136
38
16
22
22
1.93
235116696--235116795
27
3.7
28
82
6
107
42
20
8
30
1.80
235116696--235116802
54
2.0
54
81
3
126
40
20
8
30
1.82
235116791--235117048
54
4.8
54
87
0
327
28
22
8
40
1.82
235116791--235117050
81
3.2
81
87
2
342
29
22
8
40
1.82
235116791--235117048
27
9.6
27
85
2
295
28
22
8
40
1.82
235116845--235117124
27
10.3
27
79
8
113
32
19
8
39
1.83
235117180--235117240
26
2.4
25
86
8
86
36
18
27
18
1.94
235117208--235117272
32
2.0
33
91
8
107
33
18
26
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770