Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  547  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
170090507--170090656
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
170090531--170090714
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
170090847--170090890
20
2.2
20
100
0
88
29
4
27
38
1.76
170094952--170095101
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
170094976--170095159
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
170099393--170099542
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
170099417--170099600
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
170107431--170107606
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
170107428--170107599
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
170115006--170115181
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
170115003--170115174
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
170119514--170119685
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
170119506--170119681
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
170122061--170122149
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
170122061--170122140
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
170122072--170122149
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
170125063--170125234
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
170125055--170125230
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
170130097--170130185
38
2.3
38
75
7
90
35
25
19
19
1.95
170130161--170130202
22
1.9
22
100
0
84
40
21
14
23
1.90
170130119--170130194
38
2.0
38
84
0
98
32
23
21
22
1.98
170130166--170130213
22
2.2
22
84
0
60
41
22
16
18
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
170130127--170130242
60
1.9
60
89
3
180
36
24
18
20
1.95
170130183--170130279
38
2.6
38
84
0
122
36
27
17
18
1.94
170130097--170130279
98
1.9
98
85
0
258
36
26
18
19
1.94
170133297--170133329
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
170136232--170136316
6
15.6
5
75
18
57
75
1
5
17
1.07
170136252--170136326
6
12.5
6
81
7
73
76
1
5
17
1.05
170136232--170136316
12
7.3
11
75
10
64
75
1
5
17
1.07
170136242--170136326
17
4.8
17
82
10
73
74
1
5
18
1.09
170136232--170136316
24
3.6
22
82
7
89
75
1
5
17
1.07
170141620--170141652
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
170146723--170146853
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
170146722--170146853
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
170154678--170154808
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
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Percent
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Period
Size
Copy
Number
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Copy
Number
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Copy
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23
28
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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