genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.322.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  322  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
98579918--98580182	53	5.1	53	80	12	289	17	19	22	40	1.91
98579918--98580178	101	2.5	101	83	10	282	17	19	22	40	1.91
98579918--98580182	27	10.1	26	80	12	276	17	19	22	40	1.91
98587334--98587372	13	3.0	13	92	0	60	51	20	0	28	1.48
98589420--98589458	21	1.9	20	89	5	60	46	23	2	28	1.65
98590365--98590432	33	2.1	33	100	0	136	22	11	11	54	1.69
98590365--98590419	19	3.2	19	65	24	57	23	12	10	52	1.71
98597853--98598025	82	2.1	82	89	0	256	38	18	24	17	1.92
98607280--98607386	27	4.0	27	84	4	128	38	19	10	31	1.85
98607375--98607693	27	11.8	27	85	0	404	28	21	8	41	1.83
98607321--98607585	81	3.3	81	83	2	210	29	22	9	38	1.86
98607375--98607693	54	5.9	54	90	0	458	28	21	8	41	1.83
98607672--98607784	27	4.2	27	81	8	106	43	22	6	28	1.77
98607672--98607785	54	2.1	54	80	6	124	42	22	6	28	1.77
98607686--98607812	54	2.4	54	81	6	141	44	19	8	27	1.80
98607711--98607830	27	4.4	27	83	4	109	40	18	13	27	1.88
98608448--98608506	28	2.1	28	100	0	118	45	25	11	16	1.82
98611608--98611697	27	3.3	27	85	3	119	40	17	10	32	1.83
98611608--98611713	54	2.0	53	81	9	126	38	19	10	31	1.86
98611703--98611964	27	9.8	27	83	1	287	29	20	8	41	1.81
98611703--98611964	54	4.9	54	86	2	334	29	20	8	41	1.81
98611703--98611963	80	3.3	80	85	4	321	29	20	8	42	1.81
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
98611943--98612028	27	3.2	27	86	6	86	41	24	5	27	1.78
98611710--98611991	134	2.1	134	84	3	345	30	19	7	41	1.80
98611957--98612083	54	2.4	53	79	11	141	43	19	9	27	1.82
98611957--98612055	27	3.7	27	87	5	121	45	20	7	27	1.76
98611982--98612101	27	4.4	27	83	4	109	40	18	13	27	1.88
98612720--98612778	28	2.1	28	100	0	118	45	25	11	16	1.82
98615882--98615971	27	3.3	27	85	3	119	40	17	10	32	1.83
98615882--98615988	54	2.0	54	81	7	128	38	20	10	30	1.86
98615977--98616295	27	11.8	27	86	0	341	28	22	8	40	1.83
98615923--98616213	81	3.6	81	84	0	215	29	23	9	37	1.86
98615977--98616295	81	4.0	80	88	2	422	28	22	8	40	1.83
98616274--98616359	27	3.2	27	86	6	86	41	24	5	27	1.78
98615977--98616295	54	5.9	54	90	0	458	28	22	8	40	1.83
98616288--98616414	54	2.4	53	79	11	141	43	19	9	27	1.82
98616288--98616386	27	3.7	27	87	5	121	45	20	7	27	1.76
98616313--98616432	27	4.4	27	83	4	109	40	18	13	27	1.88
98617051--98617119	28	2.5	28	95	2	122	43	27	10	18	1.82
98621095--98621341	55	4.7	53	77	8	184	34	18	24	22	1.96
98621547--98621577	16	1.9	16	93	0	53	41	0	22	35	1.54
98623563--98623655	43	2.2	44	92	3	154	51	13	6	27	1.66
98623677--98623716	19	2.2	18	90	4	62	42	17	2	37	1.63
98628264--98628356	43	2.2	44	92	3	154	51	13	6	27	1.66
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
98628378--98628417	19	2.2	18	90	4	62	42	17	2	37	1.63
98633610--98633662	4	13.2	4	79	0	61	43	0	22	33	1.54
98633610--98633662	20	2.7	20	96	0	97	43	0	22	33	1.54
98635299--98635440	73	2.0	72	80	4	160	28	25	23	22	1.99
98643194--98643408	40	5.5	40	87	5	280	25	28	23	22	1.99
98643194--98643408	78	2.8	77	86	5	274	25	28	23	22	1.99
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98646694--98646799	43	2.5	42	83	4	124	25	19	25	29	1.99
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98649245--98649326	27	3.0	27	80	8	103	29	13	23	34	1.93
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98657173--98657254	27	3.0	27	80	8	103	29	13	23	34	1.93
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98666661--98666840	40	4.5	40	85	3	211	25	26	22	25	2.00
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Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
98839543--98839607	31	2.0	31	82	14	78	33	16	24	24	1.96
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98851173--98851246	29	2.6	29	95	0	139	27	31	14	27	1.95
98851114--98851246	58	2.3	58	80	2	133	24	33	17	24	1.96
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98856446--98856656	80	2.7	80	88	2	311	23	21	27	27	1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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