Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  745  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236109793--236109823
2
15.5
2
93
0
53
48
0
3
48
1.17
236109845--236109898
24
2.2
25
78
15
60
59
7
5
27
1.47
236110382--236110444
19
3.4
19
68
18
60
3
6
15
74
1.15
236110375--236110454
36
2.3
34
87
10
124
3
6
12
77
1.09
236111100--236111294
90
2.2
87
78
10
214
37
17
18
25
1.93
236111208--236111581
74
4.9
74
85
5
462
30
21
17
30
1.96
236111209--236111581
151
2.5
151
87
5
504
30
21
17
30
1.96
236111658--236111799
72
2.0
73
95
1
259
33
16
16
33
1.92
236111723--236111872
83
1.8
81
85
7
214
33
18
16
31
1.94
236111849--236111954
54
1.9
55
84
5
144
38
18
14
28
1.90
236111934--236111967
13
2.5
13
90
4
50
58
5
11
23
1.55
236111805--236112291
140
3.5
140
96
2
879
37
20
17
25
1.94
236112224--236112389
72
2.3
71
88
4
244
41
21
15
22
1.89
236125942--236125997
16
3.5
16
73
7
60
3
5
12
78
1.05
236133051--236133260
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
236136037--236136202
40
4.2
40
78
8
160
26
22
27
24
2.00
236136077--236136186
39
2.8
40
82
10
136
23
23
29
23
1.99
236143981--236144146
40
4.2
40
78
7
160
26
22
26
24
2.00
236148403--236148505
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
236153402--236153568
35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
236153397--236153568
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
236160900--236161066
35
4.6
35
85
7
201
33
24
10
31
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236160895--236161066
75
2.4
73
84
8
226
33
23
11
31
1.90
236185670--236185742
33
2.3
30
80
11
83
56
2
5
35
1.37
236185888--236185919
14
2.1
16
88
11
50
65
0
6
28
1.16
236185957--236186200
3
78.0
3
74
15
142
60
5
2
30
1.34
236186797--236186838
12
3.6
12
93
6
77
14
0
7
78
0.95
236186798--236186837
11
3.5
11
96
3
71
15
0
7
77
0.98
236187214--236187282
35
2.0
35
94
0
120
21
10
49
18
1.77
236188011--236188207
53
3.5
53
71
18
184
36
22
14
25
1.93
236187898--236188277
115
3.3
115
95
1
654
36
23
14
26
1.93
236188356--236188384
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
236200779--236200846
33
2.2
30
84
7
82
52
2
5
38
1.41
236201062--236201307
3
79.3
3
72
17
125
60
5
2
31
1.34
236201777--236201811
11
3.1
12
88
12
56
48
0
51
0
1.00
236201908--236201949
11
3.5
11
90
9
57
14
0
7
78
0.95
236201905--236201949
14
3.4
14
82
17
69
13
0
6
80
0.91
236205552--236205576
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
236206934--236207142
49
4.3
49
90
3
309
32
7
30
29
1.85
236209469--236209605
33
4.2
32
78
7
134
24
8
32
35
1.85
236209487--236209605
16
7.2
16
70
4
85
23
7
32
36
1.83
236211197--236211380
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
236219175--236219275
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
236219175--236219352
40
4.5
40
82
3
180
28
22
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236224116--236224251
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
236225788--236225830
21
2.1
20
87
12
61
18
11
20
48
1.79
236226023--236226306
135
2.1
136
93
2
482
24
17
25
32
1.97
236227164--236240290
535
24.4
540
88
6
18919
33
10
18
36
1.86
236234653--236234983
166
2.0
166
98
1
646
44
6
16
32
1.74
236243276--236243341
34
2.0
33
96
3
123
42
9
27
21
1.83
236244074--236244111
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
236250360--236250428
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
236255413--236255580
40
4.2
40
79
1
158
22
27
23
26
2.00
236255429--236255578
80
1.9
80
84
5
205
21
27
24
26
1.99
236261614--236261716
29
3.6
29
95
0
179
30
24
14
31
1.95
236263316--236263507
39
4.9
39
93
0
321
23
29
20
26
1.99
236271362--236271514
39
3.9
39
90
0
225
24
30
20
24
1.99
236271331--236271513
78
2.3
79
90
1
278
23
29
22
24
1.99
236276141--236276348
40
5.2
40
86
0
236
25
22
26
25
2.00
236276143--236276348
80
2.6
80
85
1
261
25
22
26
25
2.00
236280520--236280574
25
2.3
23
78
12
58
43
3
16
36
1.65
236280626--236280840
25
8.7
25
69
16
101
56
4
6
32
1.44
236280717--236280846
23
5.5
23
69
20
74
55
3
5
36
1.38
236280708--236280829
50
2.4
50
77
5
131
54
3
5
36
1.40
236281319--236281445
30
4.3
30
89
2
193
19
5
48
25
1.70
236282058--236282666
87
6.8
89
78
10
412
37
17
16
28
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236282218--236282556
93
3.7
91
83
8
325
36
17
17
28
1.93
236282128--236282666
92
5.9
92
79
9
402
37
17
17
28
1.92
236282468--236282500
14
2.4
14
94
0
57
63
6
12
18
1.48
236282312--236282643
183
1.8
178
83
7
436
35
18
18
27
1.94
236282572--236283313
73
10.1
73
83
7
905
32
20
16
30
1.94
236282572--236283314
293
2.5
293
89
3
1068
32
20
16
30
1.94
236282572--236283309
221
3.4
219
89
3
1042
32
20
15
30
1.94
236283325--236283627
99
3.0
99
87
4
405
41
17
16
24
1.89
236283510--236283683
89
2.0
86
86
3
240
37
19
17
25
1.93
236283531--236283712
89
2.0
89
82
10
221
37
19
16
26
1.92
236295669--236295723
25
2.3
23
78
12
58
43
3
16
36
1.65
236295779--236295853
22
3.3
22
75
10
69
60
5
5
29
1.41
236295785--236295933
25
5.9
25
71
12
106
57
4
7
30
1.46
236295969--236296006
18
2.1
19
85
5
51
68
2
0
28
1.03
236296276--236296314
16
2.4
16
86
0
51
43
28
5
23
1.75
236296471--236296539
31
2.3
31
92
2
113
17
5
52
24
1.66
236296848--236296887
3
13.3
3
100
0
80
0
32
0
67
0.91
236300057--236300217
29
5.6
29
87
1
207
26
32
16
25
1.96
236302373--236302595
40
5.6
39
88
5
281
25
21
26
26
1.99
236302373--236302595
79
2.8
78
83
7
290
25
21
26
26
1.99
236302386--236302628
79
3.1
76
81
10
267
26
20
26
25
1.99
236310626--236310811
40
4.7
40
88
5
252
24
21
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236310679--236310834
80
2.0
79
86
6
217
26
20
26
26
1.99
236314569--236314903
93
3.6
92
82
6
338
33
10
28
27
1.89
236314569--236314807
46
5.1
47
90
3
349
32
11
29
26
1.91
236314785--236314961
98
1.8
96
92
4
302
36
7
26
29
1.84
236314777--236314961
48
3.8
48
89
7
293
35
7
26
30
1.83
236315107--236315218
36
3.1
36
89
2
152
25
16
30
28
1.96
236321898--236321981
34
2.5
34
82
3
89
27
25
21
26
1.99
236326001--236326054
27
2.0
27
85
0
72
38
14
7
38
1.75
236328818--236328988
93
1.8
93
96
0
315
27
29
22
20
1.98
236328810--236328990
46
3.9
46
81
9
233
27
29
21
20
1.98
236331338--236331425
29
3.0
29
80
8
97
56
15
17
10
1.66
236331338--236331416
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
236331349--236331425
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
236334306--236334477
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
236334298--236334473
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
236337495--236337572
15
5.4
15
77
13
83
58
14
16
10
1.62
236337506--236337581
15
5.2
15
75
15
70
56
15
15
11
1.67
236340483--236340654
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
236340475--236340650
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
236347425--236347568
40
3.6
40
80
1
155
27
20
26
25
1.99
236349426--236349525
40
2.5
40
80
3
103
26
30
22
22
1.99
236350286--236350321
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
236356411--236356511
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
236356440--236356515
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
236364317--236364388
29
2.5
28
86
6
92
30
15
26
27
1.96
236377535--236377680
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
236377567--236377718
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
236385658--236385840
40
4.6
40
83
3
181
23
26
22
27
1.99
236390214--236390510
49
6.1
49
95
0
524
33
10
27
28
1.90
236390212--236390510
146
2.0
147
97
0
564
33
10
27
28
1.90
236390592--236390664
37
2.0
37
97
0
137
21
21
32
23
1.98
236392893--236392917
13
1.9
13
100
0
50
28
32
16
24
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770